RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628883.2

PCBP1-AS1-335, PCBP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5

Gene PCBP1-AS1, Length 891 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 NISCHQ9Y2I1 1504 aa25.88■■□□□ 1.73
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PCBP1-AS1-335ENST00000628883 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa22.11■■□□□ 1.13
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PCBP1-AS1-335ENST00000628883 SCRIBQ14160 1630 aa21.16■□□□□ 0.98
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PCBP1-AS1-335ENST00000628883 SMARCA2P51531 1590 aa20.15■□□□□ 0.82
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PCBP1-AS1-335ENST00000628883 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa18.87■□□□□ 0.61
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PCBP1-AS1-335ENST00000628883 WDR97A6NE52 1622 aa18.74■□□□□ 0.59
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PCBP1-AS1-335ENST00000628883 SOGA1O94964 1423 aa18.72■□□□□ 0.59
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PCBP1-AS1-335ENST00000628883 PBRM1Q86U86 1689 aa18.6■□□□□ 0.57
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PCBP1-AS1-335ENST00000628883 SYNJ1O43426 1573 aa18.55■□□□□ 0.56
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PCBP1-AS1-335ENST00000628883 SYNJ2O15056 1496 aa18.54■□□□□ 0.56
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PCBP1-AS1-335ENST00000628883 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa18.48■□□□□ 0.55
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 TOP2BQ02880 1626 aa18.45■□□□□ 0.54
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP18.41■□□□□ 0.54
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 ADAMTS12P58397 1594 aa18.4■□□□□ 0.54
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 GRIN2AQ12879 1464 aa18.37■□□□□ 0.53
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 CEP170Q5SW79 1584 aa18.34■□□□□ 0.53
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 NUP160Q12769 1436 aa18.32■□□□□ 0.52
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 ERICH3Q5RHP9 1530 aa18.31■□□□□ 0.52
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 TRHP20396 242 aaPredicted RBP18.3■□□□□ 0.52
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 ERCC6L2Q5T890 1561 aa18.3■□□□□ 0.52
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 SHROOM2Q13796 1616 aa18.29■□□□□ 0.52
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