Protein–RNA interactions for Protein: A6NFA1

TRABD2B, Metalloprotease TIKI2, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRABD2BA6NFA1 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRABD2BA6NFA1 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRABD2BA6NFA1 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRABD2BA6NFA1 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRABD2BA6NFA1 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRABD2BA6NFA1 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TRABD2BA6NFA1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRABD2BA6NFA1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRABD2BA6NFA1 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRABD2BA6NFA1 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRABD2BA6NFA1 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRABD2BA6NFA1 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRABD2BA6NFA1 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRABD2BA6NFA1 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRABD2BA6NFA1 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRABD2BA6NFA1 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRABD2BA6NFA1 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRABD2BA6NFA1 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRABD2BA6NFA1 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRABD2BA6NFA1 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRABD2BA6NFA1 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRABD2BA6NFA1 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TRABD2BA6NFA1 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TRABD2BA6NFA1 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRABD2BA6NFA1 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRABD2BA6NFA1 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRABD2BA6NFA1 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRABD2BA6NFA1 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRABD2BA6NFA1 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRABD2BA6NFA1 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRABD2BA6NFA1 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TRABD2BA6NFA1 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRABD2BA6NFA1 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRABD2BA6NFA1 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRABD2BA6NFA1 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRABD2BA6NFA1 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRABD2BA6NFA1 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRABD2BA6NFA1 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRABD2BA6NFA1 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRABD2BA6NFA1 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRABD2BA6NFA1 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TRABD2BA6NFA1 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRABD2BA6NFA1 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRABD2BA6NFA1 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRABD2BA6NFA1 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRABD2BA6NFA1 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRABD2BA6NFA1 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRABD2BA6NFA1 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRABD2BA6NFA1 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRABD2BA6NFA1 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRABD2BA6NFA1 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRABD2BA6NFA1 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRABD2BA6NFA1 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TRABD2BA6NFA1 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRABD2BA6NFA1 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRABD2BA6NFA1 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRABD2BA6NFA1 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TRABD2BA6NFA1 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
TRABD2BA6NFA1 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRABD2BA6NFA1 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRABD2BA6NFA1 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TRABD2BA6NFA1 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRABD2BA6NFA1 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRABD2BA6NFA1 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRABD2BA6NFA1 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRABD2BA6NFA1 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRABD2BA6NFA1 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRABD2BA6NFA1 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRABD2BA6NFA1 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRABD2BA6NFA1 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRABD2BA6NFA1 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRABD2BA6NFA1 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRABD2BA6NFA1 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRABD2BA6NFA1 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TRABD2BA6NFA1 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRABD2BA6NFA1 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TRABD2BA6NFA1 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRABD2BA6NFA1 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRABD2BA6NFA1 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRABD2BA6NFA1 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TRABD2BA6NFA1 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRABD2BA6NFA1 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRABD2BA6NFA1 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRABD2BA6NFA1 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRABD2BA6NFA1 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRABD2BA6NFA1 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRABD2BA6NFA1 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRABD2BA6NFA1 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRABD2BA6NFA1 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRABD2BA6NFA1 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRABD2BA6NFA1 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TRABD2BA6NFA1 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRABD2BA6NFA1 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRABD2BA6NFA1 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRABD2BA6NFA1 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRABD2BA6NFA1 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TRABD2BA6NFA1 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRABD2BA6NFA1 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRABD2BA6NFA1 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
TRABD2BA6NFA1 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.5 ms