Protein–RNA interactions for Protein: A5D8W1

CFAP69, Cilia- and flagella-associated protein 69, humanhuman

Predictions only

Length 941 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP69A5D8W1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CFAP69A5D8W1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CFAP69A5D8W1 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CFAP69A5D8W1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CFAP69A5D8W1 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CFAP69A5D8W1 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CFAP69A5D8W1 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CFAP69A5D8W1 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CFAP69A5D8W1 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CFAP69A5D8W1 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CFAP69A5D8W1 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CFAP69A5D8W1 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CFAP69A5D8W1 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CFAP69A5D8W1 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CFAP69A5D8W1 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CFAP69A5D8W1 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CFAP69A5D8W1 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CFAP69A5D8W1 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CFAP69A5D8W1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CFAP69A5D8W1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CFAP69A5D8W1 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CFAP69A5D8W1 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CFAP69A5D8W1 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CFAP69A5D8W1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CFAP69A5D8W1 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CFAP69A5D8W1 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CFAP69A5D8W1 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CFAP69A5D8W1 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CFAP69A5D8W1 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CFAP69A5D8W1 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CFAP69A5D8W1 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CFAP69A5D8W1 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
CFAP69A5D8W1 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
CFAP69A5D8W1 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
CFAP69A5D8W1 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CFAP69A5D8W1 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CFAP69A5D8W1 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CFAP69A5D8W1 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CFAP69A5D8W1 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CFAP69A5D8W1 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CFAP69A5D8W1 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CFAP69A5D8W1 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CFAP69A5D8W1 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CFAP69A5D8W1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CFAP69A5D8W1 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CFAP69A5D8W1 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CFAP69A5D8W1 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CFAP69A5D8W1 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CFAP69A5D8W1 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CFAP69A5D8W1 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CFAP69A5D8W1 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CFAP69A5D8W1 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CFAP69A5D8W1 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CFAP69A5D8W1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CFAP69A5D8W1 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CFAP69A5D8W1 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CFAP69A5D8W1 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CFAP69A5D8W1 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CFAP69A5D8W1 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CFAP69A5D8W1 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CFAP69A5D8W1 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CFAP69A5D8W1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CFAP69A5D8W1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CFAP69A5D8W1 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CFAP69A5D8W1 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CFAP69A5D8W1 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CFAP69A5D8W1 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CFAP69A5D8W1 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CFAP69A5D8W1 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CFAP69A5D8W1 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CFAP69A5D8W1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CFAP69A5D8W1 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CFAP69A5D8W1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CFAP69A5D8W1 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CFAP69A5D8W1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CFAP69A5D8W1 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CFAP69A5D8W1 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CFAP69A5D8W1 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CFAP69A5D8W1 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CFAP69A5D8W1 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CFAP69A5D8W1 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CFAP69A5D8W1 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CFAP69A5D8W1 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CFAP69A5D8W1 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CFAP69A5D8W1 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CFAP69A5D8W1 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CFAP69A5D8W1 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CFAP69A5D8W1 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CFAP69A5D8W1 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CFAP69A5D8W1 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CFAP69A5D8W1 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CFAP69A5D8W1 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CFAP69A5D8W1 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CFAP69A5D8W1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CFAP69A5D8W1 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CFAP69A5D8W1 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CFAP69A5D8W1 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CFAP69A5D8W1 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CFAP69A5D8W1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CFAP69A5D8W1 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms