Protein–RNA interactions for Protein: P36871

PGM1, Phosphoglucomutase-1, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGM1P36871 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PGM1P36871 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PGM1P36871 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PGM1P36871 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PGM1P36871 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PGM1P36871 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PGM1P36871 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PGM1P36871 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PGM1P36871 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PGM1P36871 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PGM1P36871 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PGM1P36871 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PGM1P36871 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PGM1P36871 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PGM1P36871 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PGM1P36871 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PGM1P36871 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PGM1P36871 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PGM1P36871 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PGM1P36871 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PGM1P36871 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PGM1P36871 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PGM1P36871 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PGM1P36871 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PGM1P36871 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PGM1P36871 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PGM1P36871 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PGM1P36871 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PGM1P36871 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PGM1P36871 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PGM1P36871 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PGM1P36871 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PGM1P36871 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PGM1P36871 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PGM1P36871 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PGM1P36871 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PGM1P36871 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PGM1P36871 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PGM1P36871 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PGM1P36871 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PGM1P36871 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PGM1P36871 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PGM1P36871 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PGM1P36871 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PGM1P36871 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PGM1P36871 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PGM1P36871 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PGM1P36871 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PGM1P36871 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PGM1P36871 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PGM1P36871 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PGM1P36871 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PGM1P36871 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PGM1P36871 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PGM1P36871 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PGM1P36871 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PGM1P36871 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PGM1P36871 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PGM1P36871 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PGM1P36871 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PGM1P36871 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PGM1P36871 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PGM1P36871 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PGM1P36871 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PGM1P36871 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PGM1P36871 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PGM1P36871 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PGM1P36871 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PGM1P36871 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PGM1P36871 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PGM1P36871 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PGM1P36871 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PGM1P36871 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PGM1P36871 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PGM1P36871 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PGM1P36871 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PGM1P36871 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PGM1P36871 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PGM1P36871 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PGM1P36871 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PGM1P36871 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PGM1P36871 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PGM1P36871 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PGM1P36871 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PGM1P36871 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PGM1P36871 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PGM1P36871 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PGM1P36871 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PGM1P36871 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PGM1P36871 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PGM1P36871 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PGM1P36871 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PGM1P36871 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PGM1P36871 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PGM1P36871 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PGM1P36871 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PGM1P36871 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PGM1P36871 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PGM1P36871 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PGM1P36871 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms