RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000604499.6

PGPEP1-209, Transcript of pyroglutamyl-peptidase I, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PGPEP1, Length 769 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGPEP1-209ENST00000604499 NISCHQ9Y2I1 1504 aa40.17■■■■■ 4.02
PGPEP1-209ENST00000604499 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa35.39■■■■□ 3.26
PGPEP1-209ENST00000604499 ABCC9O60706 1549 aa34.09■■■■□ 3.05
PGPEP1-209ENST00000604499 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP33.59■■■□□ 2.97
PGPEP1-209ENST00000604499 DCAF8L2P0C7V8 631 aa33.27■■■□□ 2.92
PGPEP1-209ENST00000604499 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa33.27■■■□□ 2.92
PGPEP1-209ENST00000604499 MYO15BQ96JP2 1530 aa33.18■■■□□ 2.9
PGPEP1-209ENST00000604499 NACADO15069 1562 aa33.16■■■□□ 2.9
PGPEP1-209ENST00000604499 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa33.03■■■□□ 2.88
PGPEP1-209ENST00000604499 SCRIBQ14160 1630 aa32.35■■■□□ 2.77
PGPEP1-209ENST00000604499 UNC13AQ9UPW8 1703 aa32.26■■■□□ 2.75
PGPEP1-209ENST00000604499 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa32.08■■■□□ 2.73
PGPEP1-209ENST00000604499 BICRAQ9NZM4 1560 aa32.07■■■□□ 2.72
PGPEP1-209ENST00000604499 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP31.98■■■□□ 2.71
PGPEP1-209ENST00000604499 CECR2Q9BXF3 1484 aa31.25■■■□□ 2.59
PGPEP1-209ENST00000604499 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP31.14■■■□□ 2.58
PGPEP1-209ENST00000604499 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP31.05■■■□□ 2.56
PGPEP1-209ENST00000604499 SMARCA4P51532 1647 aa31.02■■■□□ 2.56
PGPEP1-209ENST00000604499 MROH2BQ7Z745 1585 aa30.98■■■□□ 2.55
PGPEP1-209ENST00000604499 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa30.85■■■□□ 2.53
PGPEP1-209ENST00000604499 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP30.85■■■□□ 2.53
PGPEP1-209ENST00000604499 DNAJC5BQ9UF47 199 aa30.82■■■□□ 2.52
PGPEP1-209ENST00000604499 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa30.73■■■□□ 2.51
PGPEP1-209ENST00000604499 PEG3Q9GZU2 1588 aa30.72■■■□□ 2.51
PGPEP1-209ENST00000604499 SMARCA2P51531 1590 aa30.67■■■□□ 2.5
PGPEP1-209ENST00000604499 WIZO95785 1651 aa30.64■■■□□ 2.5
PGPEP1-209ENST00000604499 NCAPD3P42695 1498 aa30.63■■■□□ 2.49
PGPEP1-209ENST00000604499 HMGXB3Q12766 1538 aa30.5■■■□□ 2.47
PGPEP1-209ENST00000604499 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP30.48■■■□□ 2.47
PGPEP1-209ENST00000604499 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP30.47■■■□□ 2.47
PGPEP1-209ENST00000604499 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP30.36■■■□□ 2.45
PGPEP1-209ENST00000604499 CCDC88BA6NC98 1476 aa30.03■■■□□ 2.4
PGPEP1-209ENST00000604499 CADPSQ9ULU8 1353 aa29.76■■■□□ 2.35
PGPEP1-209ENST00000604499 CFTRP13569 1480 aa29.71■■■□□ 2.35
PGPEP1-209ENST00000604499 NESP48681 1621 aa29.7■■■□□ 2.34
PGPEP1-209ENST00000604499 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa29.68■■■□□ 2.34
PGPEP1-209ENST00000604499 PDS5BQ9NTI5 1447 aa29.46■■■□□ 2.31
PGPEP1-209ENST00000604499 PRDM2Q13029 1718 aa29.42■■■□□ 2.3
PGPEP1-209ENST00000604499 FANCD2Q9BXW9 1451 aa29.4■■■□□ 2.3
PGPEP1-209ENST00000604499 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa29.3■■■□□ 2.28
PGPEP1-209ENST00000604499 ERCC6Q03468 1493 aa29.29■■■□□ 2.28
PGPEP1-209ENST00000604499 CEP164Q9UPV0 1460 aa29.29■■■□□ 2.28
PGPEP1-209ENST00000604499 MRC2Q9UBG0 1479 aa29.13■■■□□ 2.25
PGPEP1-209ENST00000604499 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP29.09■■■□□ 2.25
PGPEP1-209ENST00000604499 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP29.09■■■□□ 2.25
PGPEP1-209ENST00000604499 ABCC8Q09428 1581 aa29.09■■■□□ 2.25
PGPEP1-209ENST00000604499 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP29.04■■■□□ 2.24
PGPEP1-209ENST00000604499 WDR62O43379 1518 aa29.02■■■□□ 2.24
PGPEP1-209ENST00000604499 CUX1P39880 1505 aa29.02■■■□□ 2.24
PGPEP1-209ENST00000604499 DNMBPQ6XZF7 1577 aa29.01■■■□□ 2.23
PGPEP1-209ENST00000604499 TOPBP1Q92547 1522 aa29■■■□□ 2.23
PGPEP1-209ENST00000604499 SYNJ1O43426 1573 aa28.94■■■□□ 2.22
PGPEP1-209ENST00000604499 TOP2BQ02880 1626 aa28.9■■■□□ 2.22
PGPEP1-209ENST00000604499 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa28.89■■■□□ 2.22
PGPEP1-209ENST00000604499 CHIC1Q5VXU3 224 aa28.85■■■□□ 2.21
PGPEP1-209ENST00000604499 FGD5Q6ZNL6 1462 aa28.81■■■□□ 2.2
PGPEP1-209ENST00000604499 CUX2O14529 1486 aa28.8■■■□□ 2.2
PGPEP1-209ENST00000604499 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP28.8■■■□□ 2.2
PGPEP1-209ENST00000604499 TRIM41Q8WV44 630 aa28.76■■■□□ 2.19
PGPEP1-209ENST00000604499 SOGA1O94964 1423 aa28.69■■■□□ 2.18
PGPEP1-209ENST00000604499 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa28.68■■■□□ 2.18
PGPEP1-209ENST00000604499 IFT140Q96RY7 1462 aa28.66■■■□□ 2.18
PGPEP1-209ENST00000604499 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP28.64■■■□□ 2.18
PGPEP1-209ENST00000604499 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa28.58■■■□□ 2.17
PGPEP1-209ENST00000604499 WDR97A6NE52 1622 aa28.53■■■□□ 2.16
PGPEP1-209ENST00000604499 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP28.51■■■□□ 2.15
PGPEP1-209ENST00000604499 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP28.47■■■□□ 2.15
PGPEP1-209ENST00000604499 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP28.42■■■□□ 2.144e-9■■■■■ 54.5
PGPEP1-209ENST00000604499 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa28.39■■■□□ 2.13
PGPEP1-209ENST00000604499 KIF27Q86VH2 1401 aa28.38■■■□□ 2.13
PGPEP1-209ENST00000604499 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP28.37■■■□□ 2.13
PGPEP1-209ENST00000604499 GAPVD1Q14C86 1478 aa28.36■■■□□ 2.13
PGPEP1-209ENST00000604499 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa28.35■■■□□ 2.13
PGPEP1-209ENST00000604499 GRIN2BQ13224 1484 aa28.27■■■□□ 2.12
PGPEP1-209ENST00000604499 IGF1RP08069 1367 aa28.24■■■□□ 2.11
PGPEP1-209ENST00000604499 EEA1Q15075 1411 aa28.23■■■□□ 2.11
PGPEP1-209ENST00000604499 ERICH3Q5RHP9 1530 aa28.22■■■□□ 2.11
PGPEP1-209ENST00000604499 PBRM1Q86U86 1689 aa28.21■■■□□ 2.11
PGPEP1-209ENST00000604499 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa28.15■■■□□ 2.1
PGPEP1-209ENST00000604499 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP28.14■■■□□ 2.1
PGPEP1-209ENST00000604499 CSRNP3Q8WYN3 585 aa28.13■■■□□ 2.09
PGPEP1-209ENST00000604499 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP28.13■■■□□ 2.09
PGPEP1-209ENST00000604499 ADAMTS12P58397 1594 aa28.07■■■□□ 2.08
PGPEP1-209ENST00000604499 FHAD1B1AJZ9 1412 aa28.06■■■□□ 2.08
PGPEP1-209ENST00000604499 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa28.05■■■□□ 2.08
PGPEP1-209ENST00000604499 CUL7Q14999 1698 aa28.04■■■□□ 2.08
PGPEP1-209ENST00000604499 PRXQ9BXM0 1461 aa28.02■■■□□ 2.08
PGPEP1-209ENST00000604499 SYNJ2O15056 1496 aa28.02■■■□□ 2.08
PGPEP1-209ENST00000604499 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP27.94■■■□□ 2.06
PGPEP1-209ENST00000604499 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa27.94■■■□□ 2.06
PGPEP1-209ENST00000604499 GRIN2AQ12879 1464 aa27.91■■■□□ 2.06
PGPEP1-209ENST00000604499 FBLN2P98095 1184 aa27.91■■■□□ 2.06
PGPEP1-209ENST00000604499 KIF21BO75037 1637 aa27.89■■■□□ 2.05
PGPEP1-209ENST00000604499 CHD1O14646 1710 aa27.87■■■□□ 2.05
PGPEP1-209ENST00000604499 NUP160Q12769 1436 aa27.79■■■□□ 2.04
PGPEP1-209ENST00000604499 GOLGA3Q08378 1498 aa27.78■■■□□ 2.04
PGPEP1-209ENST00000604499 CEP170Q5SW79 1584 aa27.75■■■□□ 2.03
PGPEP1-209ENST00000604499 OSCARQ8IYS5 282 aa27.72■■■□□ 2.03
PGPEP1-209ENST00000604499 EHMT2Q96KQ7 1210 aa27.71■■■□□ 2.03
PGPEP1-209ENST00000604499 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa27.66■■■□□ 2.02
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