Protein–RNA interactions for Protein: Q9P253

VPS18, Vacuolar protein sorting-associated protein 18 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 973 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS18Q9P253 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
VPS18Q9P253 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
VPS18Q9P253 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
VPS18Q9P253 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
VPS18Q9P253 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
VPS18Q9P253 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
VPS18Q9P253 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
VPS18Q9P253 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
VPS18Q9P253 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
VPS18Q9P253 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
VPS18Q9P253 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
VPS18Q9P253 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
VPS18Q9P253 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
VPS18Q9P253 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
VPS18Q9P253 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
VPS18Q9P253 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
VPS18Q9P253 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.35■■□□□ 1.81
VPS18Q9P253 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
VPS18Q9P253 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
VPS18Q9P253 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
VPS18Q9P253 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
VPS18Q9P253 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
VPS18Q9P253 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
VPS18Q9P253 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
VPS18Q9P253 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
VPS18Q9P253 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
VPS18Q9P253 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
VPS18Q9P253 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
VPS18Q9P253 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
VPS18Q9P253 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
VPS18Q9P253 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
VPS18Q9P253 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
VPS18Q9P253 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
VPS18Q9P253 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
VPS18Q9P253 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
VPS18Q9P253 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
VPS18Q9P253 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
VPS18Q9P253 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
VPS18Q9P253 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
VPS18Q9P253 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
VPS18Q9P253 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
VPS18Q9P253 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
VPS18Q9P253 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
VPS18Q9P253 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
VPS18Q9P253 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
VPS18Q9P253 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
VPS18Q9P253 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
VPS18Q9P253 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
VPS18Q9P253 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
VPS18Q9P253 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
VPS18Q9P253 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
VPS18Q9P253 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
VPS18Q9P253 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
VPS18Q9P253 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
VPS18Q9P253 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
VPS18Q9P253 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
VPS18Q9P253 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
VPS18Q9P253 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
VPS18Q9P253 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
VPS18Q9P253 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
VPS18Q9P253 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
VPS18Q9P253 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
VPS18Q9P253 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
VPS18Q9P253 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
VPS18Q9P253 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
VPS18Q9P253 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
VPS18Q9P253 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
VPS18Q9P253 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
VPS18Q9P253 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
VPS18Q9P253 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
VPS18Q9P253 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
VPS18Q9P253 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
VPS18Q9P253 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
VPS18Q9P253 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
VPS18Q9P253 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
VPS18Q9P253 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
VPS18Q9P253 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
VPS18Q9P253 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
VPS18Q9P253 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
VPS18Q9P253 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
VPS18Q9P253 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
VPS18Q9P253 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
VPS18Q9P253 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
VPS18Q9P253 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
VPS18Q9P253 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
VPS18Q9P253 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
VPS18Q9P253 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
VPS18Q9P253 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
VPS18Q9P253 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
VPS18Q9P253 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
VPS18Q9P253 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
VPS18Q9P253 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
VPS18Q9P253 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
VPS18Q9P253 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
VPS18Q9P253 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
VPS18Q9P253 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
VPS18Q9P253 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
VPS18Q9P253 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
VPS18Q9P253 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
VPS18Q9P253 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.2 ms