Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQX1

PRDM5, PR domain zinc finger protein 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM5Q9NQX1 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PRDM5Q9NQX1 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PRDM5Q9NQX1 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PRDM5Q9NQX1 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PRDM5Q9NQX1 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PRDM5Q9NQX1 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PRDM5Q9NQX1 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PRDM5Q9NQX1 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PRDM5Q9NQX1 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PRDM5Q9NQX1 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PRDM5Q9NQX1 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PRDM5Q9NQX1 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PRDM5Q9NQX1 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
PRDM5Q9NQX1 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PRDM5Q9NQX1 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PRDM5Q9NQX1 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PRDM5Q9NQX1 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PRDM5Q9NQX1 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PRDM5Q9NQX1 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PRDM5Q9NQX1 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PRDM5Q9NQX1 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PRDM5Q9NQX1 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
PRDM5Q9NQX1 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PRDM5Q9NQX1 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PRDM5Q9NQX1 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PRDM5Q9NQX1 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PRDM5Q9NQX1 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PRDM5Q9NQX1 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PRDM5Q9NQX1 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PRDM5Q9NQX1 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
PRDM5Q9NQX1 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PRDM5Q9NQX1 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PRDM5Q9NQX1 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PRDM5Q9NQX1 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PRDM5Q9NQX1 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
PRDM5Q9NQX1 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PRDM5Q9NQX1 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PRDM5Q9NQX1 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PRDM5Q9NQX1 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PRDM5Q9NQX1 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
PRDM5Q9NQX1 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PRDM5Q9NQX1 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PRDM5Q9NQX1 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PRDM5Q9NQX1 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PRDM5Q9NQX1 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PRDM5Q9NQX1 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PRDM5Q9NQX1 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PRDM5Q9NQX1 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PRDM5Q9NQX1 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PRDM5Q9NQX1 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PRDM5Q9NQX1 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PRDM5Q9NQX1 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
PRDM5Q9NQX1 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PRDM5Q9NQX1 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PRDM5Q9NQX1 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PRDM5Q9NQX1 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PRDM5Q9NQX1 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PRDM5Q9NQX1 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PRDM5Q9NQX1 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PRDM5Q9NQX1 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
PRDM5Q9NQX1 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PRDM5Q9NQX1 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PRDM5Q9NQX1 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PRDM5Q9NQX1 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
PRDM5Q9NQX1 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PRDM5Q9NQX1 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PRDM5Q9NQX1 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PRDM5Q9NQX1 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PRDM5Q9NQX1 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PRDM5Q9NQX1 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PRDM5Q9NQX1 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PRDM5Q9NQX1 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PRDM5Q9NQX1 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PRDM5Q9NQX1 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
PRDM5Q9NQX1 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PRDM5Q9NQX1 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PRDM5Q9NQX1 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PRDM5Q9NQX1 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PRDM5Q9NQX1 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PRDM5Q9NQX1 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PRDM5Q9NQX1 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PRDM5Q9NQX1 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PRDM5Q9NQX1 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PRDM5Q9NQX1 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PRDM5Q9NQX1 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PRDM5Q9NQX1 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
PRDM5Q9NQX1 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PRDM5Q9NQX1 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PRDM5Q9NQX1 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PRDM5Q9NQX1 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PRDM5Q9NQX1 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
PRDM5Q9NQX1 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PRDM5Q9NQX1 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PRDM5Q9NQX1 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PRDM5Q9NQX1 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PRDM5Q9NQX1 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PRDM5Q9NQX1 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
PRDM5Q9NQX1 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PRDM5Q9NQX1 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PRDM5Q9NQX1 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms