Protein–RNA interactions for Protein: Q00723

PRP38, Pre-mRNA-splicing factor 38, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PRP38Q00723 INP54YOL065C 1155 nt7.24□□□□□ -1.25
PRP38Q00723 RTC2YBR147W 891 nt7.24□□□□□ -1.25
PRP38Q00723 PET494YNR045W 1470 nt7.24□□□□□ -1.25
PRP38Q00723 PSP2YML017W 1782 nt7.23□□□□□ -1.25
PRP38Q00723 SPR1YOR190W 1338 nt7.23□□□□□ -1.25
PRP38Q00723 TCB1YOR086C 3561 nt7.23□□□□□ -1.25
PRP38Q00723 RRP43YCR035C 1185 nt7.22□□□□□ -1.25
PRP38Q00723 CKI1YLR133W 1749 nt7.21□□□□□ -1.25
PRP38Q00723 YAH1YPL252C 519 nt7.21□□□□□ -1.26
PRP38Q00723 ERR3YMR323W 1314 nt7.21□□□□□ -1.26
PRP38Q00723 ERR1YOR393W 1314 nt7.21□□□□□ -1.26
PRP38Q00723 ERR2YPL281C 1314 nt7.21□□□□□ -1.26
PRP38Q00723 PNS1YOR161C 1620 nt7.2□□□□□ -1.26
PRP38Q00723 CDC23YHR166C 1881 nt7.2□□□□□ -1.26
PRP38Q00723 GET2YER083C 858 nt7.2□□□□□ -1.26
PRP38Q00723 GTS1YGL181W 1191 nt7.2□□□□□ -1.26
PRP38Q00723 YMR253CYMR253C 1245 nt7.2□□□□□ -1.26
PRP38Q00723 CPT1YNL130C 1182 nt7.2□□□□□ -1.26
PRP38Q00723 KAE1YKR038C 1161 nt7.19□□□□□ -1.26
PRP38Q00723 MFG1YDL233W 1377 nt7.19□□□□□ -1.26
PRP38Q00723 TOP3YLR234W 1971 nt7.19□□□□□ -1.26
PRP38Q00723 YDR327WYDR327W 327 nt7.18□□□□□ -1.26
PRP38Q00723 HAC1YFL031W 717 nt7.18□□□□□ -1.26
PRP38Q00723 OPI1YHL020C 1215 nt7.18□□□□□ -1.26
PRP38Q00723 YKR018CYKR018C 2178 nt7.18□□□□□ -1.26
PRP38Q00723 PSA1YDL055C 1086 nt7.17□□□□□ -1.26
PRP38Q00723 PPZ2YDR436W 2133 nt7.17□□□□□ -1.26
PRP38Q00723 SPS1YDR523C 1473 nt7.17□□□□□ -1.26
PRP38Q00723 STF1YDL130W-A 261 nt7.16□□□□□ -1.26
PRP38Q00723 PRY2YKR013W 990 nt7.16□□□□□ -1.26
PRP38Q00723 YPT10YBR264C 600 nt7.16□□□□□ -1.26
PRP38Q00723 MSS51YLR203C 1311 nt7.16□□□□□ -1.26
PRP38Q00723 YJL045WYJL045W 1905 nt7.15□□□□□ -1.26
PRP38Q00723 BDS1YOL164W 1941 nt7.15□□□□□ -1.26
PRP38Q00723 RMD8YFR048W 1989 nt7.15□□□□□ -1.27
PRP38Q00723 PRB1YEL060C 1908 nt7.14□□□□□ -1.27
PRP38Q00723 ERG24YNL280C 1317 nt7.14□□□□□ -1.27
PRP38Q00723 YER137CYER137C 447 nt7.13□□□□□ -1.27
PRP38Q00723 YGL260WYGL260W 231 nt7.13□□□□□ -1.27
PRP38Q00723 PRE5YMR314W 705 nt7.13□□□□□ -1.27
PRP38Q00723 ERV2YPR037C 591 nt7.13□□□□□ -1.27
PRP38Q00723 GUT1YHL032C 2130 nt7.13□□□□□ -1.27
PRP38Q00723 BAP3YDR046C 1815 nt7.13□□□□□ -1.27
PRP38Q00723 CAN1YEL063C 1773 nt7.13□□□□□ -1.27
PRP38Q00723 POB3YML069W 1659 nt7.12□□□□□ -1.27
PRP38Q00723 FLC2YAL053W 2352 nt7.12□□□□□ -1.27
PRP38Q00723 AFG3YER017C 2286 nt7.12□□□□□ -1.27
PRP38Q00723 STS1YIR011C 960 nt7.12□□□□□ -1.27
PRP38Q00723 YKL147CYKL147C 618 nt7.12□□□□□ -1.27
PRP38Q00723 DSC3YOR223W 879 nt7.12□□□□□ -1.27
PRP38Q00723 LIP5YOR196C 1245 nt7.11□□□□□ -1.27
PRP38Q00723 SEC24YIL109C 2781 nt7.11□□□□□ -1.27
PRP38Q00723 YLR358CYLR358C 564 nt7.1□□□□□ -1.27
PRP38Q00723 TOD6YBL054W 1578 nt7.1□□□□□ -1.27
PRP38Q00723 AQR1YNL065W 1761 nt7.1□□□□□ -1.27
PRP38Q00723 OSM1YJR051W 1506 nt7.09□□□□□ -1.27
PRP38Q00723 SKP1YDR328C 585 nt7.08□□□□□ -1.28
PRP38Q00723 YJR142WYJR142W 1029 nt7.07□□□□□ -1.28
PRP38Q00723 SDH8YBR269C 417 nt7.07□□□□□ -1.28
PRP38Q00723 HOG1YLR113W 1308 nt7.06□□□□□ -1.28
PRP38Q00723 NCA3YJL116C 1014 nt7.06□□□□□ -1.28
PRP38Q00723 FCY2YER056C 1602 nt7.05□□□□□ -1.28
PRP38Q00723 BNA3YJL060W 1335 nt7.05□□□□□ -1.28
PRP38Q00723 CRN1YLR429W 1956 nt7.05□□□□□ -1.28
PRP38Q00723 ENB1YOL158C 1821 nt7.05□□□□□ -1.28
PRP38Q00723 NUP57YGR119C 1626 nt7.05□□□□□ -1.28
PRP38Q00723 HRB1YNL004W 1365 nt7.04□□□□□ -1.28
PRP38Q00723 GGC1YDL198C 903 nt7.03□□□□□ -1.28
PRP38Q00723 NDE1YMR145C 1683 nt7.03□□□□□ -1.28
PRP38Q00723 CCR4YAL021C 2514 nt7.02□□□□□ -1.29
PRP38Q00723 RDR1YOR380W 1641 nt7.01□□□□□ -1.29
PRP38Q00723 PMA2YPL036W 2844 nt7.01□□□□□ -1.29
PRP38Q00723 EXG2YDR261C 1689 nt7.01□□□□□ -1.29
PRP38Q00723 NMA2YGR010W 1188 nt7.01□□□□□ -1.29
PRP38Q00723 LOT6YLR011W 576 nt7.01□□□□□ -1.29
PRP38Q00723 CCW12YLR110C 402 nt7.01□□□□□ -1.29
PRP38Q00723 YNR001W-AYNR001W-A 219 nt7.01□□□□□ -1.29
PRP38Q00723 FRT1YOR324C 1809 nt7□□□□□ -1.29
PRP38Q00723 YGL081WYGL081W 963 nt7□□□□□ -1.29
PRP38Q00723 MSI1YBR195C 1269 nt7□□□□□ -1.29
PRP38Q00723 CDC7YDL017W 1524 nt7□□□□□ -1.29
PRP38Q00723 PIL1YGR086C 1020 nt6.99□□□□□ -1.29
PRP38Q00723 MAS2YHR024C 1449 nt6.99□□□□□ -1.29
PRP38Q00723 SUF3tG(CCC)D 72 nt6.98□□□□□ -1.29
PRP38Q00723 SNF4YGL115W 969 nt6.98□□□□□ -1.29
PRP38Q00723 PIH1YHR034C 1035 nt6.98□□□□□ -1.29
PRP38Q00723 YJL213WYJL213W 996 nt6.98□□□□□ -1.29
PRP38Q00723 YMR074CYMR074C 438 nt6.98□□□□□ -1.29
PRP38Q00723 RPR1RPR1 369 nt6.98□□□□□ -1.29
PRP38Q00723 YCR041WYCR041W 333 nt6.97□□□□□ -1.29
PRP38Q00723 CDC3YLR314C 1563 nt6.97□□□□□ -1.29
PRP38Q00723 YML079WYML079W 606 nt6.97□□□□□ -1.29
PRP38Q00723 RFS1YBR052C 633 nt6.97□□□□□ -1.29
PRP38Q00723 PUP2YGR253C 783 nt6.96□□□□□ -1.3
PRP38Q00723 ATP23YNR020C 813 nt6.96□□□□□ -1.3
PRP38Q00723 PGI1YBR196C 1665 nt6.96□□□□□ -1.3
PRP38Q00723 PET117YER058W 324 nt6.95□□□□□ -1.3
PRP38Q00723 ATO2YNR002C 849 nt6.95□□□□□ -1.3
PRP38Q00723 AIM2YAL049C 741 nt6.94□□□□□ -1.3
PRP38Q00723 YPL247CYPL247C 1572 nt6.94□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 13.7 ms