Protein–RNA interactions for Protein: Q12221

PUF2, mRNA-binding protein PUF2, yeastyeast

Known RBP RIP-Chip data

Length 1,075 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PUF2Q12221 COS10YNR075W 1125 nt7.51□□□□□ -1.21
PUF2Q12221 YPQ1YOL092W 927 nt7.51□□□□□ -1.21
PUF2Q12221 PEX28YHR150W 1740 nt7.51□□□□□ -1.21
PUF2Q12221 MAS2YHR024C 1449 nt7.51□□□□□ -1.21
PUF2Q12221 MBF1YOR298C-A 456 nt7.5□□□□□ -1.21
PUF2Q12221 PDC5YLR134W 1692 nt7.5□□□□□ -1.21
PUF2Q12221 YBL111CYBL111C 2004 nt7.49□□□□□ -1.21
PUF2Q12221 OPI1YHL020C 1215 nt7.49□□□□□ -1.21
PUF2Q12221 SNA3YJL151C 402 nt7.49□□□□□ -1.21
PUF2Q12221 PET10YKR046C 852 nt7.49□□□□□ -1.21
PUF2Q12221 RCF2YNR018W 675 nt7.49□□□□□ -1.21
PUF2Q12221 MDL2YPL270W 2322 nt7.49□□□□□ -1.21 RIP-Chip
PUF2Q12221 LEO1YOR123C 1395 nt7.47□□□□□ -1.21
PUF2Q12221 PIL1YGR086C 1020 nt7.47□□□□□ -1.21 RIP-Chip
PUF2Q12221 YPL067CYPL067C 597 nt7.47□□□□□ -1.21
PUF2Q12221 LAT1YNL071W 1449 nt7.46□□□□□ -1.21
PUF2Q12221 PTH2YBL057C 627 nt7.46□□□□□ -1.22
PUF2Q12221 CAR2YLR438W 1275 nt7.45□□□□□ -1.22
PUF2Q12221 ADE16YLR028C 1776 nt7.45□□□□□ -1.22
PUF2Q12221 GCD11YER025W 1584 nt7.45□□□□□ -1.22
PUF2Q12221 YOX1YML027W 1158 nt7.44□□□□□ -1.22
PUF2Q12221 LPD1YFL018C 1500 nt7.43□□□□□ -1.22
PUF2Q12221 MDH2YOL126C 1134 nt7.43□□□□□ -1.22
PUF2Q12221 CST26YBR042C 1194 nt7.43□□□□□ -1.22
PUF2Q12221 PMT7YDR307W 1989 nt7.42□□□□□ -1.22
PUF2Q12221 PDA1YER178W 1263 nt7.42□□□□□ -1.22
PUF2Q12221 TRR2YHR106W 1029 nt7.42□□□□□ -1.22
PUF2Q12221 FIT1YDR534C 1587 nt7.42□□□□□ -1.22
PUF2Q12221 CCW12YLR110C 402 nt7.41□□□□□ -1.22
PUF2Q12221 YML122CYML122C 381 nt7.41□□□□□ -1.22
PUF2Q12221 RSC9YML127W 1746 nt7.41□□□□□ -1.22
PUF2Q12221 RUP1YOR138C 2016 nt7.4□□□□□ -1.22
PUF2Q12221 SGF73YGL066W 1974 nt7.4□□□□□ -1.23
PUF2Q12221 HNM1YGL077C 1692 nt7.39□□□□□ -1.23
PUF2Q12221 YBL113CYBL113C 2379 nt7.38□□□□□ -1.23
PUF2Q12221 URA1YKL216W 945 nt7.38□□□□□ -1.23
PUF2Q12221 PRS4YBL068W 981 nt7.38□□□□□ -1.23
PUF2Q12221 YAH1YPL252C 519 nt7.38□□□□□ -1.23
PUF2Q12221 AIM46YHR199C 933 nt7.37□□□□□ -1.23
PUF2Q12221 ZIM17YNL310C 525 nt7.37□□□□□ -1.23
PUF2Q12221 snR30snR30 606 nt7.37□□□□□ -1.23
PUF2Q12221 PAB1YER165W 1734 nt7.37□□□□□ -1.23
PUF2Q12221 SNU66YOR308C 1764 nt7.36□□□□□ -1.23 RIP-Chip
PUF2Q12221 ADE2YOR128C 1716 nt7.36□□□□□ -1.23
PUF2Q12221 HSV2YGR223C 1347 nt7.36□□□□□ -1.23
PUF2Q12221 YJL213WYJL213W 996 nt7.36□□□□□ -1.23
PUF2Q12221 DCR2YLR361C 1737 nt7.35□□□□□ -1.23
PUF2Q12221 CSM2YIL132C 642 nt7.35□□□□□ -1.23
PUF2Q12221 SNF7YLR025W 723 nt7.35□□□□□ -1.23 RIP-Chip
PUF2Q12221 NAF1YNL124W 1479 nt7.35□□□□□ -1.23
PUF2Q12221 NFS1YCL017C 1494 nt7.35□□□□□ -1.23
PUF2Q12221 YEL034C-AYEL034C-A 603 nt7.34□□□□□ -1.23
PUF2Q12221 PAM17YKR065C 594 nt7.34□□□□□ -1.23
PUF2Q12221 ECM10YEL030W 1935 nt7.34□□□□□ -1.23
PUF2Q12221 AFG3YER017C 2286 nt7.34□□□□□ -1.24
PUF2Q12221 PFS2YNL317W 1398 nt7.33□□□□□ -1.24
PUF2Q12221 MCP1YOR228C 909 nt7.33□□□□□ -1.24
PUF2Q12221 ADE5,7YGL234W 2409 nt7.33□□□□□ -1.24
PUF2Q12221 TPI1YDR050C 747 nt7.32□□□□□ -1.24
PUF2Q12221 YJL144WYJL144W 315 nt7.32□□□□□ -1.24
PUF2Q12221 YPR130CYPR130C 408 nt7.32□□□□□ -1.24
PUF2Q12221 DML1YMR211W 1428 nt7.32□□□□□ -1.24
PUF2Q12221 MAM3YOL060C 2121 nt7.31□□□□□ -1.24
PUF2Q12221 YER152CYER152C 1332 nt7.31□□□□□ -1.24
PUF2Q12221 CIT2YCR005C 1383 nt7.31□□□□□ -1.24
PUF2Q12221 TCB1YOR086C 3561 nt7.3□□□□□ -1.24
PUF2Q12221 DPM1YPR183W 804 nt7.3□□□□□ -1.24
PUF2Q12221 UFD1YGR048W 1086 nt7.29□□□□□ -1.24
PUF2Q12221 RDR1YOR380W 1641 nt7.29□□□□□ -1.24
PUF2Q12221 ERG24YNL280C 1317 nt7.28□□□□□ -1.24 RIP-Chip
PUF2Q12221 RTC4YNL254C 1206 nt7.28□□□□□ -1.24
PUF2Q12221 PUS4YNL292W 1212 nt7.28□□□□□ -1.24
PUF2Q12221 RTC2YBR147W 891 nt7.28□□□□□ -1.24 RIP-Chip
PUF2Q12221 TOP3YLR234W 1971 nt7.28□□□□□ -1.24
PUF2Q12221 YPQ2YDR352W 954 nt7.27□□□□□ -1.25
PUF2Q12221 PET117YER058W 324 nt7.27□□□□□ -1.25
PUF2Q12221 DMC1YER179W 1005 nt7.27□□□□□ -1.25
PUF2Q12221 YGL260WYGL260W 231 nt7.27□□□□□ -1.25
PUF2Q12221 LGE1YPL055C 999 nt7.27□□□□□ -1.25 RIP-Chip
PUF2Q12221 SPE3YPR069C 882 nt7.27□□□□□ -1.25
PUF2Q12221 YLR162WYLR162W 357 nt7.26□□□□□ -1.25
PUF2Q12221 YCL049CYCL049C 939 nt7.26□□□□□ -1.25
PUF2Q12221 YDR327WYDR327W 327 nt7.25□□□□□ -1.25
PUF2Q12221 SML1YML058W 315 nt7.24□□□□□ -1.25
PUF2Q12221 YMR074CYMR074C 438 nt7.24□□□□□ -1.25
PUF2Q12221 MPH3YJR160C 1809 nt7.24□□□□□ -1.25
PUF2Q12221 PGI1YBR196C 1665 nt7.23□□□□□ -1.25
PUF2Q12221 CIA1YDR267C 993 nt7.23□□□□□ -1.25
PUF2Q12221 SUF3tG(CCC)D 72 nt7.23□□□□□ -1.25
PUF2Q12221 YKL147CYKL147C 618 nt7.23□□□□□ -1.25
PUF2Q12221 YLR030WYLR030W 792 nt7.23□□□□□ -1.25
PUF2Q12221 GET4YOR164C 939 nt7.23□□□□□ -1.25
PUF2Q12221 TUB1YML085C 1344 nt7.23□□□□□ -1.25
PUF2Q12221 PLB2YMR006C 2121 nt7.22□□□□□ -1.25
PUF2Q12221 BIO3YNR058W 1443 nt7.22□□□□□ -1.25
PUF2Q12221 LIP5YOR196C 1245 nt7.22□□□□□ -1.25
PUF2Q12221 MPE1YKL059C 1326 nt7.22□□□□□ -1.25
PUF2Q12221 YRF1-1YDR545W 5391 nt7.22□□□□□ -1.25
PUF2Q12221 YRF1-5YLR467W 5391 nt7.22□□□□□ -1.25
PUF2Q12221 YRF1-8YOR396W 5391 nt7.22□□□□□ -1.25
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