Protein–RNA interactions for Protein: C9JSJ3

BHMG1, Basic helix-loop-helix and HMG box domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMG1C9JSJ3 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
BHMG1C9JSJ3 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BHMG1C9JSJ3 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BHMG1C9JSJ3 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BHMG1C9JSJ3 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BHMG1C9JSJ3 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
BHMG1C9JSJ3 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BHMG1C9JSJ3 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BHMG1C9JSJ3 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BHMG1C9JSJ3 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BHMG1C9JSJ3 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BHMG1C9JSJ3 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
BHMG1C9JSJ3 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BHMG1C9JSJ3 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BHMG1C9JSJ3 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BHMG1C9JSJ3 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BHMG1C9JSJ3 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BHMG1C9JSJ3 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BHMG1C9JSJ3 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BHMG1C9JSJ3 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BHMG1C9JSJ3 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BHMG1C9JSJ3 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BHMG1C9JSJ3 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BHMG1C9JSJ3 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BHMG1C9JSJ3 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BHMG1C9JSJ3 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BHMG1C9JSJ3 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BHMG1C9JSJ3 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BHMG1C9JSJ3 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BHMG1C9JSJ3 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BHMG1C9JSJ3 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BHMG1C9JSJ3 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BHMG1C9JSJ3 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BHMG1C9JSJ3 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BHMG1C9JSJ3 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BHMG1C9JSJ3 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
BHMG1C9JSJ3 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BHMG1C9JSJ3 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BHMG1C9JSJ3 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BHMG1C9JSJ3 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BHMG1C9JSJ3 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BHMG1C9JSJ3 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BHMG1C9JSJ3 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BHMG1C9JSJ3 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BHMG1C9JSJ3 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BHMG1C9JSJ3 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BHMG1C9JSJ3 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BHMG1C9JSJ3 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
BHMG1C9JSJ3 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
BHMG1C9JSJ3 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
BHMG1C9JSJ3 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
BHMG1C9JSJ3 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BHMG1C9JSJ3 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BHMG1C9JSJ3 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BHMG1C9JSJ3 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BHMG1C9JSJ3 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BHMG1C9JSJ3 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BHMG1C9JSJ3 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
BHMG1C9JSJ3 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BHMG1C9JSJ3 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BHMG1C9JSJ3 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BHMG1C9JSJ3 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BHMG1C9JSJ3 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BHMG1C9JSJ3 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BHMG1C9JSJ3 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BHMG1C9JSJ3 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BHMG1C9JSJ3 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
BHMG1C9JSJ3 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BHMG1C9JSJ3 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BHMG1C9JSJ3 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BHMG1C9JSJ3 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BHMG1C9JSJ3 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BHMG1C9JSJ3 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BHMG1C9JSJ3 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BHMG1C9JSJ3 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BHMG1C9JSJ3 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BHMG1C9JSJ3 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BHMG1C9JSJ3 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BHMG1C9JSJ3 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BHMG1C9JSJ3 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BHMG1C9JSJ3 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BHMG1C9JSJ3 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BHMG1C9JSJ3 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BHMG1C9JSJ3 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BHMG1C9JSJ3 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BHMG1C9JSJ3 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BHMG1C9JSJ3 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BHMG1C9JSJ3 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BHMG1C9JSJ3 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BHMG1C9JSJ3 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BHMG1C9JSJ3 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BHMG1C9JSJ3 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BHMG1C9JSJ3 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BHMG1C9JSJ3 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BHMG1C9JSJ3 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BHMG1C9JSJ3 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BHMG1C9JSJ3 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BHMG1C9JSJ3 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BHMG1C9JSJ3 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BHMG1C9JSJ3 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 555 ms