Protein–RNA interactions for Protein: Q12906

ILF3, Interleukin enhancer-binding factor 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ILF3Q12906 SOX5-205ENST00000451604 4261 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.393e-10■■■■■ 31.7
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ILF3Q12906 KMT2C-202ENST00000355193 16858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.282e-10■■■■■ 31.7
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ILF3Q12906 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.022e-7■■■■■ 31.6
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ILF3Q12906 UBA6-AS1-203ENST00000500538 3352 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.721e-7■■■■■ 31.4
ILF3Q12906 PPHLN1-208ENST00000449194 1583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.883e-9■■■■■ 31.4
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ILF3Q12906 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.362e-9■■■■■ 31
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ILF3Q12906 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.026e-8■■■■■ 31
ILF3Q12906 ANP32A-202ENST00000409628 2001 ntTSL 515.11■□□□□ 0.016e-8■■■■■ 31
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ILF3Q12906 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.136e-8■■■■■ 31
ILF3Q12906 ANP32A-205ENST00000483221 420 ntTSL 314.06□□□□□ -0.166e-8■■■■■ 31
ILF3Q12906 ANP32A-209ENST00000495764 504 ntTSL 514.06□□□□□ -0.166e-8■■■■■ 31
ILF3Q12906 TIAM2-208ENST00000461783 6981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.71□□□□□ -1.022e-13■■■■■ 31
ILF3Q12906 TIAM2-213ENST00000535064 768 ntTSL 56.31□□□□□ -1.42e-13■■■■■ 31
ILF3Q12906 TIAM2-207ENST00000460692 1194 ntTSL 24.34□□□□□ -1.712e-13■■■■■ 31
ILF3Q12906 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.742e-9■■■■■ 30.9
ILF3Q12906 DENND6A-202ENST00000464875 420 ntTSL 215.58■□□□□ 0.082e-9■■■■■ 30.9
ILF3Q12906 GNPAT-203ENST00000436239 839 ntAPPRIS ALT2 TSL 317.61■□□□□ 0.417e-7■■■■■ 30.9
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ILF3Q12906 GNPAT-201ENST00000366647 2643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.157e-7■■■■■ 30.9
ILF3Q12906 FAM122B-202ENST00000343004 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.31e-9■■■■■ 30.9
ILF3Q12906 FAM122B-201ENST00000298090 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.31e-9■■■■■ 30.9
ILF3Q12906 FAM122B-203ENST00000370790 4246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.331e-9■■■■■ 30.9
ILF3Q12906 FAM122B-208ENST00000611027 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.771e-9■■■■■ 30.9
ILF3Q12906 FAM122B-207ENST00000493333 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.91e-9■■■■■ 30.9
ILF3Q12906 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.794e-7■■■■■ 30.9
ILF3Q12906 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.654e-7■■■■■ 30.9
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