Protein–RNA interactions for Protein: P23458

JAK1, Tyrosine-protein kinase JAK1, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JAK1P23458 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
JAK1P23458 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
JAK1P23458 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
JAK1P23458 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
JAK1P23458 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
JAK1P23458 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
JAK1P23458 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
JAK1P23458 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
JAK1P23458 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
JAK1P23458 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
JAK1P23458 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
JAK1P23458 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
JAK1P23458 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
JAK1P23458 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
JAK1P23458 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
JAK1P23458 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
JAK1P23458 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
JAK1P23458 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
JAK1P23458 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
JAK1P23458 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
JAK1P23458 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
JAK1P23458 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
JAK1P23458 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
JAK1P23458 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
JAK1P23458 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
JAK1P23458 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
JAK1P23458 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
JAK1P23458 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
JAK1P23458 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
JAK1P23458 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
JAK1P23458 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
JAK1P23458 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
JAK1P23458 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
JAK1P23458 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
JAK1P23458 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
JAK1P23458 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
JAK1P23458 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
JAK1P23458 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
JAK1P23458 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
JAK1P23458 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
JAK1P23458 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
JAK1P23458 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
JAK1P23458 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
JAK1P23458 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
JAK1P23458 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
JAK1P23458 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
JAK1P23458 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
JAK1P23458 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
JAK1P23458 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
JAK1P23458 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
JAK1P23458 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
JAK1P23458 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
JAK1P23458 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
JAK1P23458 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
JAK1P23458 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
JAK1P23458 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
JAK1P23458 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
JAK1P23458 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
JAK1P23458 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
JAK1P23458 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
JAK1P23458 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
JAK1P23458 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
JAK1P23458 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
JAK1P23458 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
JAK1P23458 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
JAK1P23458 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
JAK1P23458 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
JAK1P23458 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
JAK1P23458 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
JAK1P23458 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
JAK1P23458 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
JAK1P23458 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
JAK1P23458 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
JAK1P23458 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
JAK1P23458 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
JAK1P23458 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
JAK1P23458 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
JAK1P23458 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
JAK1P23458 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
JAK1P23458 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
JAK1P23458 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
JAK1P23458 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
JAK1P23458 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
JAK1P23458 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
JAK1P23458 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
JAK1P23458 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
JAK1P23458 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
JAK1P23458 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
JAK1P23458 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
JAK1P23458 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
JAK1P23458 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
JAK1P23458 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
JAK1P23458 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
JAK1P23458 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
JAK1P23458 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
JAK1P23458 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
JAK1P23458 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
JAK1P23458 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
JAK1P23458 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
JAK1P23458 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms