Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW85

CCDC94, Coiled-coil domain-containing protein 94, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC94Q9BW85 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC94Q9BW85 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC94Q9BW85 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC94Q9BW85 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC94Q9BW85 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC94Q9BW85 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC94Q9BW85 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC94Q9BW85 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC94Q9BW85 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC94Q9BW85 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC94Q9BW85 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC94Q9BW85 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC94Q9BW85 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC94Q9BW85 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC94Q9BW85 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC94Q9BW85 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC94Q9BW85 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC94Q9BW85 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC94Q9BW85 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC94Q9BW85 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC94Q9BW85 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC94Q9BW85 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CCDC94Q9BW85 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC94Q9BW85 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC94Q9BW85 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC94Q9BW85 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC94Q9BW85 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC94Q9BW85 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC94Q9BW85 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC94Q9BW85 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC94Q9BW85 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC94Q9BW85 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC94Q9BW85 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC94Q9BW85 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC94Q9BW85 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC94Q9BW85 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC94Q9BW85 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC94Q9BW85 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC94Q9BW85 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC94Q9BW85 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC94Q9BW85 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC94Q9BW85 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC94Q9BW85 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC94Q9BW85 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC94Q9BW85 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC94Q9BW85 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC94Q9BW85 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC94Q9BW85 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC94Q9BW85 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC94Q9BW85 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC94Q9BW85 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC94Q9BW85 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC94Q9BW85 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC94Q9BW85 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC94Q9BW85 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC94Q9BW85 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC94Q9BW85 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC94Q9BW85 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC94Q9BW85 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC94Q9BW85 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC94Q9BW85 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC94Q9BW85 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC94Q9BW85 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC94Q9BW85 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC94Q9BW85 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC94Q9BW85 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC94Q9BW85 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC94Q9BW85 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC94Q9BW85 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC94Q9BW85 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC94Q9BW85 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC94Q9BW85 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC94Q9BW85 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC94Q9BW85 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
CCDC94Q9BW85 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
CCDC94Q9BW85 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
CCDC94Q9BW85 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC94Q9BW85 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC94Q9BW85 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC94Q9BW85 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC94Q9BW85 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28■■■□□ 2.07
CCDC94Q9BW85 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC94Q9BW85 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC94Q9BW85 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC94Q9BW85 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC94Q9BW85 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC94Q9BW85 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC94Q9BW85 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC94Q9BW85 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC94Q9BW85 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC94Q9BW85 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC94Q9BW85 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC94Q9BW85 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC94Q9BW85 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC94Q9BW85 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC94Q9BW85 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC94Q9BW85 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCDC94Q9BW85 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCDC94Q9BW85 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCDC94Q9BW85 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms