Protein–RNA interactions for Protein: Q02543

RPL18A, 60S ribosomal protein L18a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL18AQ02543 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPL18AQ02543 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPL18AQ02543 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPL18AQ02543 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPL18AQ02543 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPL18AQ02543 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPL18AQ02543 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPL18AQ02543 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPL18AQ02543 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPL18AQ02543 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPL18AQ02543 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPL18AQ02543 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPL18AQ02543 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPL18AQ02543 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPL18AQ02543 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPL18AQ02543 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPL18AQ02543 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPL18AQ02543 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPL18AQ02543 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPL18AQ02543 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPL18AQ02543 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
RPL18AQ02543 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPL18AQ02543 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPL18AQ02543 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPL18AQ02543 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPL18AQ02543 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPL18AQ02543 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RPL18AQ02543 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RPL18AQ02543 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
RPL18AQ02543 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPL18AQ02543 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPL18AQ02543 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPL18AQ02543 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPL18AQ02543 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPL18AQ02543 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPL18AQ02543 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPL18AQ02543 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPL18AQ02543 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPL18AQ02543 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPL18AQ02543 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPL18AQ02543 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPL18AQ02543 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPL18AQ02543 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPL18AQ02543 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPL18AQ02543 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPL18AQ02543 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPL18AQ02543 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPL18AQ02543 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPL18AQ02543 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RPL18AQ02543 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RPL18AQ02543 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RPL18AQ02543 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPL18AQ02543 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPL18AQ02543 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPL18AQ02543 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPL18AQ02543 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPL18AQ02543 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPL18AQ02543 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPL18AQ02543 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPL18AQ02543 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPL18AQ02543 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPL18AQ02543 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPL18AQ02543 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPL18AQ02543 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPL18AQ02543 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPL18AQ02543 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPL18AQ02543 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPL18AQ02543 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPL18AQ02543 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPL18AQ02543 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPL18AQ02543 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPL18AQ02543 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPL18AQ02543 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPL18AQ02543 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPL18AQ02543 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPL18AQ02543 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RPL18AQ02543 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPL18AQ02543 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPL18AQ02543 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPL18AQ02543 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPL18AQ02543 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPL18AQ02543 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPL18AQ02543 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPL18AQ02543 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPL18AQ02543 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RPL18AQ02543 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RPL18AQ02543 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RPL18AQ02543 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPL18AQ02543 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPL18AQ02543 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPL18AQ02543 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPL18AQ02543 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPL18AQ02543 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPL18AQ02543 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPL18AQ02543 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPL18AQ02543 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPL18AQ02543 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPL18AQ02543 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPL18AQ02543 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPL18AQ02543 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 164 ms