Protein–RNA interactions for Protein: A5D8W1

CFAP69, Cilia- and flagella-associated protein 69, humanhuman

Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP69A5D8W1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CFAP69A5D8W1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CFAP69A5D8W1 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CFAP69A5D8W1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CFAP69A5D8W1 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CFAP69A5D8W1 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CFAP69A5D8W1 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CFAP69A5D8W1 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CFAP69A5D8W1 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CFAP69A5D8W1 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CFAP69A5D8W1 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CFAP69A5D8W1 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CFAP69A5D8W1 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CFAP69A5D8W1 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CFAP69A5D8W1 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CFAP69A5D8W1 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CFAP69A5D8W1 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CFAP69A5D8W1 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CFAP69A5D8W1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CFAP69A5D8W1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CFAP69A5D8W1 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CFAP69A5D8W1 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CFAP69A5D8W1 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CFAP69A5D8W1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CFAP69A5D8W1 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CFAP69A5D8W1 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CFAP69A5D8W1 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CFAP69A5D8W1 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CFAP69A5D8W1 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CFAP69A5D8W1 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CFAP69A5D8W1 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CFAP69A5D8W1 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
CFAP69A5D8W1 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
CFAP69A5D8W1 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
CFAP69A5D8W1 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CFAP69A5D8W1 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CFAP69A5D8W1 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CFAP69A5D8W1 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CFAP69A5D8W1 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CFAP69A5D8W1 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CFAP69A5D8W1 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CFAP69A5D8W1 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CFAP69A5D8W1 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CFAP69A5D8W1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CFAP69A5D8W1 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CFAP69A5D8W1 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CFAP69A5D8W1 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CFAP69A5D8W1 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CFAP69A5D8W1 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CFAP69A5D8W1 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CFAP69A5D8W1 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CFAP69A5D8W1 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CFAP69A5D8W1 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CFAP69A5D8W1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CFAP69A5D8W1 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CFAP69A5D8W1 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CFAP69A5D8W1 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CFAP69A5D8W1 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CFAP69A5D8W1 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CFAP69A5D8W1 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CFAP69A5D8W1 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CFAP69A5D8W1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CFAP69A5D8W1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CFAP69A5D8W1 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CFAP69A5D8W1 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CFAP69A5D8W1 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CFAP69A5D8W1 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CFAP69A5D8W1 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CFAP69A5D8W1 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CFAP69A5D8W1 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CFAP69A5D8W1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CFAP69A5D8W1 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CFAP69A5D8W1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CFAP69A5D8W1 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CFAP69A5D8W1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CFAP69A5D8W1 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CFAP69A5D8W1 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CFAP69A5D8W1 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CFAP69A5D8W1 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CFAP69A5D8W1 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CFAP69A5D8W1 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CFAP69A5D8W1 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CFAP69A5D8W1 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CFAP69A5D8W1 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CFAP69A5D8W1 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CFAP69A5D8W1 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CFAP69A5D8W1 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CFAP69A5D8W1 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CFAP69A5D8W1 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CFAP69A5D8W1 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CFAP69A5D8W1 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CFAP69A5D8W1 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CFAP69A5D8W1 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CFAP69A5D8W1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CFAP69A5D8W1 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CFAP69A5D8W1 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CFAP69A5D8W1 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CFAP69A5D8W1 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CFAP69A5D8W1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CFAP69A5D8W1 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms