Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H6

KLHL4, Kelch-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL4Q9C0H6 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KLHL4Q9C0H6 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
KLHL4Q9C0H6 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KLHL4Q9C0H6 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KLHL4Q9C0H6 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KLHL4Q9C0H6 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KLHL4Q9C0H6 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KLHL4Q9C0H6 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KLHL4Q9C0H6 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KLHL4Q9C0H6 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KLHL4Q9C0H6 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KLHL4Q9C0H6 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
KLHL4Q9C0H6 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KLHL4Q9C0H6 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KLHL4Q9C0H6 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KLHL4Q9C0H6 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KLHL4Q9C0H6 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KLHL4Q9C0H6 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KLHL4Q9C0H6 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KLHL4Q9C0H6 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KLHL4Q9C0H6 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KLHL4Q9C0H6 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KLHL4Q9C0H6 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KLHL4Q9C0H6 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KLHL4Q9C0H6 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KLHL4Q9C0H6 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KLHL4Q9C0H6 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KLHL4Q9C0H6 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KLHL4Q9C0H6 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KLHL4Q9C0H6 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KLHL4Q9C0H6 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KLHL4Q9C0H6 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KLHL4Q9C0H6 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KLHL4Q9C0H6 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KLHL4Q9C0H6 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
KLHL4Q9C0H6 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
KLHL4Q9C0H6 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KLHL4Q9C0H6 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KLHL4Q9C0H6 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KLHL4Q9C0H6 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KLHL4Q9C0H6 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KLHL4Q9C0H6 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KLHL4Q9C0H6 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KLHL4Q9C0H6 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KLHL4Q9C0H6 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KLHL4Q9C0H6 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KLHL4Q9C0H6 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
KLHL4Q9C0H6 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
KLHL4Q9C0H6 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KLHL4Q9C0H6 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KLHL4Q9C0H6 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KLHL4Q9C0H6 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KLHL4Q9C0H6 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KLHL4Q9C0H6 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KLHL4Q9C0H6 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KLHL4Q9C0H6 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KLHL4Q9C0H6 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KLHL4Q9C0H6 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KLHL4Q9C0H6 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KLHL4Q9C0H6 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KLHL4Q9C0H6 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KLHL4Q9C0H6 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KLHL4Q9C0H6 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KLHL4Q9C0H6 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KLHL4Q9C0H6 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KLHL4Q9C0H6 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KLHL4Q9C0H6 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KLHL4Q9C0H6 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KLHL4Q9C0H6 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
KLHL4Q9C0H6 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
KLHL4Q9C0H6 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KLHL4Q9C0H6 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KLHL4Q9C0H6 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KLHL4Q9C0H6 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KLHL4Q9C0H6 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KLHL4Q9C0H6 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KLHL4Q9C0H6 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KLHL4Q9C0H6 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KLHL4Q9C0H6 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KLHL4Q9C0H6 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KLHL4Q9C0H6 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KLHL4Q9C0H6 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
KLHL4Q9C0H6 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KLHL4Q9C0H6 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KLHL4Q9C0H6 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KLHL4Q9C0H6 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KLHL4Q9C0H6 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KLHL4Q9C0H6 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KLHL4Q9C0H6 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KLHL4Q9C0H6 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KLHL4Q9C0H6 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KLHL4Q9C0H6 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KLHL4Q9C0H6 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
KLHL4Q9C0H6 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KLHL4Q9C0H6 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KLHL4Q9C0H6 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KLHL4Q9C0H6 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KLHL4Q9C0H6 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KLHL4Q9C0H6 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KLHL4Q9C0H6 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.6 ms