Protein–RNA interactions for Protein: Q08490

SGO1, Shugoshin, yeastyeast

Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SGO1Q08490 YPL264CYPL264C 1062 nt7.75□□□□□ -1.17
SGO1Q08490 BEM1YBR200W 1656 nt7.75□□□□□ -1.17
SGO1Q08490 YRF1-3YGR296W 5580 nt7.75□□□□□ -1.17
SGO1Q08490 YRF1-6YNL339C 5580 nt7.75□□□□□ -1.17
SGO1Q08490 YRF1-7YPL283C 5580 nt7.75□□□□□ -1.17
SGO1Q08490 YBR056WYBR056W 1506 nt7.74□□□□□ -1.17
SGO1Q08490 CTF3YLR381W 2202 nt7.74□□□□□ -1.17
SGO1Q08490 LGE1YPL055C 999 nt7.74□□□□□ -1.17
SGO1Q08490 ADE5,7YGL234W 2409 nt7.74□□□□□ -1.17
SGO1Q08490 NMA2YGR010W 1188 nt7.73□□□□□ -1.17
SGO1Q08490 YPL067CYPL067C 597 nt7.73□□□□□ -1.17
SGO1Q08490 YJR142WYJR142W 1029 nt7.72□□□□□ -1.17
SGO1Q08490 AVO2YMR068W 1281 nt7.72□□□□□ -1.17
SGO1Q08490 ATG17YLR423C 1254 nt7.71□□□□□ -1.18
SGO1Q08490 YMR253CYMR253C 1245 nt7.71□□□□□ -1.18
SGO1Q08490 ERV2YPR037C 591 nt7.71□□□□□ -1.18
SGO1Q08490 MSI1YBR195C 1269 nt7.71□□□□□ -1.18
SGO1Q08490 MPH3YJR160C 1809 nt7.71□□□□□ -1.18
SGO1Q08490 snR86snR86 1004 nt7.7□□□□□ -1.18
SGO1Q08490 BNS1YGR230W 414 nt7.7□□□□□ -1.18
SGO1Q08490 YJL009WYJL009W 327 nt7.7□□□□□ -1.18
SGO1Q08490 REC114YMR133W 1287 nt7.7□□□□□ -1.18
SGO1Q08490 YNL067W-AYNL067W-A 147 nt7.7□□□□□ -1.18
SGO1Q08490 MRS4YKR052C 915 nt7.69□□□□□ -1.18
SGO1Q08490 ERR3YMR323W 1314 nt7.69□□□□□ -1.18
SGO1Q08490 ERR1YOR393W 1314 nt7.69□□□□□ -1.18
SGO1Q08490 ERR2YPL281C 1314 nt7.69□□□□□ -1.18
SGO1Q08490 AFG2YLR397C 2343 nt7.69□□□□□ -1.18
SGO1Q08490 YLR184WYLR184W 348 nt7.68□□□□□ -1.18
SGO1Q08490 HXT9YJL219W 1704 nt7.68□□□□□ -1.18
SGO1Q08490 TRR2YHR106W 1029 nt7.67□□□□□ -1.18
SGO1Q08490 LRO1YNR008W 1986 nt7.67□□□□□ -1.18
SGO1Q08490 YER152CYER152C 1332 nt7.67□□□□□ -1.18
SGO1Q08490 ARG7YMR062C 1326 nt7.67□□□□□ -1.18
SGO1Q08490 EHT1YBR177C 1356 nt7.67□□□□□ -1.18
SGO1Q08490 BIO3YNR058W 1443 nt7.67□□□□□ -1.18
SGO1Q08490 YGL081WYGL081W 963 nt7.66□□□□□ -1.18
SGO1Q08490 PRS4YBL068W 981 nt7.66□□□□□ -1.18
SGO1Q08490 YEL034C-AYEL034C-A 603 nt7.65□□□□□ -1.18
SGO1Q08490 CDC3YLR314C 1563 nt7.65□□□□□ -1.18
SGO1Q08490 IDP3YNL009W 1263 nt7.65□□□□□ -1.18
SGO1Q08490 STS1YIR011C 960 nt7.64□□□□□ -1.19
SGO1Q08490 ATO2YNR002C 849 nt7.64□□□□□ -1.19
SGO1Q08490 HIS3YOR202W 663 nt7.64□□□□□ -1.19
SGO1Q08490 WSC4YHL028W 1818 nt7.64□□□□□ -1.19
SGO1Q08490 ARO3YDR035W 1113 nt7.63□□□□□ -1.19
SGO1Q08490 YIL108WYIL108W 2091 nt7.63□□□□□ -1.19
SGO1Q08490 TES1YJR019C 1050 nt7.62□□□□□ -1.19
SGO1Q08490 RCF1YML030W 480 nt7.62□□□□□ -1.19
SGO1Q08490 NDE2YDL085W 1638 nt7.61□□□□□ -1.19
SGO1Q08490 LDB7YBL006C 543 nt7.61□□□□□ -1.19
SGO1Q08490 AQR1YNL065W 1761 nt7.61□□□□□ -1.19
SGO1Q08490 SUN4YNL066W 1263 nt7.6□□□□□ -1.19
SGO1Q08490 HRB1YNL004W 1365 nt7.59□□□□□ -1.19
SGO1Q08490 MET13YGL125W 1803 nt7.59□□□□□ -1.19
SGO1Q08490 ATG22YCL038C 1587 nt7.59□□□□□ -1.19
SGO1Q08490 TIF3YPR163C 1311 nt7.59□□□□□ -1.19
SGO1Q08490 BUR6YER159C 429 nt7.59□□□□□ -1.19
SGO1Q08490 RMA1YKL132C 1293 nt7.59□□□□□ -1.19
SGO1Q08490 RRP43YCR035C 1185 nt7.58□□□□□ -1.2
SGO1Q08490 CYS4YGR155W 1524 nt7.57□□□□□ -1.2
SGO1Q08490 QRI5YLR204W 336 nt7.57□□□□□ -1.2
SGO1Q08490 ERG10YPL028W 1197 nt7.57□□□□□ -1.2
SGO1Q08490 MLS1YNL117W 1665 nt7.57□□□□□ -1.2
SGO1Q08490 CCR4YAL021C 2514 nt7.56□□□□□ -1.2
SGO1Q08490 STE3YKL178C 1413 nt7.56□□□□□ -1.2
SGO1Q08490 PSA1YDL055C 1086 nt7.56□□□□□ -1.2
SGO1Q08490 OPI7YDR360W 435 nt7.56□□□□□ -1.2
SGO1Q08490 AIM20YIL158W 615 nt7.56□□□□□ -1.2
SGO1Q08490 SML1YML058W 315 nt7.56□□□□□ -1.2
SGO1Q08490 YHM2YMR241W 945 nt7.56□□□□□ -1.2
SGO1Q08490 YNL165WYNL165W 1221 nt7.56□□□□□ -1.2
SGO1Q08490 SGF73YGL066W 1974 nt7.56□□□□□ -1.2
SGO1Q08490 POB3YML069W 1659 nt7.56□□□□□ -1.2
SGO1Q08490 PDA1YER178W 1263 nt7.55□□□□□ -1.2
SGO1Q08490 CPR2YHR057C 618 nt7.55□□□□□ -1.2
SGO1Q08490 YNL295WYNL295W 1575 nt7.54□□□□□ -1.2
SGO1Q08490 OSM1YJR051W 1506 nt7.53□□□□□ -1.2
SGO1Q08490 snR30snR30 606 nt7.53□□□□□ -1.2
SGO1Q08490 YNL040WYNL040W 1371 nt7.53□□□□□ -1.2
SGO1Q08490 YLR030WYLR030W 792 nt7.52□□□□□ -1.21
SGO1Q08490 YPL136WYPL136W 369 nt7.52□□□□□ -1.21
SGO1Q08490 SPS1YDR523C 1473 nt7.51□□□□□ -1.21
SGO1Q08490 MRN1YPL184C 1839 nt7.51□□□□□ -1.21
SGO1Q08490 DIP5YPL265W 1827 nt7.51□□□□□ -1.21
SGO1Q08490 PRY2YKR013W 990 nt7.51□□□□□ -1.21
SGO1Q08490 GNP1YDR508C 1992 nt7.51□□□□□ -1.21
SGO1Q08490 FCY22YER060W-A 1593 nt7.5□□□□□ -1.21
SGO1Q08490 NAF1YNL124W 1479 nt7.5□□□□□ -1.21
SGO1Q08490 DCR2YLR361C 1737 nt7.49□□□□□ -1.21
SGO1Q08490 IMD1YAR073W 1212 nt7.49□□□□□ -1.21
SGO1Q08490 YNL140CYNL140C 570 nt7.49□□□□□ -1.21
SGO1Q08490 INP54YOL065C 1155 nt7.49□□□□□ -1.21
SGO1Q08490 YEL023CYEL023C 2049 nt7.49□□□□□ -1.21
SGO1Q08490 RPL2AYFR031C-A 765 nt7.48□□□□□ -1.21
SGO1Q08490 PIL1YGR086C 1020 nt7.48□□□□□ -1.21
SGO1Q08490 YML034C-AYML034C-A 399 nt7.48□□□□□ -1.21
SGO1Q08490 HXT13YEL069C 1695 nt7.47□□□□□ -1.21
SGO1Q08490 WSC3YOL105C 1671 nt7.47□□□□□ -1.21
SGO1Q08490 GLY1YEL046C 1164 nt7.47□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 72.8 ms