RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000630746.2

PCBP1-AS1-365, PCBP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5

Gene PCBP1-AS1, Length 932 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP1-AS1-365ENST00000630746 NISCHQ9Y2I1 1504 aa22.01■■□□□ 1.11
PCBP1-AS1-365ENST00000630746 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
PCBP1-AS1-365ENST00000630746 CHIC1Q5VXU3 224 aa21.08■□□□□ 0.97
PCBP1-AS1-365ENST00000630746 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa19.72■□□□□ 0.75
PCBP1-AS1-365ENST00000630746 ABCC9O60706 1549 aa19.44■□□□□ 0.7
PCBP1-AS1-365ENST00000630746 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP18.89■□□□□ 0.61
PCBP1-AS1-365ENST00000630746 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa18.75■□□□□ 0.59
PCBP1-AS1-365ENST00000630746 NACADO15069 1562 aa18.7■□□□□ 0.58
PCBP1-AS1-365ENST00000630746 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP18.62■□□□□ 0.57
PCBP1-AS1-365ENST00000630746 MYO15BQ96JP2 1530 aa18.6■□□□□ 0.57
PCBP1-AS1-365ENST00000630746 DCAF8L2P0C7V8 631 aa18.45■□□□□ 0.54
PCBP1-AS1-365ENST00000630746 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa18.34■□□□□ 0.53
PCBP1-AS1-365ENST00000630746 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
PCBP1-AS1-365ENST00000630746 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa18.16■□□□□ 0.5
PCBP1-AS1-365ENST00000630746 DNAJC5BQ9UF47 199 aa18.13■□□□□ 0.49
PCBP1-AS1-365ENST00000630746 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP18.12■□□□□ 0.49
PCBP1-AS1-365ENST00000630746 UNC13AQ9UPW8 1703 aa18.03■□□□□ 0.48
PCBP1-AS1-365ENST00000630746 BICRAQ9NZM4 1560 aa18.03■□□□□ 0.48
PCBP1-AS1-365ENST00000630746 SCRIBQ14160 1630 aa17.75■□□□□ 0.43
PCBP1-AS1-365ENST00000630746 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP17.64■□□□□ 0.41
PCBP1-AS1-365ENST00000630746 CECR2Q9BXF3 1484 aa17.62■□□□□ 0.41
PCBP1-AS1-365ENST00000630746 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa17.61■□□□□ 0.41
PCBP1-AS1-365ENST00000630746 FOXD1Q16676 465 aa17.51■□□□□ 0.39
PCBP1-AS1-365ENST00000630746 NCAPD3P42695 1498 aa17.28■□□□□ 0.36
PCBP1-AS1-365ENST00000630746 SMARCA2P51531 1590 aa17.17■□□□□ 0.34
PCBP1-AS1-365ENST00000630746 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa17.13■□□□□ 0.33
PCBP1-AS1-365ENST00000630746 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP17.12■□□□□ 0.33
PCBP1-AS1-365ENST00000630746 HMGXB3Q12766 1538 aa17.1■□□□□ 0.33
PCBP1-AS1-365ENST00000630746 SMARCA4P51532 1647 aa17.07■□□□□ 0.32
PCBP1-AS1-365ENST00000630746 PEG3Q9GZU2 1588 aa17.03■□□□□ 0.32
PCBP1-AS1-365ENST00000630746 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP16.97■□□□□ 0.31
PCBP1-AS1-365ENST00000630746 CUX2O14529 1486 aa16.95■□□□□ 0.3
PCBP1-AS1-365ENST00000630746 PLPPR3Q6T4P5 718 aa16.95■□□□□ 0.3
PCBP1-AS1-365ENST00000630746 ERCC6Q03468 1493 aa16.9■□□□□ 0.3
PCBP1-AS1-365ENST00000630746 MROH2BQ7Z745 1585 aa16.83■□□□□ 0.28
PCBP1-AS1-365ENST00000630746 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa16.81■□□□□ 0.28
PCBP1-AS1-365ENST00000630746 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa16.81■□□□□ 0.28
PCBP1-AS1-365ENST00000630746 PDS5BQ9NTI5 1447 aa16.8■□□□□ 0.28
PCBP1-AS1-365ENST00000630746 CADPSQ9ULU8 1353 aa16.74■□□□□ 0.27
PCBP1-AS1-365ENST00000630746 NESP48681 1621 aa16.68■□□□□ 0.26
PCBP1-AS1-365ENST00000630746 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP16.62■□□□□ 0.25
PCBP1-AS1-365ENST00000630746 WIZO95785 1651 aa16.57■□□□□ 0.24
PCBP1-AS1-365ENST00000630746 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP16.55■□□□□ 0.24
PCBP1-AS1-365ENST00000630746 CFTRP13569 1480 aa16.54■□□□□ 0.24
PCBP1-AS1-365ENST00000630746 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP16.52■□□□□ 0.24
PCBP1-AS1-365ENST00000630746 MRC2Q9UBG0 1479 aa16.52■□□□□ 0.23
PCBP1-AS1-365ENST00000630746 CEP164Q9UPV0 1460 aa16.48■□□□□ 0.23
PCBP1-AS1-365ENST00000630746 WDR62O43379 1518 aa16.46■□□□□ 0.23
PCBP1-AS1-365ENST00000630746 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP16.46■□□□□ 0.23
PCBP1-AS1-365ENST00000630746 MSH5O43196 834 aa16.45■□□□□ 0.22
PCBP1-AS1-365ENST00000630746 FANCD2Q9BXW9 1451 aa16.45■□□□□ 0.22
PCBP1-AS1-365ENST00000630746 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa16.44■□□□□ 0.22
PCBP1-AS1-365ENST00000630746 ADRA2BP18089 450 aa16.41■□□□□ 0.22
PCBP1-AS1-365ENST00000630746 PPP6R1Q9UPN7 881 aa16.41■□□□□ 0.22
PCBP1-AS1-365ENST00000630746 ABCC8Q09428 1581 aa16.34■□□□□ 0.21
PCBP1-AS1-365ENST00000630746 CCDC88BA6NC98 1476 aa16.32■□□□□ 0.2
PCBP1-AS1-365ENST00000630746 OSCARQ8IYS5 282 aa16.24■□□□□ 0.19
PCBP1-AS1-365ENST00000630746 PRDM2Q13029 1718 aa16.24■□□□□ 0.19
PCBP1-AS1-365ENST00000630746 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP16.22■□□□□ 0.19
PCBP1-AS1-365ENST00000630746 IFT140Q96RY7 1462 aa16.21■□□□□ 0.19
PCBP1-AS1-365ENST00000630746 TOPBP1Q92547 1522 aa16.12■□□□□ 0.17
PCBP1-AS1-365ENST00000630746 DNMBPQ6XZF7 1577 aa16.09■□□□□ 0.17
PCBP1-AS1-365ENST00000630746 WDR97A6NE52 1622 aa16.01■□□□□ 0.15
PCBP1-AS1-365ENST00000630746 SOGA1O94964 1423 aa15.97■□□□□ 0.15
PCBP1-AS1-365ENST00000630746 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
PCBP1-AS1-365ENST00000630746 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.14
PCBP1-AS1-365ENST00000630746 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
PCBP1-AS1-365ENST00000630746 TRIM41Q8WV44 630 aa15.91■□□□□ 0.14
PCBP1-AS1-365ENST00000630746 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP15.9■□□□□ 0.14
PCBP1-AS1-365ENST00000630746 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP15.89■□□□□ 0.13
PCBP1-AS1-365ENST00000630746 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
PCBP1-AS1-365ENST00000630746 FGD5Q6ZNL6 1462 aa15.84■□□□□ 0.13
PCBP1-AS1-365ENST00000630746 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP15.84■□□□□ 0.13
PCBP1-AS1-365ENST00000630746 GRIN2BQ13224 1484 aa15.84■□□□□ 0.13
PCBP1-AS1-365ENST00000630746 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP15.83■□□□□ 0.12
PCBP1-AS1-365ENST00000630746 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP15.83■□□□□ 0.12
PCBP1-AS1-365ENST00000630746 CUX1P39880 1505 aa15.82■□□□□ 0.12
PCBP1-AS1-365ENST00000630746 FBLN2P98095 1184 aa15.81■□□□□ 0.12
PCBP1-AS1-365ENST00000630746 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa15.81■□□□□ 0.12
PCBP1-AS1-365ENST00000630746 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP15.79■□□□□ 0.12
PCBP1-AS1-365ENST00000630746 POTEDQ86YR6 584 aa15.79■□□□□ 0.12
PCBP1-AS1-365ENST00000630746 ARHGEF11O15085 1522 aa15.78■□□□□ 0.12
PCBP1-AS1-365ENST00000630746 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa15.78■□□□□ 0.12
PCBP1-AS1-365ENST00000630746 SYNJ2O15056 1496 aa15.77■□□□□ 0.11
PCBP1-AS1-365ENST00000630746 GAPVD1Q14C86 1478 aa15.76■□□□□ 0.11
PCBP1-AS1-365ENST00000630746 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa15.75■□□□□ 0.11
PCBP1-AS1-365ENST00000630746 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa15.75■□□□□ 0.11
PCBP1-AS1-365ENST00000630746 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa15.75■□□□□ 0.11
PCBP1-AS1-365ENST00000630746 SYNJ1O43426 1573 aa15.73■□□□□ 0.11
PCBP1-AS1-365ENST00000630746 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa15.72■□□□□ 0.11
PCBP1-AS1-365ENST00000630746 CYB5RLQ6IPT4 315 aa15.71■□□□□ 0.11
PCBP1-AS1-365ENST00000630746 CHD1O14646 1710 aa15.68■□□□□ 0.1
PCBP1-AS1-365ENST00000630746 TOP2BQ02880 1626 aa15.68■□□□□ 0.1
PCBP1-AS1-365ENST00000630746 CLASP1Q7Z460 1538 aa15.64■□□□□ 0.09
PCBP1-AS1-365ENST00000630746 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa15.64■□□□□ 0.09
PCBP1-AS1-365ENST00000630746 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa15.64■□□□□ 0.09
PCBP1-AS1-365ENST00000630746 ERICH3Q5RHP9 1530 aa15.62■□□□□ 0.09
PCBP1-AS1-365ENST00000630746 FHAD1B1AJZ9 1412 aa15.61■□□□□ 0.09
PCBP1-AS1-365ENST00000630746 ARAP1Q96P48 1450 aa15.59■□□□□ 0.09
PCBP1-AS1-365ENST00000630746 PBRM1Q86U86 1689 aa15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.7 ms