Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y547

HSPB11, Intraflagellar transport protein 25 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB11Q9Y547 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HSPB11Q9Y547 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HSPB11Q9Y547 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HSPB11Q9Y547 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
HSPB11Q9Y547 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HSPB11Q9Y547 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HSPB11Q9Y547 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HSPB11Q9Y547 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HSPB11Q9Y547 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HSPB11Q9Y547 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
HSPB11Q9Y547 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HSPB11Q9Y547 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HSPB11Q9Y547 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HSPB11Q9Y547 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HSPB11Q9Y547 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HSPB11Q9Y547 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HSPB11Q9Y547 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HSPB11Q9Y547 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HSPB11Q9Y547 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HSPB11Q9Y547 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HSPB11Q9Y547 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HSPB11Q9Y547 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HSPB11Q9Y547 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HSPB11Q9Y547 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HSPB11Q9Y547 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HSPB11Q9Y547 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HSPB11Q9Y547 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HSPB11Q9Y547 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HSPB11Q9Y547 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HSPB11Q9Y547 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HSPB11Q9Y547 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HSPB11Q9Y547 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HSPB11Q9Y547 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HSPB11Q9Y547 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HSPB11Q9Y547 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HSPB11Q9Y547 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HSPB11Q9Y547 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HSPB11Q9Y547 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HSPB11Q9Y547 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HSPB11Q9Y547 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HSPB11Q9Y547 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
HSPB11Q9Y547 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HSPB11Q9Y547 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HSPB11Q9Y547 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HSPB11Q9Y547 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HSPB11Q9Y547 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HSPB11Q9Y547 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
HSPB11Q9Y547 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HSPB11Q9Y547 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HSPB11Q9Y547 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HSPB11Q9Y547 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HSPB11Q9Y547 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HSPB11Q9Y547 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HSPB11Q9Y547 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HSPB11Q9Y547 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HSPB11Q9Y547 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HSPB11Q9Y547 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HSPB11Q9Y547 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HSPB11Q9Y547 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HSPB11Q9Y547 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HSPB11Q9Y547 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HSPB11Q9Y547 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HSPB11Q9Y547 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HSPB11Q9Y547 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HSPB11Q9Y547 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HSPB11Q9Y547 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HSPB11Q9Y547 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HSPB11Q9Y547 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HSPB11Q9Y547 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HSPB11Q9Y547 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HSPB11Q9Y547 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HSPB11Q9Y547 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HSPB11Q9Y547 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HSPB11Q9Y547 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HSPB11Q9Y547 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HSPB11Q9Y547 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HSPB11Q9Y547 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HSPB11Q9Y547 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HSPB11Q9Y547 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HSPB11Q9Y547 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HSPB11Q9Y547 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
HSPB11Q9Y547 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HSPB11Q9Y547 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HSPB11Q9Y547 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HSPB11Q9Y547 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
HSPB11Q9Y547 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HSPB11Q9Y547 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HSPB11Q9Y547 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HSPB11Q9Y547 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HSPB11Q9Y547 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HSPB11Q9Y547 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HSPB11Q9Y547 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HSPB11Q9Y547 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HSPB11Q9Y547 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HSPB11Q9Y547 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HSPB11Q9Y547 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HSPB11Q9Y547 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HSPB11Q9Y547 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HSPB11Q9Y547 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HSPB11Q9Y547 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124.8 ms