Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3P4

RHBDD3, Rhomboid domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDD3Q9Y3P4 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RHBDD3Q9Y3P4 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RHBDD3Q9Y3P4 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RHBDD3Q9Y3P4 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RHBDD3Q9Y3P4 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RHBDD3Q9Y3P4 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RHBDD3Q9Y3P4 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RHBDD3Q9Y3P4 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RHBDD3Q9Y3P4 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
RHBDD3Q9Y3P4 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
RHBDD3Q9Y3P4 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RHBDD3Q9Y3P4 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RHBDD3Q9Y3P4 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
RHBDD3Q9Y3P4 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RHBDD3Q9Y3P4 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RHBDD3Q9Y3P4 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RHBDD3Q9Y3P4 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RHBDD3Q9Y3P4 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RHBDD3Q9Y3P4 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RHBDD3Q9Y3P4 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
RHBDD3Q9Y3P4 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RHBDD3Q9Y3P4 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RHBDD3Q9Y3P4 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RHBDD3Q9Y3P4 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RHBDD3Q9Y3P4 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RHBDD3Q9Y3P4 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
RHBDD3Q9Y3P4 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RHBDD3Q9Y3P4 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RHBDD3Q9Y3P4 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RHBDD3Q9Y3P4 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RHBDD3Q9Y3P4 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RHBDD3Q9Y3P4 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RHBDD3Q9Y3P4 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
RHBDD3Q9Y3P4 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RHBDD3Q9Y3P4 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RHBDD3Q9Y3P4 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RHBDD3Q9Y3P4 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RHBDD3Q9Y3P4 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RHBDD3Q9Y3P4 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RHBDD3Q9Y3P4 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RHBDD3Q9Y3P4 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RHBDD3Q9Y3P4 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RHBDD3Q9Y3P4 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RHBDD3Q9Y3P4 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RHBDD3Q9Y3P4 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RHBDD3Q9Y3P4 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RHBDD3Q9Y3P4 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RHBDD3Q9Y3P4 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RHBDD3Q9Y3P4 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RHBDD3Q9Y3P4 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RHBDD3Q9Y3P4 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RHBDD3Q9Y3P4 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RHBDD3Q9Y3P4 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RHBDD3Q9Y3P4 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RHBDD3Q9Y3P4 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RHBDD3Q9Y3P4 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RHBDD3Q9Y3P4 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RHBDD3Q9Y3P4 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RHBDD3Q9Y3P4 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RHBDD3Q9Y3P4 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RHBDD3Q9Y3P4 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RHBDD3Q9Y3P4 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RHBDD3Q9Y3P4 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RHBDD3Q9Y3P4 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RHBDD3Q9Y3P4 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RHBDD3Q9Y3P4 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RHBDD3Q9Y3P4 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RHBDD3Q9Y3P4 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RHBDD3Q9Y3P4 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RHBDD3Q9Y3P4 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RHBDD3Q9Y3P4 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RHBDD3Q9Y3P4 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RHBDD3Q9Y3P4 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RHBDD3Q9Y3P4 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RHBDD3Q9Y3P4 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RHBDD3Q9Y3P4 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RHBDD3Q9Y3P4 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RHBDD3Q9Y3P4 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RHBDD3Q9Y3P4 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RHBDD3Q9Y3P4 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RHBDD3Q9Y3P4 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RHBDD3Q9Y3P4 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
RHBDD3Q9Y3P4 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RHBDD3Q9Y3P4 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RHBDD3Q9Y3P4 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RHBDD3Q9Y3P4 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RHBDD3Q9Y3P4 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RHBDD3Q9Y3P4 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RHBDD3Q9Y3P4 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RHBDD3Q9Y3P4 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RHBDD3Q9Y3P4 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RHBDD3Q9Y3P4 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RHBDD3Q9Y3P4 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RHBDD3Q9Y3P4 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RHBDD3Q9Y3P4 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RHBDD3Q9Y3P4 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RHBDD3Q9Y3P4 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RHBDD3Q9Y3P4 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RHBDD3Q9Y3P4 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RHBDD3Q9Y3P4 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms