Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSJ5

LRRC8E, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, humanhuman

Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC8EQ6NSJ5 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRRC8EQ6NSJ5 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRRC8EQ6NSJ5 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRRC8EQ6NSJ5 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRRC8EQ6NSJ5 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRRC8EQ6NSJ5 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRRC8EQ6NSJ5 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRRC8EQ6NSJ5 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRRC8EQ6NSJ5 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
LRRC8EQ6NSJ5 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRRC8EQ6NSJ5 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LRRC8EQ6NSJ5 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
LRRC8EQ6NSJ5 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LRRC8EQ6NSJ5 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LRRC8EQ6NSJ5 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRRC8EQ6NSJ5 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRRC8EQ6NSJ5 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRC8EQ6NSJ5 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRC8EQ6NSJ5 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRRC8EQ6NSJ5 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRRC8EQ6NSJ5 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRRC8EQ6NSJ5 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRRC8EQ6NSJ5 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRRC8EQ6NSJ5 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRRC8EQ6NSJ5 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRRC8EQ6NSJ5 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRRC8EQ6NSJ5 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRRC8EQ6NSJ5 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRRC8EQ6NSJ5 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRRC8EQ6NSJ5 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
LRRC8EQ6NSJ5 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRRC8EQ6NSJ5 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRRC8EQ6NSJ5 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRRC8EQ6NSJ5 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRRC8EQ6NSJ5 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRRC8EQ6NSJ5 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
LRRC8EQ6NSJ5 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRRC8EQ6NSJ5 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRRC8EQ6NSJ5 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRRC8EQ6NSJ5 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRRC8EQ6NSJ5 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRRC8EQ6NSJ5 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRC8EQ6NSJ5 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRC8EQ6NSJ5 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRC8EQ6NSJ5 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRC8EQ6NSJ5 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRC8EQ6NSJ5 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRC8EQ6NSJ5 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRC8EQ6NSJ5 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRC8EQ6NSJ5 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRRC8EQ6NSJ5 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRRC8EQ6NSJ5 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRRC8EQ6NSJ5 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRRC8EQ6NSJ5 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRRC8EQ6NSJ5 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRRC8EQ6NSJ5 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LRRC8EQ6NSJ5 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LRRC8EQ6NSJ5 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LRRC8EQ6NSJ5 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LRRC8EQ6NSJ5 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LRRC8EQ6NSJ5 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
LRRC8EQ6NSJ5 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
LRRC8EQ6NSJ5 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
LRRC8EQ6NSJ5 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRRC8EQ6NSJ5 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRRC8EQ6NSJ5 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRRC8EQ6NSJ5 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRRC8EQ6NSJ5 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRRC8EQ6NSJ5 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRRC8EQ6NSJ5 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRRC8EQ6NSJ5 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRRC8EQ6NSJ5 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRRC8EQ6NSJ5 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRRC8EQ6NSJ5 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRC8EQ6NSJ5 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRC8EQ6NSJ5 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRC8EQ6NSJ5 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRC8EQ6NSJ5 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRC8EQ6NSJ5 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRC8EQ6NSJ5 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRC8EQ6NSJ5 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRRC8EQ6NSJ5 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRRC8EQ6NSJ5 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRRC8EQ6NSJ5 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRRC8EQ6NSJ5 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRRC8EQ6NSJ5 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
LRRC8EQ6NSJ5 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRRC8EQ6NSJ5 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRRC8EQ6NSJ5 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRRC8EQ6NSJ5 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRRC8EQ6NSJ5 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRRC8EQ6NSJ5 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRRC8EQ6NSJ5 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRRC8EQ6NSJ5 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRRC8EQ6NSJ5 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRRC8EQ6NSJ5 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRRC8EQ6NSJ5 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRC8EQ6NSJ5 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRC8EQ6NSJ5 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRC8EQ6NSJ5 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms