Protein–RNA interactions for Protein: A6NGN4

PRAMEF25, PRAME family member 25, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF25A6NGN4 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRAMEF25A6NGN4 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRAMEF25A6NGN4 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRAMEF25A6NGN4 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRAMEF25A6NGN4 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRAMEF25A6NGN4 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PRAMEF25A6NGN4 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRAMEF25A6NGN4 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRAMEF25A6NGN4 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PRAMEF25A6NGN4 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PRAMEF25A6NGN4 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRAMEF25A6NGN4 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRAMEF25A6NGN4 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRAMEF25A6NGN4 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRAMEF25A6NGN4 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRAMEF25A6NGN4 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PRAMEF25A6NGN4 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PRAMEF25A6NGN4 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PRAMEF25A6NGN4 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRAMEF25A6NGN4 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRAMEF25A6NGN4 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRAMEF25A6NGN4 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRAMEF25A6NGN4 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRAMEF25A6NGN4 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRAMEF25A6NGN4 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRAMEF25A6NGN4 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRAMEF25A6NGN4 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRAMEF25A6NGN4 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRAMEF25A6NGN4 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRAMEF25A6NGN4 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRAMEF25A6NGN4 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRAMEF25A6NGN4 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRAMEF25A6NGN4 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRAMEF25A6NGN4 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRAMEF25A6NGN4 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRAMEF25A6NGN4 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRAMEF25A6NGN4 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRAMEF25A6NGN4 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRAMEF25A6NGN4 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRAMEF25A6NGN4 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRAMEF25A6NGN4 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PRAMEF25A6NGN4 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRAMEF25A6NGN4 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRAMEF25A6NGN4 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRAMEF25A6NGN4 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PRAMEF25A6NGN4 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRAMEF25A6NGN4 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRAMEF25A6NGN4 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRAMEF25A6NGN4 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRAMEF25A6NGN4 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRAMEF25A6NGN4 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRAMEF25A6NGN4 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRAMEF25A6NGN4 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRAMEF25A6NGN4 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRAMEF25A6NGN4 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRAMEF25A6NGN4 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRAMEF25A6NGN4 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRAMEF25A6NGN4 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRAMEF25A6NGN4 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRAMEF25A6NGN4 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRAMEF25A6NGN4 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRAMEF25A6NGN4 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRAMEF25A6NGN4 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRAMEF25A6NGN4 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRAMEF25A6NGN4 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRAMEF25A6NGN4 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRAMEF25A6NGN4 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRAMEF25A6NGN4 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PRAMEF25A6NGN4 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PRAMEF25A6NGN4 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PRAMEF25A6NGN4 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PRAMEF25A6NGN4 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PRAMEF25A6NGN4 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PRAMEF25A6NGN4 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PRAMEF25A6NGN4 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PRAMEF25A6NGN4 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PRAMEF25A6NGN4 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRAMEF25A6NGN4 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRAMEF25A6NGN4 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRAMEF25A6NGN4 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRAMEF25A6NGN4 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRAMEF25A6NGN4 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRAMEF25A6NGN4 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PRAMEF25A6NGN4 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRAMEF25A6NGN4 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRAMEF25A6NGN4 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRAMEF25A6NGN4 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRAMEF25A6NGN4 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRAMEF25A6NGN4 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRAMEF25A6NGN4 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRAMEF25A6NGN4 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRAMEF25A6NGN4 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRAMEF25A6NGN4 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRAMEF25A6NGN4 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRAMEF25A6NGN4 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRAMEF25A6NGN4 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PRAMEF25A6NGN4 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRAMEF25A6NGN4 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRAMEF25A6NGN4 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRAMEF25A6NGN4 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.2 ms