RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000638132.1

5_8S_rRNA.5-201, humanhuman

BASIC

Gene 5_8S_rRNA, Length 152 nt, Biotype rRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5_8S_rRNA.5-201ENST00000638132 NISCHQ9Y2I1 1504 aa26.18■■□□□ 1.78
5_8S_rRNA.5-201ENST00000638132 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa23.3■■□□□ 1.32
5_8S_rRNA.5-201ENST00000638132 ABCC9O60706 1549 aa22.57■■□□□ 1.2
5_8S_rRNA.5-201ENST00000638132 NACADO15069 1562 aa21.88■■□□□ 1.09
5_8S_rRNA.5-201ENST00000638132 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa21.87■■□□□ 1.09
5_8S_rRNA.5-201ENST00000638132 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
5_8S_rRNA.5-201ENST00000638132 MYO15BQ96JP2 1530 aa21.85■■□□□ 1.09
5_8S_rRNA.5-201ENST00000638132 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa21.76■■□□□ 1.07
5_8S_rRNA.5-201ENST00000638132 DCAF8L2P0C7V8 631 aa21.66■■□□□ 1.06
5_8S_rRNA.5-201ENST00000638132 UNC13AQ9UPW8 1703 aa21.24■□□□□ 0.99
5_8S_rRNA.5-201ENST00000638132 SCRIBQ14160 1630 aa21.15■□□□□ 0.98
5_8S_rRNA.5-201ENST00000638132 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa21.13■□□□□ 0.97
5_8S_rRNA.5-201ENST00000638132 BICRAQ9NZM4 1560 aa21.13■□□□□ 0.97
5_8S_rRNA.5-201ENST00000638132 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP21.05■□□□□ 0.96
5_8S_rRNA.5-201ENST00000638132 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
5_8S_rRNA.5-201ENST00000638132 DNAJC5BQ9UF47 199 aa20.55■□□□□ 0.88
5_8S_rRNA.5-201ENST00000638132 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa20.45■□□□□ 0.87
5_8S_rRNA.5-201ENST00000638132 CECR2Q9BXF3 1484 aa20.33■□□□□ 0.85
5_8S_rRNA.5-201ENST00000638132 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.84
5_8S_rRNA.5-201ENST00000638132 SMARCA4P51532 1647 aa20.29■□□□□ 0.84
5_8S_rRNA.5-201ENST00000638132 SMARCA2P51531 1590 aa20.2■□□□□ 0.82
5_8S_rRNA.5-201ENST00000638132 NCAPD3P42695 1498 aa20.17■□□□□ 0.82
5_8S_rRNA.5-201ENST00000638132 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa20.16■□□□□ 0.82
5_8S_rRNA.5-201ENST00000638132 PEG3Q9GZU2 1588 aa20.16■□□□□ 0.82
5_8S_rRNA.5-201ENST00000638132 MROH2BQ7Z745 1585 aa20.12■□□□□ 0.81
5_8S_rRNA.5-201ENST00000638132 HMGXB3Q12766 1538 aa20.12■□□□□ 0.81
5_8S_rRNA.5-201ENST00000638132 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP20.01■□□□□ 0.79
5_8S_rRNA.5-201ENST00000638132 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP19.94■□□□□ 0.78
5_8S_rRNA.5-201ENST00000638132 WIZO95785 1651 aa19.87■□□□□ 0.77
5_8S_rRNA.5-201ENST00000638132 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP19.78■□□□□ 0.76
5_8S_rRNA.5-201ENST00000638132 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa19.63■□□□□ 0.73
5_8S_rRNA.5-201ENST00000638132 CADPSQ9ULU8 1353 aa19.56■□□□□ 0.72
5_8S_rRNA.5-201ENST00000638132 NESP48681 1621 aa19.54■□□□□ 0.72
5_8S_rRNA.5-201ENST00000638132 ERCC6Q03468 1493 aa19.52■□□□□ 0.72
5_8S_rRNA.5-201ENST00000638132 PDS5BQ9NTI5 1447 aa19.5■□□□□ 0.71
5_8S_rRNA.5-201ENST00000638132 CFTRP13569 1480 aa19.48■□□□□ 0.71
5_8S_rRNA.5-201ENST00000638132 CCDC88BA6NC98 1476 aa19.48■□□□□ 0.71
5_8S_rRNA.5-201ENST00000638132 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP19.38■□□□□ 0.69
5_8S_rRNA.5-201ENST00000638132 CUX2O14529 1486 aa19.35■□□□□ 0.69
5_8S_rRNA.5-201ENST00000638132 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa19.33■□□□□ 0.69
5_8S_rRNA.5-201ENST00000638132 FANCD2Q9BXW9 1451 aa19.33■□□□□ 0.68
5_8S_rRNA.5-201ENST00000638132 CEP164Q9UPV0 1460 aa19.33■□□□□ 0.68
5_8S_rRNA.5-201ENST00000638132 PRDM2Q13029 1718 aa19.32■□□□□ 0.68
5_8S_rRNA.5-201ENST00000638132 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP19.32■□□□□ 0.68
5_8S_rRNA.5-201ENST00000638132 MRC2Q9UBG0 1479 aa19.28■□□□□ 0.68
5_8S_rRNA.5-201ENST00000638132 WDR62O43379 1518 aa19.22■□□□□ 0.67
5_8S_rRNA.5-201ENST00000638132 ABCC8Q09428 1581 aa19.11■□□□□ 0.65
5_8S_rRNA.5-201ENST00000638132 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP19.1■□□□□ 0.65
5_8S_rRNA.5-201ENST00000638132 DNMBPQ6XZF7 1577 aa19.04■□□□□ 0.64
5_8S_rRNA.5-201ENST00000638132 TOPBP1Q92547 1522 aa19.02■□□□□ 0.64
5_8S_rRNA.5-201ENST00000638132 IFT140Q96RY7 1462 aa18.93■□□□□ 0.62
5_8S_rRNA.5-201ENST00000638132 CUX1P39880 1505 aa18.89■□□□□ 0.61
5_8S_rRNA.5-201ENST00000638132 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP18.88■□□□□ 0.61
5_8S_rRNA.5-201ENST00000638132 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP18.83■□□□□ 0.61
5_8S_rRNA.5-201ENST00000638132 FGD5Q6ZNL6 1462 aa18.83■□□□□ 0.6
5_8S_rRNA.5-201ENST00000638132 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP18.81■□□□□ 0.6
5_8S_rRNA.5-201ENST00000638132 WDR97A6NE52 1622 aa18.79■□□□□ 0.6
5_8S_rRNA.5-201ENST00000638132 TOP2BQ02880 1626 aa18.79■□□□□ 0.6
5_8S_rRNA.5-201ENST00000638132 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa18.78■□□□□ 0.6
5_8S_rRNA.5-201ENST00000638132 SOGA1O94964 1423 aa18.77■□□□□ 0.6
5_8S_rRNA.5-201ENST00000638132 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP18.74■□□□□ 0.59
5_8S_rRNA.5-201ENST00000638132 SYNJ1O43426 1573 aa18.73■□□□□ 0.59
5_8S_rRNA.5-201ENST00000638132 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP18.72■□□□□ 0.59
5_8S_rRNA.5-201ENST00000638132 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa18.71■□□□□ 0.59
5_8S_rRNA.5-201ENST00000638132 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa18.69■□□□□ 0.58
5_8S_rRNA.5-201ENST00000638132 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP18.64■□□□□ 0.57
5_8S_rRNA.5-201ENST00000638132 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP18.61■□□□□ 0.57
5_8S_rRNA.5-201ENST00000638132 GRIN2BQ13224 1484 aa18.6■□□□□ 0.57
5_8S_rRNA.5-201ENST00000638132 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa18.6■□□□□ 0.57
5_8S_rRNA.5-201ENST00000638132 GAPVD1Q14C86 1478 aa18.58■□□□□ 0.56
5_8S_rRNA.5-201ENST00000638132 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP18.57■□□□□ 0.56
5_8S_rRNA.5-201ENST00000638132 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa18.55■□□□□ 0.56
5_8S_rRNA.5-201ENST00000638132 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa18.52■□□□□ 0.55
5_8S_rRNA.5-201ENST00000638132 PBRM1Q86U86 1689 aa18.5■□□□□ 0.55
5_8S_rRNA.5-201ENST00000638132 ERICH3Q5RHP9 1530 aa18.49■□□□□ 0.55
5_8S_rRNA.5-201ENST00000638132 SYNJ2O15056 1496 aa18.47■□□□□ 0.55
5_8S_rRNA.5-201ENST00000638132 OSCARQ8IYS5 282 aa18.47■□□□□ 0.55
5_8S_rRNA.5-201ENST00000638132 KIF27Q86VH2 1401 aa18.46■□□□□ 0.55
5_8S_rRNA.5-201ENST00000638132 CHD1O14646 1710 aa18.42■□□□□ 0.54
5_8S_rRNA.5-201ENST00000638132 ADAMTS12P58397 1594 aa18.42■□□□□ 0.54
5_8S_rRNA.5-201ENST00000638132 FHAD1B1AJZ9 1412 aa18.4■□□□□ 0.54
5_8S_rRNA.5-201ENST00000638132 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP18.39■□□□□ 0.53
5_8S_rRNA.5-201ENST00000638132 TRIM41Q8WV44 630 aa18.38■□□□□ 0.53
5_8S_rRNA.5-201ENST00000638132 FBLN2P98095 1184 aa18.37■□□□□ 0.53
5_8S_rRNA.5-201ENST00000638132 GRIN2AQ12879 1464 aa18.34■□□□□ 0.53
5_8S_rRNA.5-201ENST00000638132 CUL7Q14999 1698 aa18.34■□□□□ 0.53
5_8S_rRNA.5-201ENST00000638132 IGF1RP08069 1367 aa18.31■□□□□ 0.52
5_8S_rRNA.5-201ENST00000638132 CLASP1Q7Z460 1538 aa18.29■□□□□ 0.52
5_8S_rRNA.5-201ENST00000638132 NUP160Q12769 1436 aa18.28■□□□□ 0.52
5_8S_rRNA.5-201ENST00000638132 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa18.22■□□□□ 0.51
5_8S_rRNA.5-201ENST00000638132 EEA1Q15075 1411 aa18.21■□□□□ 0.51
5_8S_rRNA.5-201ENST00000638132 CEP170Q5SW79 1584 aa18.21■□□□□ 0.51
5_8S_rRNA.5-201ENST00000638132 ARHGEF11O15085 1522 aa18.2■□□□□ 0.5
5_8S_rRNA.5-201ENST00000638132 CHIC1Q5VXU3 224 aa18.18■□□□□ 0.5
5_8S_rRNA.5-201ENST00000638132 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa18.16■□□□□ 0.5
5_8S_rRNA.5-201ENST00000638132 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa18.15■□□□□ 0.5
5_8S_rRNA.5-201ENST00000638132 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa18.15■□□□□ 0.5
5_8S_rRNA.5-201ENST00000638132 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa18.15■□□□□ 0.5
5_8S_rRNA.5-201ENST00000638132 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa18.14■□□□□ 0.5
5_8S_rRNA.5-201ENST00000638132 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 288.2 ms