Protein–RNA interactions for Protein: H3BP13

TRAPPC2L, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2LH3BP13 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAPPC2LH3BP13 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAPPC2LH3BP13 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAPPC2LH3BP13 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAPPC2LH3BP13 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAPPC2LH3BP13 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAPPC2LH3BP13 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAPPC2LH3BP13 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAPPC2LH3BP13 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRAPPC2LH3BP13 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRAPPC2LH3BP13 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRAPPC2LH3BP13 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRAPPC2LH3BP13 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRAPPC2LH3BP13 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRAPPC2LH3BP13 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TRAPPC2LH3BP13 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
TRAPPC2LH3BP13 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
TRAPPC2LH3BP13 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAPPC2LH3BP13 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAPPC2LH3BP13 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAPPC2LH3BP13 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAPPC2LH3BP13 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAPPC2LH3BP13 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAPPC2LH3BP13 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAPPC2LH3BP13 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRAPPC2LH3BP13 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TRAPPC2LH3BP13 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRAPPC2LH3BP13 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRAPPC2LH3BP13 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRAPPC2LH3BP13 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRAPPC2LH3BP13 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRAPPC2LH3BP13 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRAPPC2LH3BP13 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRAPPC2LH3BP13 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRAPPC2LH3BP13 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TRAPPC2LH3BP13 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRAPPC2LH3BP13 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRAPPC2LH3BP13 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRAPPC2LH3BP13 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAPPC2LH3BP13 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAPPC2LH3BP13 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAPPC2LH3BP13 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAPPC2LH3BP13 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAPPC2LH3BP13 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAPPC2LH3BP13 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAPPC2LH3BP13 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAPPC2LH3BP13 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAPPC2LH3BP13 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAPPC2LH3BP13 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAPPC2LH3BP13 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAPPC2LH3BP13 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAPPC2LH3BP13 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAPPC2LH3BP13 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAPPC2LH3BP13 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAPPC2LH3BP13 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAPPC2LH3BP13 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAPPC2LH3BP13 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAPPC2LH3BP13 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAPPC2LH3BP13 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAPPC2LH3BP13 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAPPC2LH3BP13 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAPPC2LH3BP13 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAPPC2LH3BP13 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAPPC2LH3BP13 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAPPC2LH3BP13 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAPPC2LH3BP13 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAPPC2LH3BP13 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAPPC2LH3BP13 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAPPC2LH3BP13 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAPPC2LH3BP13 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAPPC2LH3BP13 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAPPC2LH3BP13 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAPPC2LH3BP13 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAPPC2LH3BP13 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAPPC2LH3BP13 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAPPC2LH3BP13 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAPPC2LH3BP13 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAPPC2LH3BP13 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAPPC2LH3BP13 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAPPC2LH3BP13 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRAPPC2LH3BP13 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TRAPPC2LH3BP13 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAPPC2LH3BP13 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAPPC2LH3BP13 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAPPC2LH3BP13 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAPPC2LH3BP13 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAPPC2LH3BP13 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAPPC2LH3BP13 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAPPC2LH3BP13 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAPPC2LH3BP13 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAPPC2LH3BP13 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAPPC2LH3BP13 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRAPPC2LH3BP13 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRAPPC2LH3BP13 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRAPPC2LH3BP13 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRAPPC2LH3BP13 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRAPPC2LH3BP13 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRAPPC2LH3BP13 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAPPC2LH3BP13 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAPPC2LH3BP13 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.4 ms