RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000627604.1

POLR1D-210, Transcript of RNA polymerase I and III subunit D, humanhuman

TSL 4

Gene POLR1D, Length 565 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1D-210ENST00000627604 NISCHQ9Y2I1 1504 aa53.69■■■■■ 6.19
POLR1D-210ENST00000627604 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa47.81■■■■■ 5.24
POLR1D-210ENST00000627604 ABCC9O60706 1549 aa46.23■■■■■ 4.99
POLR1D-210ENST00000627604 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP44.82■■■■■ 4.77
POLR1D-210ENST00000627604 NACADO15069 1562 aa44.81■■■■■ 4.76
POLR1D-210ENST00000627604 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa44.77■■■■■ 4.76
POLR1D-210ENST00000627604 MYO15BQ96JP2 1530 aa44.73■■■■■ 4.75
POLR1D-210ENST00000627604 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa44.59■■■■■ 4.73
POLR1D-210ENST00000627604 DCAF8L2P0C7V8 631 aa44.31■■■■■ 4.68
POLR1D-210ENST00000627604 UNC13AQ9UPW8 1703 aa43.87■■■■■ 4.61
POLR1D-210ENST00000627604 BICRAQ9NZM4 1560 aa43.42■■■■■ 4.54
POLR1D-210ENST00000627604 SCRIBQ14160 1630 aa43.4■■■■■ 4.54
POLR1D-210ENST00000627604 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa43.13■■■■■ 4.49
POLR1D-210ENST00000627604 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP43.09■■■■■ 4.49
POLR1D-210ENST00000627604 DNAJC5BQ9UF47 199 aa42.93■■■■■ 4.46
POLR1D-210ENST00000627604 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP42.22■■■■■ 4.35
POLR1D-210ENST00000627604 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa41.97■■■■■ 4.31
POLR1D-210ENST00000627604 CECR2Q9BXF3 1484 aa41.7■■■■■ 4.27
POLR1D-210ENST00000627604 SMARCA4P51532 1647 aa41.65■■■■■ 4.26
POLR1D-210ENST00000627604 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP41.63■■■■■ 4.25
POLR1D-210ENST00000627604 PEG3Q9GZU2 1588 aa41.35■■■■■ 4.21
POLR1D-210ENST00000627604 SMARCA2P51531 1590 aa41.33■■■■■ 4.21
POLR1D-210ENST00000627604 MROH2BQ7Z745 1585 aa41.33■■■■■ 4.21
POLR1D-210ENST00000627604 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa41.3■■■■■ 4.2
POLR1D-210ENST00000627604 NCAPD3P42695 1498 aa41.29■■■■■ 4.2
POLR1D-210ENST00000627604 HMGXB3Q12766 1538 aa41.18■■■■■ 4.18
POLR1D-210ENST00000627604 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP40.94■■■■■ 4.14
POLR1D-210ENST00000627604 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP40.92■■■■■ 4.14
POLR1D-210ENST00000627604 WIZO95785 1651 aa40.91■■■■■ 4.14
POLR1D-210ENST00000627604 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP40.55■■■■■ 4.08
POLR1D-210ENST00000627604 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa40.22■■■■■ 4.03
POLR1D-210ENST00000627604 NESP48681 1621 aa40.09■■■■■ 4.01
POLR1D-210ENST00000627604 CADPSQ9ULU8 1353 aa40.01■■■■■ 4
POLR1D-210ENST00000627604 CCDC88BA6NC98 1476 aa39.97■■■■□ 3.99
POLR1D-210ENST00000627604 CFTRP13569 1480 aa39.9■■■■□ 3.98
POLR1D-210ENST00000627604 PRDM2Q13029 1718 aa39.82■■■■□ 3.97
POLR1D-210ENST00000627604 ERCC6Q03468 1493 aa39.82■■■■□ 3.97
POLR1D-210ENST00000627604 PDS5BQ9NTI5 1447 aa39.82■■■■□ 3.96
POLR1D-210ENST00000627604 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa39.78■■■■□ 3.96
POLR1D-210ENST00000627604 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP39.74■■■■□ 3.95
POLR1D-210ENST00000627604 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP39.63■■■■□ 3.94
POLR1D-210ENST00000627604 FANCD2Q9BXW9 1451 aa39.56■■■■□ 3.92
POLR1D-210ENST00000627604 CEP164Q9UPV0 1460 aa39.51■■■■□ 3.92
POLR1D-210ENST00000627604 CUX2O14529 1486 aa39.5■■■■□ 3.91
POLR1D-210ENST00000627604 MRC2Q9UBG0 1479 aa39.43■■■■□ 3.9
POLR1D-210ENST00000627604 WDR62O43379 1518 aa39.37■■■■□ 3.89
POLR1D-210ENST00000627604 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa39.21■■■■□ 3.87
POLR1D-210ENST00000627604 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP39.18■■■■□ 3.86
POLR1D-210ENST00000627604 ABCC8Q09428 1581 aa39.06■■■■□ 3.84
POLR1D-210ENST00000627604 DNMBPQ6XZF7 1577 aa39.02■■■■□ 3.84
POLR1D-210ENST00000627604 TOPBP1Q92547 1522 aa38.99■■■■□ 3.83
POLR1D-210ENST00000627604 CUX1P39880 1505 aa38.78■■■■□ 3.8
POLR1D-210ENST00000627604 IFT140Q96RY7 1462 aa38.7■■■■□ 3.79
POLR1D-210ENST00000627604 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP38.66■■■■□ 3.78
POLR1D-210ENST00000627604 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP38.63■■■■□ 3.78
POLR1D-210ENST00000627604 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa38.63■■■■□ 3.77
POLR1D-210ENST00000627604 FGD5Q6ZNL6 1462 aa38.58■■■■□ 3.77
POLR1D-210ENST00000627604 TOP2BQ02880 1626 aa38.57■■■■□ 3.77
POLR1D-210ENST00000627604 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP38.56■■■■□ 3.76
POLR1D-210ENST00000627604 SYNJ1O43426 1573 aa38.51■■■■□ 3.76
POLR1D-210ENST00000627604 WDR97A6NE52 1622 aa38.46■■■■□ 3.75
POLR1D-210ENST00000627604 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP38.43■■■■□ 3.74
POLR1D-210ENST00000627604 SOGA1O94964 1423 aa38.42■■■■□ 3.74
POLR1D-210ENST00000627604 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa38.4■■■■□ 3.74
POLR1D-210ENST00000627604 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP38.4■■■■□ 3.74
POLR1D-210ENST00000627604 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa38.29■■■■□ 3.72
POLR1D-210ENST00000627604 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP38.19■■■■□ 3.73e-6■■□□□ 11.4
POLR1D-210ENST00000627604 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa38.18■■■■□ 3.7
POLR1D-210ENST00000627604 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP38.11■■■■□ 3.69
POLR1D-210ENST00000627604 PBRM1Q86U86 1689 aa38.08■■■■□ 3.69
POLR1D-210ENST00000627604 GAPVD1Q14C86 1478 aa38.04■■■■□ 3.68
POLR1D-210ENST00000627604 GRIN2BQ13224 1484 aa38.03■■■■□ 3.68
POLR1D-210ENST00000627604 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP37.96■■■■□ 3.67
POLR1D-210ENST00000627604 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa37.9■■■■□ 3.66
POLR1D-210ENST00000627604 CHD1O14646 1710 aa37.9■■■■□ 3.66
POLR1D-210ENST00000627604 OSCARQ8IYS5 282 aa37.87■■■■□ 3.65
POLR1D-210ENST00000627604 ERICH3Q5RHP9 1530 aa37.87■■■■□ 3.65
POLR1D-210ENST00000627604 SYNJ2O15056 1496 aa37.77■■■■□ 3.64
POLR1D-210ENST00000627604 ADAMTS12P58397 1594 aa37.76■■■■□ 3.64
POLR1D-210ENST00000627604 KIF27Q86VH2 1401 aa37.74■■■■□ 3.63
POLR1D-210ENST00000627604 FHAD1B1AJZ9 1412 aa37.63■■■■□ 3.61
POLR1D-210ENST00000627604 TRIM41Q8WV44 630 aa37.62■■■■□ 3.61
POLR1D-210ENST00000627604 CUL7Q14999 1698 aa37.6■■■■□ 3.61
POLR1D-210ENST00000627604 GRIN2AQ12879 1464 aa37.55■■■■□ 3.6
POLR1D-210ENST00000627604 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP37.54■■■■□ 3.6
POLR1D-210ENST00000627604 IGF1RP08069 1367 aa37.53■■■■□ 3.6
POLR1D-210ENST00000627604 CLASP1Q7Z460 1538 aa37.51■■■■□ 3.59
POLR1D-210ENST00000627604 FBLN2P98095 1184 aa37.5■■■■□ 3.59
POLR1D-210ENST00000627604 NUP160Q12769 1436 aa37.42■■■■□ 3.58
POLR1D-210ENST00000627604 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa37.39■■■■□ 3.58
POLR1D-210ENST00000627604 CEP170Q5SW79 1584 aa37.38■■■■□ 3.57
POLR1D-210ENST00000627604 CHIC1Q5VXU3 224 aa37.35■■■■□ 3.57
POLR1D-210ENST00000627604 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa37.29■■■■□ 3.56
POLR1D-210ENST00000627604 EEA1Q15075 1411 aa37.25■■■■□ 3.55
POLR1D-210ENST00000627604 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa37.24■■■■□ 3.55
POLR1D-210ENST00000627604 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa37.24■■■■□ 3.55
POLR1D-210ENST00000627604 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa37.24■■■■□ 3.55
POLR1D-210ENST00000627604 ARHGEF11O15085 1522 aa37.23■■■■□ 3.55
POLR1D-210ENST00000627604 SHROOM2Q13796 1616 aa37.2■■■■□ 3.55
POLR1D-210ENST00000627604 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa37.16■■■■□ 3.54
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