Protein–RNA interactions for Protein: O14618

CCS, Copper chaperone for superoxide dismutase, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSO14618 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCSO14618 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCSO14618 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCSO14618 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCSO14618 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCSO14618 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCSO14618 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCSO14618 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCSO14618 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCSO14618 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCSO14618 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCSO14618 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCSO14618 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCSO14618 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCSO14618 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCSO14618 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCSO14618 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCSO14618 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCSO14618 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCSO14618 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCSO14618 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCSO14618 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCSO14618 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCSO14618 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCSO14618 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCSO14618 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCSO14618 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCSO14618 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCSO14618 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCSO14618 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCSO14618 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCSO14618 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCSO14618 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCSO14618 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CCSO14618 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CCSO14618 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCSO14618 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCSO14618 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCSO14618 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCSO14618 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCSO14618 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCSO14618 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCSO14618 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCSO14618 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCSO14618 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCSO14618 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCSO14618 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCSO14618 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCSO14618 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCSO14618 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCSO14618 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCSO14618 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCSO14618 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCSO14618 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCSO14618 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCSO14618 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCSO14618 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCSO14618 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CCSO14618 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CCSO14618 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCSO14618 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CCSO14618 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCSO14618 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCSO14618 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCSO14618 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCSO14618 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCSO14618 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCSO14618 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCSO14618 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCSO14618 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCSO14618 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCSO14618 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCSO14618 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCSO14618 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCSO14618 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCSO14618 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCSO14618 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCSO14618 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCSO14618 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCSO14618 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCSO14618 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCSO14618 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCSO14618 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCSO14618 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCSO14618 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CCSO14618 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCSO14618 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCSO14618 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCSO14618 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCSO14618 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCSO14618 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCSO14618 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCSO14618 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCSO14618 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCSO14618 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCSO14618 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCSO14618 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCSO14618 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCSO14618 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCSO14618 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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