Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRF8

CTPS2, CTP synthase 2, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS2Q9NRF8 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTPS2Q9NRF8 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTPS2Q9NRF8 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTPS2Q9NRF8 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTPS2Q9NRF8 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTPS2Q9NRF8 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTPS2Q9NRF8 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTPS2Q9NRF8 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTPS2Q9NRF8 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTPS2Q9NRF8 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTPS2Q9NRF8 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CTPS2Q9NRF8 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTPS2Q9NRF8 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTPS2Q9NRF8 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTPS2Q9NRF8 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTPS2Q9NRF8 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTPS2Q9NRF8 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTPS2Q9NRF8 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTPS2Q9NRF8 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTPS2Q9NRF8 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTPS2Q9NRF8 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTPS2Q9NRF8 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTPS2Q9NRF8 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTPS2Q9NRF8 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTPS2Q9NRF8 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTPS2Q9NRF8 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTPS2Q9NRF8 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTPS2Q9NRF8 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTPS2Q9NRF8 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTPS2Q9NRF8 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTPS2Q9NRF8 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTPS2Q9NRF8 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTPS2Q9NRF8 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTPS2Q9NRF8 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTPS2Q9NRF8 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTPS2Q9NRF8 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTPS2Q9NRF8 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
CTPS2Q9NRF8 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTPS2Q9NRF8 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTPS2Q9NRF8 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTPS2Q9NRF8 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTPS2Q9NRF8 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTPS2Q9NRF8 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTPS2Q9NRF8 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTPS2Q9NRF8 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTPS2Q9NRF8 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTPS2Q9NRF8 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTPS2Q9NRF8 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTPS2Q9NRF8 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTPS2Q9NRF8 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTPS2Q9NRF8 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CTPS2Q9NRF8 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CTPS2Q9NRF8 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTPS2Q9NRF8 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTPS2Q9NRF8 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTPS2Q9NRF8 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTPS2Q9NRF8 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTPS2Q9NRF8 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTPS2Q9NRF8 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTPS2Q9NRF8 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTPS2Q9NRF8 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTPS2Q9NRF8 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTPS2Q9NRF8 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTPS2Q9NRF8 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTPS2Q9NRF8 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CTPS2Q9NRF8 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CTPS2Q9NRF8 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CTPS2Q9NRF8 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CTPS2Q9NRF8 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CTPS2Q9NRF8 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTPS2Q9NRF8 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTPS2Q9NRF8 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTPS2Q9NRF8 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTPS2Q9NRF8 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTPS2Q9NRF8 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CTPS2Q9NRF8 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTPS2Q9NRF8 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTPS2Q9NRF8 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTPS2Q9NRF8 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTPS2Q9NRF8 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTPS2Q9NRF8 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTPS2Q9NRF8 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTPS2Q9NRF8 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTPS2Q9NRF8 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTPS2Q9NRF8 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTPS2Q9NRF8 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTPS2Q9NRF8 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTPS2Q9NRF8 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTPS2Q9NRF8 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTPS2Q9NRF8 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTPS2Q9NRF8 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTPS2Q9NRF8 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTPS2Q9NRF8 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTPS2Q9NRF8 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTPS2Q9NRF8 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTPS2Q9NRF8 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTPS2Q9NRF8 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTPS2Q9NRF8 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTPS2Q9NRF8 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTPS2Q9NRF8 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms