Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HIF1AQ16665 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HIF1AQ16665 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
HIF1AQ16665 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HIF1AQ16665 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HIF1AQ16665 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HIF1AQ16665 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
HIF1AQ16665 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HIF1AQ16665 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HIF1AQ16665 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HIF1AQ16665 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HIF1AQ16665 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HIF1AQ16665 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HIF1AQ16665 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HIF1AQ16665 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HIF1AQ16665 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
HIF1AQ16665 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HIF1AQ16665 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HIF1AQ16665 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HIF1AQ16665 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HIF1AQ16665 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HIF1AQ16665 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HIF1AQ16665 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HIF1AQ16665 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
HIF1AQ16665 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HIF1AQ16665 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HIF1AQ16665 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HIF1AQ16665 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
HIF1AQ16665 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HIF1AQ16665 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HIF1AQ16665 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HIF1AQ16665 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HIF1AQ16665 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HIF1AQ16665 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HIF1AQ16665 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HIF1AQ16665 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HIF1AQ16665 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HIF1AQ16665 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HIF1AQ16665 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HIF1AQ16665 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HIF1AQ16665 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HIF1AQ16665 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HIF1AQ16665 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HIF1AQ16665 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HIF1AQ16665 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HIF1AQ16665 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HIF1AQ16665 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
HIF1AQ16665 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
HIF1AQ16665 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HIF1AQ16665 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HIF1AQ16665 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HIF1AQ16665 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HIF1AQ16665 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HIF1AQ16665 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HIF1AQ16665 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
HIF1AQ16665 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HIF1AQ16665 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HIF1AQ16665 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HIF1AQ16665 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HIF1AQ16665 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HIF1AQ16665 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HIF1AQ16665 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HIF1AQ16665 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
HIF1AQ16665 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HIF1AQ16665 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HIF1AQ16665 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HIF1AQ16665 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HIF1AQ16665 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HIF1AQ16665 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HIF1AQ16665 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HIF1AQ16665 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HIF1AQ16665 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HIF1AQ16665 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HIF1AQ16665 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HIF1AQ16665 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HIF1AQ16665 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HIF1AQ16665 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HIF1AQ16665 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HIF1AQ16665 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HIF1AQ16665 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HIF1AQ16665 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HIF1AQ16665 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HIF1AQ16665 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HIF1AQ16665 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HIF1AQ16665 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HIF1AQ16665 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HIF1AQ16665 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HIF1AQ16665 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
HIF1AQ16665 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HIF1AQ16665 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HIF1AQ16665 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
HIF1AQ16665 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HIF1AQ16665 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HIF1AQ16665 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HIF1AQ16665 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HIF1AQ16665 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HIF1AQ16665 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HIF1AQ16665 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HIF1AQ16665 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HIF1AQ16665 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
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