Protein–RNA interactions for Protein: P40337

VHL, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VHLP40337 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
VHLP40337 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
VHLP40337 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
VHLP40337 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
VHLP40337 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
VHLP40337 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
VHLP40337 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
VHLP40337 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
VHLP40337 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
VHLP40337 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VHLP40337 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
VHLP40337 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
VHLP40337 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
VHLP40337 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
VHLP40337 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
VHLP40337 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
VHLP40337 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
VHLP40337 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
VHLP40337 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VHLP40337 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VHLP40337 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VHLP40337 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
VHLP40337 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VHLP40337 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VHLP40337 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
VHLP40337 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
VHLP40337 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
VHLP40337 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
VHLP40337 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
VHLP40337 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
VHLP40337 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
VHLP40337 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
VHLP40337 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
VHLP40337 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
VHLP40337 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
VHLP40337 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
VHLP40337 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VHLP40337 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
VHLP40337 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
VHLP40337 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
VHLP40337 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
VHLP40337 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
VHLP40337 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VHLP40337 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
VHLP40337 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
VHLP40337 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
VHLP40337 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
VHLP40337 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
VHLP40337 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
VHLP40337 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
VHLP40337 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
VHLP40337 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
VHLP40337 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
VHLP40337 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
VHLP40337 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
VHLP40337 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
VHLP40337 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
VHLP40337 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
VHLP40337 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
VHLP40337 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
VHLP40337 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
VHLP40337 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
VHLP40337 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
VHLP40337 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
VHLP40337 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
VHLP40337 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
VHLP40337 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
VHLP40337 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
VHLP40337 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
VHLP40337 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
VHLP40337 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
VHLP40337 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
VHLP40337 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
VHLP40337 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
VHLP40337 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
VHLP40337 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
VHLP40337 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
VHLP40337 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
VHLP40337 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
VHLP40337 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
VHLP40337 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
VHLP40337 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
VHLP40337 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
VHLP40337 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
VHLP40337 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
VHLP40337 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
VHLP40337 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
VHLP40337 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
VHLP40337 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
VHLP40337 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
VHLP40337 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
VHLP40337 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VHLP40337 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
VHLP40337 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VHLP40337 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
VHLP40337 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
VHLP40337 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
VHLP40337 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VHLP40337 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
VHLP40337 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms