Protein–RNA interactions for Protein: O14843

FFAR3, Free fatty acid receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FFAR3O14843 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FFAR3O14843 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FFAR3O14843 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FFAR3O14843 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FFAR3O14843 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FFAR3O14843 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FFAR3O14843 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FFAR3O14843 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FFAR3O14843 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FFAR3O14843 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FFAR3O14843 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
FFAR3O14843 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FFAR3O14843 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FFAR3O14843 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FFAR3O14843 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
FFAR3O14843 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FFAR3O14843 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FFAR3O14843 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FFAR3O14843 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FFAR3O14843 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FFAR3O14843 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FFAR3O14843 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FFAR3O14843 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FFAR3O14843 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FFAR3O14843 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FFAR3O14843 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FFAR3O14843 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FFAR3O14843 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FFAR3O14843 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FFAR3O14843 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FFAR3O14843 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FFAR3O14843 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FFAR3O14843 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FFAR3O14843 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FFAR3O14843 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FFAR3O14843 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FFAR3O14843 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FFAR3O14843 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FFAR3O14843 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FFAR3O14843 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FFAR3O14843 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FFAR3O14843 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
FFAR3O14843 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
FFAR3O14843 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FFAR3O14843 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FFAR3O14843 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FFAR3O14843 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FFAR3O14843 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FFAR3O14843 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FFAR3O14843 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
FFAR3O14843 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
FFAR3O14843 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
FFAR3O14843 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
FFAR3O14843 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
FFAR3O14843 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
FFAR3O14843 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FFAR3O14843 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FFAR3O14843 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FFAR3O14843 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FFAR3O14843 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FFAR3O14843 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FFAR3O14843 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
FFAR3O14843 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
FFAR3O14843 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FFAR3O14843 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FFAR3O14843 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FFAR3O14843 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FFAR3O14843 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FFAR3O14843 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FFAR3O14843 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FFAR3O14843 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FFAR3O14843 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FFAR3O14843 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FFAR3O14843 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FFAR3O14843 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FFAR3O14843 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FFAR3O14843 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FFAR3O14843 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FFAR3O14843 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
FFAR3O14843 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FFAR3O14843 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FFAR3O14843 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FFAR3O14843 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FFAR3O14843 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FFAR3O14843 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FFAR3O14843 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FFAR3O14843 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FFAR3O14843 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FFAR3O14843 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FFAR3O14843 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
FFAR3O14843 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
FFAR3O14843 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
FFAR3O14843 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
FFAR3O14843 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
FFAR3O14843 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
FFAR3O14843 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
FFAR3O14843 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
FFAR3O14843 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
FFAR3O14843 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FFAR3O14843 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1093.7 ms