Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM5

YIPF3, Protein YIPF3, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YIPF3Q9GZM5 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
YIPF3Q9GZM5 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
YIPF3Q9GZM5 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
YIPF3Q9GZM5 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
YIPF3Q9GZM5 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
YIPF3Q9GZM5 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
YIPF3Q9GZM5 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
YIPF3Q9GZM5 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
YIPF3Q9GZM5 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
YIPF3Q9GZM5 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
YIPF3Q9GZM5 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
YIPF3Q9GZM5 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
YIPF3Q9GZM5 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
YIPF3Q9GZM5 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
YIPF3Q9GZM5 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
YIPF3Q9GZM5 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
YIPF3Q9GZM5 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
YIPF3Q9GZM5 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
YIPF3Q9GZM5 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
YIPF3Q9GZM5 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
YIPF3Q9GZM5 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
YIPF3Q9GZM5 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
YIPF3Q9GZM5 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
YIPF3Q9GZM5 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
YIPF3Q9GZM5 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
YIPF3Q9GZM5 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
YIPF3Q9GZM5 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
YIPF3Q9GZM5 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
YIPF3Q9GZM5 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
YIPF3Q9GZM5 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
YIPF3Q9GZM5 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
YIPF3Q9GZM5 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
YIPF3Q9GZM5 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
YIPF3Q9GZM5 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
YIPF3Q9GZM5 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
YIPF3Q9GZM5 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
YIPF3Q9GZM5 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
YIPF3Q9GZM5 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
YIPF3Q9GZM5 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
YIPF3Q9GZM5 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
YIPF3Q9GZM5 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
YIPF3Q9GZM5 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
YIPF3Q9GZM5 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
YIPF3Q9GZM5 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
YIPF3Q9GZM5 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
YIPF3Q9GZM5 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
YIPF3Q9GZM5 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
YIPF3Q9GZM5 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
YIPF3Q9GZM5 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
YIPF3Q9GZM5 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
YIPF3Q9GZM5 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
YIPF3Q9GZM5 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
YIPF3Q9GZM5 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
YIPF3Q9GZM5 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
YIPF3Q9GZM5 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
YIPF3Q9GZM5 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
YIPF3Q9GZM5 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
YIPF3Q9GZM5 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
YIPF3Q9GZM5 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
YIPF3Q9GZM5 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
YIPF3Q9GZM5 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
YIPF3Q9GZM5 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
YIPF3Q9GZM5 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
YIPF3Q9GZM5 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
YIPF3Q9GZM5 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
YIPF3Q9GZM5 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
YIPF3Q9GZM5 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
YIPF3Q9GZM5 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
YIPF3Q9GZM5 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
YIPF3Q9GZM5 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
YIPF3Q9GZM5 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
YIPF3Q9GZM5 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
YIPF3Q9GZM5 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
YIPF3Q9GZM5 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
YIPF3Q9GZM5 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
YIPF3Q9GZM5 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
YIPF3Q9GZM5 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
YIPF3Q9GZM5 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
YIPF3Q9GZM5 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
YIPF3Q9GZM5 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
YIPF3Q9GZM5 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
YIPF3Q9GZM5 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
YIPF3Q9GZM5 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
YIPF3Q9GZM5 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
YIPF3Q9GZM5 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
YIPF3Q9GZM5 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
YIPF3Q9GZM5 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
YIPF3Q9GZM5 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
YIPF3Q9GZM5 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
YIPF3Q9GZM5 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
YIPF3Q9GZM5 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
YIPF3Q9GZM5 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
YIPF3Q9GZM5 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
YIPF3Q9GZM5 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
YIPF3Q9GZM5 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
YIPF3Q9GZM5 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
YIPF3Q9GZM5 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
YIPF3Q9GZM5 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
YIPF3Q9GZM5 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
YIPF3Q9GZM5 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms