RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000609835.5

ITPA-210, Transcript of inosine triphosphatase, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ITPA, Length 924 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITPA-210ENST00000609835 NISCHQ9Y2I1 1504 aa52.85■■■■■ 6.05
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ITPA-210ENST00000609835 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa44.25■■■■■ 4.67
ITPA-210ENST00000609835 NACADO15069 1562 aa44.21■■■■■ 4.67
ITPA-210ENST00000609835 DCAF8L2P0C7V8 631 aa44.06■■■■■ 4.64
ITPA-210ENST00000609835 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP44.02■■■■■ 4.64
ITPA-210ENST00000609835 MYO15BQ96JP2 1530 aa43.98■■■■■ 4.63
ITPA-210ENST00000609835 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa43.78■■■■■ 4.6
ITPA-210ENST00000609835 UNC13AQ9UPW8 1703 aa43.25■■■■■ 4.51
ITPA-210ENST00000609835 BICRAQ9NZM4 1560 aa42.89■■■■■ 4.46
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ITPA-210ENST00000609835 SCRIBQ14160 1630 aa42.82■■■■■ 4.45
ITPA-210ENST00000609835 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa42.51■■■■■ 4.4
ITPA-210ENST00000609835 DNAJC5BQ9UF47 199 aa42.46■■■■■ 4.39
ITPA-210ENST00000609835 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP41.76■■■■■ 4.27
ITPA-210ENST00000609835 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa41.58■■■■■ 4.25
ITPA-210ENST00000609835 CECR2Q9BXF3 1484 aa41.28■■■■■ 4.2
ITPA-210ENST00000609835 SMARCA4P51532 1647 aa41.01■■■■■ 4.16
ITPA-210ENST00000609835 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP40.98■■■■■ 4.15
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ITPA-210ENST00000609835 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa40.78■■■■■ 4.12
ITPA-210ENST00000609835 SMARCA2P51531 1590 aa40.76■■■■■ 4.12
ITPA-210ENST00000609835 MROH2BQ7Z745 1585 aa40.7■■■■■ 4.11
ITPA-210ENST00000609835 PEG3Q9GZU2 1588 aa40.65■■■■■ 4.1
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ITPA-210ENST00000609835 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP40.44■■■■■ 4.06
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ITPA-210ENST00000609835 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP40.25■■■■■ 4.03
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ITPA-210ENST00000609835 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa39.72■■■■□ 3.95
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ITPA-210ENST00000609835 CADPSQ9ULU8 1353 aa39.58■■■■□ 3.93
ITPA-210ENST00000609835 PDS5BQ9NTI5 1447 aa39.43■■■■□ 3.9
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ITPA-210ENST00000609835 CUX2O14529 1486 aa39.37■■■■□ 3.89
ITPA-210ENST00000609835 CFTRP13569 1480 aa39.35■■■■□ 3.89
ITPA-210ENST00000609835 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa39.31■■■■□ 3.88
ITPA-210ENST00000609835 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP39.19■■■■□ 3.86
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ITPA-210ENST00000609835 PRDM2Q13029 1718 aa39.1■■■■□ 3.85
ITPA-210ENST00000609835 CEP164Q9UPV0 1460 aa39.06■■■■□ 3.84
ITPA-210ENST00000609835 MRC2Q9UBG0 1479 aa39.01■■■■□ 3.84
ITPA-210ENST00000609835 WDR62O43379 1518 aa38.9■■■■□ 3.82
ITPA-210ENST00000609835 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa38.84■■■■□ 3.81
ITPA-210ENST00000609835 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP38.71■■■■□ 3.79
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ITPA-210ENST00000609835 TOPBP1Q92547 1522 aa38.49■■■■□ 3.75
ITPA-210ENST00000609835 DNMBPQ6XZF7 1577 aa38.46■■■■□ 3.75
ITPA-210ENST00000609835 IFT140Q96RY7 1462 aa38.26■■■■□ 3.72
ITPA-210ENST00000609835 CUX1P39880 1505 aa38.18■■■■□ 3.7
ITPA-210ENST00000609835 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP38.15■■■■□ 3.7
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ITPA-210ENST00000609835 FGD5Q6ZNL6 1462 aa38.06■■■■□ 3.68
ITPA-210ENST00000609835 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP38.04■■■■□ 3.68
ITPA-210ENST00000609835 SOGA1O94964 1423 aa38■■■■□ 3.67
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ITPA-210ENST00000609835 TOP2BQ02880 1626 aa37.89■■■■□ 3.66
ITPA-210ENST00000609835 SYNJ1O43426 1573 aa37.85■■■■□ 3.65
ITPA-210ENST00000609835 WDR97A6NE52 1622 aa37.84■■■■□ 3.65
ITPA-210ENST00000609835 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP37.83■■■■□ 3.652e-8■■■■□ 20.1
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ITPA-210ENST00000609835 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa37.71■■■■□ 3.63
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ITPA-210ENST00000609835 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa37.58■■■■□ 3.61
ITPA-210ENST00000609835 GAPVD1Q14C86 1478 aa37.57■■■■□ 3.6
ITPA-210ENST00000609835 PBRM1Q86U86 1689 aa37.5■■■■□ 3.59
ITPA-210ENST00000609835 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa37.49■■■■□ 3.59
ITPA-210ENST00000609835 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP37.49■■■■□ 3.59
ITPA-210ENST00000609835 CHD1O14646 1710 aa37.46■■■■□ 3.59
ITPA-210ENST00000609835 FBLN2P98095 1184 aa37.34■■■■□ 3.57
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ITPA-210ENST00000609835 TRIM41Q8WV44 630 aa37.3■■■■□ 3.56
ITPA-210ENST00000609835 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP37.29■■■■□ 3.56
ITPA-210ENST00000609835 ERICH3Q5RHP9 1530 aa37.28■■■■□ 3.56
ITPA-210ENST00000609835 ADAMTS12P58397 1594 aa37.21■■■■□ 3.55
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ITPA-210ENST00000609835 ARHGEF11O15085 1522 aa36.97■■■■□ 3.51
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ITPA-210ENST00000609835 NUP160Q12769 1436 aa36.93■■■■□ 3.5
ITPA-210ENST00000609835 CEP170Q5SW79 1584 aa36.89■■■■□ 3.5
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ITPA-210ENST00000609835 SHROOM2Q13796 1616 aa36.67■■■■□ 3.46
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ITPA-210ENST00000609835 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa36.58■■■■□ 3.45
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