Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2D6

TRIOBP, TRIO and F-actin-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIOBPQ9H2D6 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
TRIOBPQ9H2D6 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRIOBPQ9H2D6 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRIOBPQ9H2D6 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRIOBPQ9H2D6 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRIOBPQ9H2D6 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRIOBPQ9H2D6 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRIOBPQ9H2D6 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRIOBPQ9H2D6 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRIOBPQ9H2D6 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
TRIOBPQ9H2D6 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRIOBPQ9H2D6 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRIOBPQ9H2D6 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRIOBPQ9H2D6 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRIOBPQ9H2D6 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRIOBPQ9H2D6 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRIOBPQ9H2D6 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRIOBPQ9H2D6 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRIOBPQ9H2D6 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRIOBPQ9H2D6 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRIOBPQ9H2D6 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRIOBPQ9H2D6 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRIOBPQ9H2D6 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRIOBPQ9H2D6 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRIOBPQ9H2D6 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRIOBPQ9H2D6 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
TRIOBPQ9H2D6 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
TRIOBPQ9H2D6 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TRIOBPQ9H2D6 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TRIOBPQ9H2D6 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TRIOBPQ9H2D6 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TRIOBPQ9H2D6 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRIOBPQ9H2D6 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRIOBPQ9H2D6 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRIOBPQ9H2D6 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRIOBPQ9H2D6 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRIOBPQ9H2D6 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRIOBPQ9H2D6 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
TRIOBPQ9H2D6 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
TRIOBPQ9H2D6 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
TRIOBPQ9H2D6 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
TRIOBPQ9H2D6 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRIOBPQ9H2D6 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TRIOBPQ9H2D6 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TRIOBPQ9H2D6 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TRIOBPQ9H2D6 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TRIOBPQ9H2D6 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TRIOBPQ9H2D6 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRIOBPQ9H2D6 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRIOBPQ9H2D6 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRIOBPQ9H2D6 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRIOBPQ9H2D6 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
TRIOBPQ9H2D6 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
TRIOBPQ9H2D6 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TRIOBPQ9H2D6 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TRIOBPQ9H2D6 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRIOBPQ9H2D6 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
TRIOBPQ9H2D6 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRIOBPQ9H2D6 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRIOBPQ9H2D6 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
TRIOBPQ9H2D6 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRIOBPQ9H2D6 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRIOBPQ9H2D6 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRIOBPQ9H2D6 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRIOBPQ9H2D6 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRIOBPQ9H2D6 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
TRIOBPQ9H2D6 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRIOBPQ9H2D6 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRIOBPQ9H2D6 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRIOBPQ9H2D6 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRIOBPQ9H2D6 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRIOBPQ9H2D6 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRIOBPQ9H2D6 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TRIOBPQ9H2D6 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRIOBPQ9H2D6 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRIOBPQ9H2D6 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRIOBPQ9H2D6 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRIOBPQ9H2D6 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRIOBPQ9H2D6 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRIOBPQ9H2D6 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRIOBPQ9H2D6 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRIOBPQ9H2D6 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRIOBPQ9H2D6 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRIOBPQ9H2D6 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
TRIOBPQ9H2D6 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRIOBPQ9H2D6 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRIOBPQ9H2D6 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
TRIOBPQ9H2D6 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRIOBPQ9H2D6 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRIOBPQ9H2D6 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRIOBPQ9H2D6 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRIOBPQ9H2D6 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRIOBPQ9H2D6 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRIOBPQ9H2D6 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRIOBPQ9H2D6 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRIOBPQ9H2D6 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
TRIOBPQ9H2D6 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRIOBPQ9H2D6 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRIOBPQ9H2D6 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRIOBPQ9H2D6 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms