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Protein–RNA interactions for Protein: P47057
SNX4, Sorting nexin-4, yeast
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423 aa
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Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (RIP-Chip)
Gene
UniProt Accession
Gene
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
Detected Interaction
SNX4
P47057
PET494
YNR045W
1470 nt
6.64
□□□□□ -1.35
SNX4
P47057
EFT2
YDR385W
2529 nt
6.63
□□□□□ -1.35
SNX4
P47057
FCY22
YER060W-A
1593 nt
6.63
□□□□□ -1.35
SNX4
P47057
YKL147C
YKL147C
618 nt
6.63
□□□□□ -1.35
SNX4
P47057
RNA170
RNA170
169 nt
6.63
□□□□□ -1.35
SNX4
P47057
ARC35
YNR035C
1029 nt
6.63
□□□□□ -1.35
SNX4
P47057
EFT1
YOR133W
2529 nt
6.63
□□□□□ -1.35
SNX4
P47057
LIP5
YOR196C
1245 nt
6.63
□□□□□ -1.35
SNX4
P47057
ALT2
YDR111C
1524 nt
6.62
□□□□□ -1.35
SNX4
P47057
MCH2
YKL221W
1422 nt
6.62
□□□□□ -1.35
SNX4
P47057
YHR131C
YHR131C
2553 nt
6.62
□□□□□ -1.35
SNX4
P47057
YGL260W
YGL260W
231 nt
6.62
□□□□□ -1.35
SNX4
P47057
CTF8
YHR191C
402 nt
6.62
□□□□□ -1.35
SNX4
P47057
SPE2
YOL052C
1191 nt
6.62
□□□□□ -1.35
SNX4
P47057
PXL1
YKR090W
2121 nt
6.62
□□□□□ -1.35
SNX4
P47057
HXT8
YJL214W
1710 nt
6.62
□□□□□ -1.35
SNX4
P47057
EXG2
YDR261C
1689 nt
6.61
□□□□□ -1.35
SNX4
P47057
YHR033W
YHR033W
1272 nt
6.61
□□□□□ -1.35
SNX4
P47057
AFG3
YER017C
2286 nt
6.6
□□□□□ -1.35
SNX4
P47057
NUP84
YDL116W
2181 nt
6.6
□□□□□ -1.35
SNX4
P47057
snR82
snR82
268 nt
6.6
□□□□□ -1.35
SNX4
P47057
THI4
YGR144W
981 nt
6.6
□□□□□ -1.35
SNX4
P47057
HGH1
YGR187C
1185 nt
6.6
□□□□□ -1.35
SNX4
P47057
CHS7
YHR142W
951 nt
6.6
□□□□□ -1.35
SNX4
P47057
RPL2B
YIL018W
765 nt
6.6
□□□□□ -1.35
SNX4
P47057
YKR012C
YKR012C
378 nt
6.6
□□□□□ -1.35
SNX4
P47057
ERV25
YML012W
636 nt
6.6
□□□□□ -1.35
SNX4
P47057
MNN9
YPL050C
1188 nt
6.6
□□□□□ -1.35
SNX4
P47057
YAH1
YPL252C
519 nt
6.6
□□□□□ -1.35
SNX4
P47057
FET4
YMR319C
1659 nt
6.6
□□□□□ -1.35
SNX4
P47057
LAG2
YOL025W
1983 nt
6.59
□□□□□ -1.35
SNX4
P47057
MTR3
YGR158C
753 nt
6.59
□□□□□ -1.35
SNX4
P47057
TAF13
YML098W
504 nt
6.59
□□□□□ -1.35
SNX4
P47057
KRE1
YNL322C
942 nt
6.59
□□□□□ -1.35
SNX4
P47057
MKK1
YOR231W
1527 nt
6.59
□□□□□ -1.35
SNX4
P47057
CEF1
YMR213W
1773 nt
6.59
□□□□□ -1.35
SNX4
P47057
HAL5
YJL165C
2568 nt
6.58
□□□□□ -1.36
SNX4
P47057
DST1
YGL043W
930 nt
6.58
□□□□□ -1.36
SNX4
P47057
POT1
YIL160C
1254 nt
6.58
□□□□□ -1.36
SNX4
P47057
YLR349W
YLR349W
507 nt
6.58
□□□□□ -1.36
SNX4
P47057
OPI11
YPR044C
354 nt
6.58
□□□□□ -1.36
SNX4
P47057
CPD1
YGR247W
720 nt
6.57
□□□□□ -1.36
SNX4
P47057
ECM38
YLR299W
1983 nt
6.57
□□□□□ -1.36
SNX4
P47057
SDS24
YBR214W
1584 nt
6.57
□□□□□ -1.36
SNX4
P47057
YLL066C
YLL066C
3618 nt
6.56
□□□□□ -1.36
SNX4
P47057
UBP13
YBL067C
2244 nt
6.56
□□□□□ -1.36
SNX4
P47057
ADH7
YCR105W
1086 nt
6.56
□□□□□ -1.36
SNX4
P47057
PUP3
YER094C
618 nt
6.56
□□□□□ -1.36
SNX4
P47057
YFR020W
YFR020W
699 nt
6.56
□□□□□ -1.36
SNX4
P47057
BXI1
YNL305C
894 nt
6.56
□□□□□ -1.36
SNX4
P47057
RHO1
YPR165W
630 nt
6.56
□□□□□ -1.36
SNX4
P47057
ACS1
YAL054C
2142 nt
6.56
□□□□□ -1.36
SNX4
P47057
THI73
YLR004C
1572 nt
6.56
□□□□□ -1.36
SNX4
P47057
YBR241C
YBR241C
1467 nt
6.55
□□□□□ -1.36
SNX4
P47057
YDR215C
YDR215C
414 nt
6.55
□□□□□ -1.36
SNX4
P47057
YAL045C
YAL045C
309 nt
6.55
□□□□□ -1.36
SNX4
P47057
FSH2
YMR222C
672 nt
6.55
□□□□□ -1.36
SNX4
P47057
MET22
YOL064C
1074 nt
6.55
□□□□□ -1.36
SNX4
P47057
SNT309
YPR101W
528 nt
6.55
□□□□□ -1.36
SNX4
P47057
GSH1
YJL101C
2037 nt
6.54
□□□□□ -1.36
SNX4
P47057
YIL055C
YIL055C
1884 nt
6.54
□□□□□ -1.36
SNX4
P47057
HXT15
YDL245C
1704 nt
6.54
□□□□□ -1.36
SNX4
P47057
HXT16
YJR158W
1704 nt
6.54
□□□□□ -1.36
SNX4
P47057
BDF2
YDL070W
1917 nt
6.54
□□□□□ -1.36
SNX4
P47057
ARP3
YJR065C
1350 nt
6.54
□□□□□ -1.36
SNX4
P47057
TUB4
YLR212C
1422 nt
6.53
□□□□□ -1.36
SNX4
P47057
ERS1
YCR075C
783 nt
6.53
□□□□□ -1.36
SNX4
P47057
YPC1
YBR183W
951 nt
6.53
□□□□□ -1.36
SNX4
P47057
SHC1
YER096W
1539 nt
6.53
□□□□□ -1.36
SNX4
P47057
TAH11
YJR046W
1815 nt
6.53
□□□□□ -1.36
SNX4
P47057
HOG1
YLR113W
1308 nt
6.52
□□□□□ -1.37
SNX4
P47057
HSP12
YFL014W
330 nt
6.52
□□□□□ -1.37
SNX4
P47057
PAU15
YIR041W
375 nt
6.52
□□□□□ -1.37
SNX4
P47057
SUR7
YML052W
909 nt
6.52
□□□□□ -1.37
SNX4
P47057
YBL070C
YBL070C
321 nt
6.52
□□□□□ -1.37
SNX4
P47057
RAP1
YNL216W
2484 nt
6.51
□□□□□ -1.37
SNX4
P47057
KNS1
YLL019C
2214 nt
6.5
□□□□□ -1.37
SNX4
P47057
ATG22
YCL038C
1587 nt
6.5
□□□□□ -1.37
SNX4
P47057
GPH1
YPR160W
2709 nt
6.5
□□□□□ -1.37
SNX4
P47057
THP3
YPR045C
1413 nt
6.5
□□□□□ -1.37
SNX4
P47057
ERG24
YNL280C
1317 nt
6.5
□□□□□ -1.37
SNX4
P47057
CCP1
YKR066C
1086 nt
6.49
□□□□□ -1.37
SNX4
P47057
PHO3
YBR092C
1404 nt
6.49
□□□□□ -1.37
SNX4
P47057
AMN1
YBR158W
1650 nt
6.49
□□□□□ -1.37
SNX4
P47057
VHT1
YGR065C
1782 nt
6.48
□□□□□ -1.37
SNX4
P47057
HIS7
YBR248C
1659 nt
6.47
□□□□□ -1.37
SNX4
P47057
ENO1
YGR254W
1314 nt
6.47
□□□□□ -1.37
SNX4
P47057
RIO1
YOR119C
1455 nt
6.47
□□□□□ -1.37
SNX4
P47057
RAD51
YER095W
1203 nt
6.46
□□□□□ -1.38
SNX4
P47057
CCT3
YJL014W
1605 nt
6.46
□□□□□ -1.38
SNX4
P47057
ARG7
YMR062C
1326 nt
6.46
□□□□□ -1.38
SNX4
P47057
ISC1
YER019W
1434 nt
6.45
□□□□□ -1.38
SNX4
P47057
tS(GCU)L
tS(GCU)L
80 nt
6.45
□□□□□ -1.38
SNX4
P47057
YIL077C
YIL077C
963 nt
6.45
□□□□□ -1.38
SNX4
P47057
OPI8
YKR035C
642 nt
6.45
□□□□□ -1.38
SNX4
P47057
NAP1
YKR048C
1254 nt
6.45
□□□□□ -1.38
SNX4
P47057
CSC1
YLR241W
2349 nt
6.44
□□□□□ -1.38
SNX4
P47057
DAL80
YKR034W
810 nt
6.44
□□□□□ -1.38
SNX4
P47057
PRE10
YOR362C
867 nt
6.44
□□□□□ -1.38
SNX4
P47057
HBN1
YCL026C-B
582 nt
6.44
□□□□□ -1.38
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