RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000611044.1

AC242988.1-201, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene AC242988.1, Length 714 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AC242988.1-201ENST00000611044 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP31.29■■■□□ 2.6
AC242988.1-201ENST00000611044 CHIC1Q5VXU3 224 aa30.21■■■□□ 2.43
AC242988.1-201ENST00000611044 NISCHQ9Y2I1 1504 aa29.85■■■□□ 2.37
AC242988.1-201ENST00000611044 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP26.63■■□□□ 1.85
AC242988.1-201ENST00000611044 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP26.45■■□□□ 1.82
AC242988.1-201ENST00000611044 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa26.26■■□□□ 1.79
AC242988.1-201ENST00000611044 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP25.03■■□□□ 1.6
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AC242988.1-201ENST00000611044 DCAF8L2P0C7V8 631 aa24.55■■□□□ 1.52
AC242988.1-201ENST00000611044 NACADO15069 1562 aa24.47■■□□□ 1.51
AC242988.1-201ENST00000611044 PLPPR3Q6T4P5 718 aa24.37■■□□□ 1.49
AC242988.1-201ENST00000611044 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa24.33■■□□□ 1.48
AC242988.1-201ENST00000611044 SCRIBQ14160 1630 aa24.01■■□□□ 1.43
AC242988.1-201ENST00000611044 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa24■■□□□ 1.43
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AC242988.1-201ENST00000611044 PPP6R1Q9UPN7 881 aa23.6■■□□□ 1.37
AC242988.1-201ENST00000611044 ADRA2BP18089 450 aa23.53■■□□□ 1.36
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AC242988.1-201ENST00000611044 CECR2Q9BXF3 1484 aa23.18■■□□□ 1.3
AC242988.1-201ENST00000611044 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP23.16■■□□□ 1.3
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AC242988.1-201ENST00000611044 SMARCA4P51532 1647 aa23.04■■□□□ 1.28
AC242988.1-201ENST00000611044 MROH2BQ7Z745 1585 aa23.03■■□□□ 1.28
AC242988.1-201ENST00000611044 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
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AC242988.1-201ENST00000611044 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
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AC242988.1-201ENST00000611044 PEG3Q9GZU2 1588 aa22.79■■□□□ 1.24
AC242988.1-201ENST00000611044 MSH5O43196 834 aa22.75■■□□□ 1.23
AC242988.1-201ENST00000611044 SMARCA2P51531 1590 aa22.7■■□□□ 1.22
AC242988.1-201ENST00000611044 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa22.68■■□□□ 1.22
AC242988.1-201ENST00000611044 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa22.64■■□□□ 1.21
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AC242988.1-201ENST00000611044 DNAJC5BQ9UF47 199 aa22.24■■□□□ 1.15
AC242988.1-201ENST00000611044 PRDM2Q13029 1718 aa21.97■■□□□ 1.11
AC242988.1-201ENST00000611044 CFTRP13569 1480 aa21.96■■□□□ 1.11
AC242988.1-201ENST00000611044 CADPSQ9ULU8 1353 aa21.92■■□□□ 1.1
AC242988.1-201ENST00000611044 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa21.87■■□□□ 1.09
AC242988.1-201ENST00000611044 NESP48681 1621 aa21.83■■□□□ 1.08
AC242988.1-201ENST00000611044 ABCC8Q09428 1581 aa21.77■■□□□ 1.08
AC242988.1-201ENST00000611044 FANCD2Q9BXW9 1451 aa21.69■■□□□ 1.06
AC242988.1-201ENST00000611044 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP21.65■■□□□ 1.06
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AC242988.1-201ENST00000611044 SYNJ1O43426 1573 aa21.62■■□□□ 1.05
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AC242988.1-201ENST00000611044 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa21.59■■□□□ 1.05
AC242988.1-201ENST00000611044 TRIM41Q8WV44 630 aa21.58■■□□□ 1.05
AC242988.1-201ENST00000611044 TOP2BQ02880 1626 aa21.57■■□□□ 1.04
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AC242988.1-201ENST00000611044 DNMBPQ6XZF7 1577 aa21.49■■□□□ 1.03
AC242988.1-201ENST00000611044 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa21.49■■□□□ 1.03
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AC242988.1-201ENST00000611044 TOPBP1Q92547 1522 aa21.45■■□□□ 1.02
AC242988.1-201ENST00000611044 ERCC6Q03468 1493 aa21.42■■□□□ 1.02
AC242988.1-201ENST00000611044 MRC2Q9UBG0 1479 aa21.42■■□□□ 1.02
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AC242988.1-201ENST00000611044 FGD5Q6ZNL6 1462 aa21.36■■□□□ 1.01
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AC242988.1-201ENST00000611044 WDR97A6NE52 1622 aa21.23■□□□□ 0.99
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AC242988.1-201ENST00000611044 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa21.2■□□□□ 0.98
AC242988.1-201ENST00000611044 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa21.19■□□□□ 0.98
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AC242988.1-201ENST00000611044 CUX2O14529 1486 aa21.18■□□□□ 0.98
AC242988.1-201ENST00000611044 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP21.15■□□□□ 0.98
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AC242988.1-201ENST00000611044 DMRT2Q9Y5R5 561 aa21.11■□□□□ 0.97
AC242988.1-201ENST00000611044 IFT140Q96RY7 1462 aa21.1■□□□□ 0.97
AC242988.1-201ENST00000611044 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa21.08■□□□□ 0.97
AC242988.1-201ENST00000611044 CSRNP3Q8WYN3 585 aa21.04■□□□□ 0.96
AC242988.1-201ENST00000611044 KIF21BO75037 1637 aa21■□□□□ 0.95
AC242988.1-201ENST00000611044 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP20.98■□□□□ 0.95
AC242988.1-201ENST00000611044 GAPVD1Q14C86 1478 aa20.98■□□□□ 0.95
AC242988.1-201ENST00000611044 PBRM1Q86U86 1689 aa20.98■□□□□ 0.95
AC242988.1-201ENST00000611044 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP20.97■□□□□ 0.95
AC242988.1-201ENST00000611044 IGF1RP08069 1367 aa20.96■□□□□ 0.95
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AC242988.1-201ENST00000611044 ERICH3Q5RHP9 1530 aa20.94■□□□□ 0.94
AC242988.1-201ENST00000611044 PRXQ9BXM0 1461 aa20.94■□□□□ 0.94
AC242988.1-201ENST00000611044 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa20.93■□□□□ 0.94
AC242988.1-201ENST00000611044 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP20.92■□□□□ 0.94
AC242988.1-201ENST00000611044 CUL7Q14999 1698 aa20.92■□□□□ 0.94
AC242988.1-201ENST00000611044 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa20.9■□□□□ 0.94
AC242988.1-201ENST00000611044 GOLGA3Q08378 1498 aa20.88■□□□□ 0.93
AC242988.1-201ENST00000611044 GRIN2BQ13224 1484 aa20.88■□□□□ 0.93
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