Protein–RNA interactions for Protein: Q9H649

NSUN3, tRNA (cytosine(34)-C(5))-methyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSUN3Q9H649 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NSUN3Q9H649 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
NSUN3Q9H649 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NSUN3Q9H649 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NSUN3Q9H649 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NSUN3Q9H649 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NSUN3Q9H649 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NSUN3Q9H649 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NSUN3Q9H649 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NSUN3Q9H649 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NSUN3Q9H649 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NSUN3Q9H649 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NSUN3Q9H649 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NSUN3Q9H649 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NSUN3Q9H649 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NSUN3Q9H649 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NSUN3Q9H649 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NSUN3Q9H649 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NSUN3Q9H649 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
NSUN3Q9H649 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
NSUN3Q9H649 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NSUN3Q9H649 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NSUN3Q9H649 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NSUN3Q9H649 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NSUN3Q9H649 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
NSUN3Q9H649 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NSUN3Q9H649 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NSUN3Q9H649 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NSUN3Q9H649 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NSUN3Q9H649 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NSUN3Q9H649 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NSUN3Q9H649 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NSUN3Q9H649 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NSUN3Q9H649 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NSUN3Q9H649 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NSUN3Q9H649 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NSUN3Q9H649 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NSUN3Q9H649 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NSUN3Q9H649 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NSUN3Q9H649 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NSUN3Q9H649 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
NSUN3Q9H649 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
NSUN3Q9H649 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NSUN3Q9H649 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
NSUN3Q9H649 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NSUN3Q9H649 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NSUN3Q9H649 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NSUN3Q9H649 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NSUN3Q9H649 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NSUN3Q9H649 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NSUN3Q9H649 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NSUN3Q9H649 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NSUN3Q9H649 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NSUN3Q9H649 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NSUN3Q9H649 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NSUN3Q9H649 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NSUN3Q9H649 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NSUN3Q9H649 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NSUN3Q9H649 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NSUN3Q9H649 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NSUN3Q9H649 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NSUN3Q9H649 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NSUN3Q9H649 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NSUN3Q9H649 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
NSUN3Q9H649 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NSUN3Q9H649 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
NSUN3Q9H649 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NSUN3Q9H649 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NSUN3Q9H649 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NSUN3Q9H649 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NSUN3Q9H649 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
NSUN3Q9H649 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
NSUN3Q9H649 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NSUN3Q9H649 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NSUN3Q9H649 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NSUN3Q9H649 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NSUN3Q9H649 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NSUN3Q9H649 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NSUN3Q9H649 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NSUN3Q9H649 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NSUN3Q9H649 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NSUN3Q9H649 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NSUN3Q9H649 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
NSUN3Q9H649 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NSUN3Q9H649 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
NSUN3Q9H649 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NSUN3Q9H649 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NSUN3Q9H649 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
NSUN3Q9H649 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NSUN3Q9H649 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NSUN3Q9H649 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NSUN3Q9H649 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NSUN3Q9H649 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NSUN3Q9H649 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NSUN3Q9H649 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NSUN3Q9H649 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NSUN3Q9H649 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NSUN3Q9H649 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NSUN3Q9H649 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NSUN3Q9H649 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms