RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000610668.4

KLF3-AS1-206, KLF3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene KLF3-AS1, Length 685 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF3-AS1-206ENST00000610668 NISCHQ9Y2I1 1504 aa29.2■■■□□ 2.26
KLF3-AS1-206ENST00000610668 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa25.72■■□□□ 1.71
KLF3-AS1-206ENST00000610668 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
KLF3-AS1-206ENST00000610668 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP24.5■■□□□ 1.51
KLF3-AS1-206ENST00000610668 CHIC1Q5VXU3 224 aa24.34■■□□□ 1.49
KLF3-AS1-206ENST00000610668 ABCC9O60706 1549 aa24.3■■□□□ 1.48
KLF3-AS1-206ENST00000610668 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa24.27■■□□□ 1.48
KLF3-AS1-206ENST00000610668 MYO15BQ96JP2 1530 aa24.11■■□□□ 1.45
KLF3-AS1-206ENST00000610668 NACADO15069 1562 aa23.98■■□□□ 1.43
KLF3-AS1-206ENST00000610668 DCAF8L2P0C7V8 631 aa23.95■■□□□ 1.42
KLF3-AS1-206ENST00000610668 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa23.82■■□□□ 1.4
KLF3-AS1-206ENST00000610668 SCRIBQ14160 1630 aa23.42■■□□□ 1.34
KLF3-AS1-206ENST00000610668 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa23.39■■□□□ 1.34
KLF3-AS1-206ENST00000610668 UNC13AQ9UPW8 1703 aa23.25■■□□□ 1.31
KLF3-AS1-206ENST00000610668 BICRAQ9NZM4 1560 aa22.99■■□□□ 1.27
KLF3-AS1-206ENST00000610668 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP22.77■■□□□ 1.24
KLF3-AS1-206ENST00000610668 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
KLF3-AS1-206ENST00000610668 CECR2Q9BXF3 1484 aa22.58■■□□□ 1.2
KLF3-AS1-206ENST00000610668 SMARCA4P51532 1647 aa22.51■■□□□ 1.19
KLF3-AS1-206ENST00000610668 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
KLF3-AS1-206ENST00000610668 MROH2BQ7Z745 1585 aa22.46■■□□□ 1.19
KLF3-AS1-206ENST00000610668 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
KLF3-AS1-206ENST00000610668 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
KLF3-AS1-206ENST00000610668 PEG3Q9GZU2 1588 aa22.32■■□□□ 1.16
KLF3-AS1-206ENST00000610668 WIZO95785 1651 aa22.27■■□□□ 1.16
KLF3-AS1-206ENST00000610668 SMARCA2P51531 1590 aa22.25■■□□□ 1.15
KLF3-AS1-206ENST00000610668 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa22.17■■□□□ 1.14
KLF3-AS1-206ENST00000610668 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
KLF3-AS1-206ENST00000610668 HMGXB3Q12766 1538 aa22.08■■□□□ 1.13
KLF3-AS1-206ENST00000610668 NCAPD3P42695 1498 aa22.07■■□□□ 1.12
KLF3-AS1-206ENST00000610668 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa22.06■■□□□ 1.12
KLF3-AS1-206ENST00000610668 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
KLF3-AS1-206ENST00000610668 DNAJC5BQ9UF47 199 aa21.85■■□□□ 1.09
KLF3-AS1-206ENST00000610668 CCDC88BA6NC98 1476 aa21.82■■□□□ 1.08
KLF3-AS1-206ENST00000610668 CFTRP13569 1480 aa21.49■■□□□ 1.03
KLF3-AS1-206ENST00000610668 PRDM2Q13029 1718 aa21.49■■□□□ 1.03
KLF3-AS1-206ENST00000610668 CADPSQ9ULU8 1353 aa21.45■■□□□ 1.02
KLF3-AS1-206ENST00000610668 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa21.41■■□□□ 1.02
KLF3-AS1-206ENST00000610668 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
KLF3-AS1-206ENST00000610668 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP21.33■■□□□ 1.01
KLF3-AS1-206ENST00000610668 ABCC8Q09428 1581 aa21.23■□□□□ 0.99
KLF3-AS1-206ENST00000610668 NESP48681 1621 aa21.22■□□□□ 0.99
KLF3-AS1-206ENST00000610668 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP21.22■□□□□ 0.99
KLF3-AS1-206ENST00000610668 PDS5BQ9NTI5 1447 aa21.22■□□□□ 0.99
KLF3-AS1-206ENST00000610668 FANCD2Q9BXW9 1451 aa21.2■□□□□ 0.98
KLF3-AS1-206ENST00000610668 TRIM41Q8WV44 630 aa21.18■□□□□ 0.98
KLF3-AS1-206ENST00000610668 CEP164Q9UPV0 1460 aa21.13■□□□□ 0.97
KLF3-AS1-206ENST00000610668 TOP2BQ02880 1626 aa21.12■□□□□ 0.97
KLF3-AS1-206ENST00000610668 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa21.12■□□□□ 0.97
KLF3-AS1-206ENST00000610668 SYNJ1O43426 1573 aa21.1■□□□□ 0.97
KLF3-AS1-206ENST00000610668 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa21.07■□□□□ 0.96
KLF3-AS1-206ENST00000610668 CUX1P39880 1505 aa21.04■□□□□ 0.96
KLF3-AS1-206ENST00000610668 DNMBPQ6XZF7 1577 aa21.03■□□□□ 0.96
KLF3-AS1-206ENST00000610668 TOPBP1Q92547 1522 aa20.95■□□□□ 0.94
KLF3-AS1-206ENST00000610668 ERCC6Q03468 1493 aa20.94■□□□□ 0.94
KLF3-AS1-206ENST00000610668 MRC2Q9UBG0 1479 aa20.94■□□□□ 0.94
KLF3-AS1-206ENST00000610668 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP20.92■□□□□ 0.94
KLF3-AS1-206ENST00000610668 EEA1Q15075 1411 aa20.89■□□□□ 0.94
KLF3-AS1-206ENST00000610668 FGD5Q6ZNL6 1462 aa20.88■□□□□ 0.93
KLF3-AS1-206ENST00000610668 WDR62O43379 1518 aa20.87■□□□□ 0.93
KLF3-AS1-206ENST00000610668 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP20.84■□□□□ 0.93
KLF3-AS1-206ENST00000610668 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP20.81■□□□□ 0.92
KLF3-AS1-206ENST00000610668 SOGA1O94964 1423 aa20.76■□□□□ 0.91
KLF3-AS1-206ENST00000610668 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa20.74■□□□□ 0.91
KLF3-AS1-206ENST00000610668 KIF27Q86VH2 1401 aa20.73■□□□□ 0.91
KLF3-AS1-206ENST00000610668 WDR97A6NE52 1622 aa20.72■□□□□ 0.91
KLF3-AS1-206ENST00000610668 CUX2O14529 1486 aa20.68■□□□□ 0.9
KLF3-AS1-206ENST00000610668 IFT140Q96RY7 1462 aa20.67■□□□□ 0.9
KLF3-AS1-206ENST00000610668 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa20.67■□□□□ 0.9
KLF3-AS1-206ENST00000610668 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP20.67■□□□□ 0.9
KLF3-AS1-206ENST00000610668 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa20.66■□□□□ 0.9
KLF3-AS1-206ENST00000610668 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP20.64■□□□□ 0.89
KLF3-AS1-206ENST00000610668 CSRNP3Q8WYN3 585 aa20.64■□□□□ 0.89
KLF3-AS1-206ENST00000610668 KIF21BO75037 1637 aa20.6■□□□□ 0.89
KLF3-AS1-206ENST00000610668 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa20.6■□□□□ 0.89
KLF3-AS1-206ENST00000610668 ERICH3Q5RHP9 1530 aa20.53■□□□□ 0.88
KLF3-AS1-206ENST00000610668 GAPVD1Q14C86 1478 aa20.53■□□□□ 0.88
KLF3-AS1-206ENST00000610668 CUL7Q14999 1698 aa20.52■□□□□ 0.88
KLF3-AS1-206ENST00000610668 GOLGA3Q08378 1498 aa20.51■□□□□ 0.87
KLF3-AS1-206ENST00000610668 PRXQ9BXM0 1461 aa20.51■□□□□ 0.87
KLF3-AS1-206ENST00000610668 IGF1RP08069 1367 aa20.49■□□□□ 0.87
KLF3-AS1-206ENST00000610668 PBRM1Q86U86 1689 aa20.48■□□□□ 0.87
KLF3-AS1-206ENST00000610668 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
KLF3-AS1-206ENST00000610668 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
KLF3-AS1-206ENST00000610668 GRIN2BQ13224 1484 aa20.43■□□□□ 0.86
KLF3-AS1-206ENST00000610668 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa20.42■□□□□ 0.86
KLF3-AS1-206ENST00000610668 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
KLF3-AS1-206ENST00000610668 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa20.41■□□□□ 0.86
KLF3-AS1-206ENST00000610668 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa20.41■□□□□ 0.86
KLF3-AS1-206ENST00000610668 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP20.4■□□□□ 0.86
KLF3-AS1-206ENST00000610668 TNIKQ9UKE5 1360 aa20.37■□□□□ 0.85
KLF3-AS1-206ENST00000610668 ADAMTS12P58397 1594 aa20.35■□□□□ 0.85
KLF3-AS1-206ENST00000610668 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
KLF3-AS1-206ENST00000610668 FHAD1B1AJZ9 1412 aa20.34■□□□□ 0.85
KLF3-AS1-206ENST00000610668 UBTFP17480 764 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
KLF3-AS1-206ENST00000610668 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa20.28■□□□□ 0.84
KLF3-AS1-206ENST00000610668 EHMT2Q96KQ7 1210 aa20.25■□□□□ 0.83
KLF3-AS1-206ENST00000610668 SYNJ2O15056 1496 aa20.23■□□□□ 0.83
KLF3-AS1-206ENST00000610668 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa20.22■□□□□ 0.83
KLF3-AS1-206ENST00000610668 CEP162Q5TB80 1403 aa20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 7.8 ms