RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000604372.5

MCU-208, Transcript of mitochondrial calcium uniporter, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene MCU, Length 894 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCU-208ENST00000604372 NISCHQ9Y2I1 1504 aa67.19■■■■■ 8.35
MCU-208ENST00000604372 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa59.73■■■■■ 7.15
MCU-208ENST00000604372 ABCC9O60706 1549 aa58.02■■■■■ 6.88
MCU-208ENST00000604372 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP56.04■■■■■ 6.56
MCU-208ENST00000604372 NACADO15069 1562 aa56■■■■■ 6.56
MCU-208ENST00000604372 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa56■■■■■ 6.56
MCU-208ENST00000604372 MYO15BQ96JP2 1530 aa55.79■■■■■ 6.52
MCU-208ENST00000604372 DCAF8L2P0C7V8 631 aa55.79■■■■■ 6.52
MCU-208ENST00000604372 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa55.65■■■■■ 6.5
MCU-208ENST00000604372 UNC13AQ9UPW8 1703 aa54.91■■■■■ 6.38
MCU-208ENST00000604372 SCRIBQ14160 1630 aa54.42■■■■■ 6.3
MCU-208ENST00000604372 BICRAQ9NZM4 1560 aa54.37■■■■■ 6.29
MCU-208ENST00000604372 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP54.18■■■■■ 6.26
MCU-208ENST00000604372 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa53.77■■■■■ 6.2
MCU-208ENST00000604372 DNAJC5BQ9UF47 199 aa53■■■■■ 6.07
MCU-208ENST00000604372 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP52.86■■■■■ 6.05
MCU-208ENST00000604372 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa52.58■■■■■ 6.01
MCU-208ENST00000604372 CECR2Q9BXF3 1484 aa52.29■■■■■ 5.96
MCU-208ENST00000604372 SMARCA4P51532 1647 aa52.12■■■■■ 5.93
MCU-208ENST00000604372 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP52.06■■■■■ 5.92
MCU-208ENST00000604372 MROH2BQ7Z745 1585 aa51.79■■■■■ 5.88
MCU-208ENST00000604372 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa51.71■■■■■ 5.87
MCU-208ENST00000604372 SMARCA2P51531 1590 aa51.68■■■■■ 5.86
MCU-208ENST00000604372 NCAPD3P42695 1498 aa51.64■■■■■ 5.86
MCU-208ENST00000604372 PEG3Q9GZU2 1588 aa51.63■■■■■ 5.86
MCU-208ENST00000604372 HMGXB3Q12766 1538 aa51.47■■■■■ 5.83
MCU-208ENST00000604372 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP51.29■■■■■ 5.8
MCU-208ENST00000604372 WIZO95785 1651 aa51.28■■■■■ 5.8
MCU-208ENST00000604372 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP51.25■■■■■ 5.79
MCU-208ENST00000604372 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP50.72■■■■■ 5.71
MCU-208ENST00000604372 NESP48681 1621 aa50.33■■■■■ 5.65
MCU-208ENST00000604372 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa50.29■■■■■ 5.64
MCU-208ENST00000604372 CADPSQ9ULU8 1353 aa50.11■■■■■ 5.61
MCU-208ENST00000604372 CCDC88BA6NC98 1476 aa50.08■■■■■ 5.61
MCU-208ENST00000604372 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP49.99■■■■■ 5.59
MCU-208ENST00000604372 ERCC6Q03468 1493 aa49.95■■■■■ 5.59
MCU-208ENST00000604372 CFTRP13569 1480 aa49.91■■■■■ 5.58
MCU-208ENST00000604372 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa49.85■■■■■ 5.57
MCU-208ENST00000604372 PDS5BQ9NTI5 1447 aa49.84■■■■■ 5.57
MCU-208ENST00000604372 PRDM2Q13029 1718 aa49.75■■■■■ 5.55
MCU-208ENST00000604372 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP49.61■■■■■ 5.53
MCU-208ENST00000604372 FANCD2Q9BXW9 1451 aa49.56■■■■■ 5.52
MCU-208ENST00000604372 CEP164Q9UPV0 1460 aa49.48■■■■■ 5.51
MCU-208ENST00000604372 CUX2O14529 1486 aa49.41■■■■■ 5.5
MCU-208ENST00000604372 MRC2Q9UBG0 1479 aa49.37■■■■■ 5.49
MCU-208ENST00000604372 WDR62O43379 1518 aa49.24■■■■■ 5.47
MCU-208ENST00000604372 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP49.09■■■■■ 5.45
MCU-208ENST00000604372 TOPBP1Q92547 1522 aa48.83■■■■■ 5.41
MCU-208ENST00000604372 DNMBPQ6XZF7 1577 aa48.82■■■■■ 5.41
MCU-208ENST00000604372 ABCC8Q09428 1581 aa48.81■■■■■ 5.4
MCU-208ENST00000604372 CUX1P39880 1505 aa48.58■■■■■ 5.37
MCU-208ENST00000604372 IFT140Q96RY7 1462 aa48.42■■■■■ 5.34
MCU-208ENST00000604372 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP48.42■■■■■ 5.34
MCU-208ENST00000604372 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP48.34■■■■■ 5.33
MCU-208ENST00000604372 FGD5Q6ZNL6 1462 aa48.34■■■■■ 5.33
MCU-208ENST00000604372 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa48.29■■■■■ 5.32
MCU-208ENST00000604372 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP48.29■■■■■ 5.32
MCU-208ENST00000604372 TOP2BQ02880 1626 aa48.25■■■■■ 5.32
MCU-208ENST00000604372 SYNJ1O43426 1573 aa48.25■■■■■ 5.31
MCU-208ENST00000604372 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP48.2■■■■■ 5.31
MCU-208ENST00000604372 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa48.18■■■■■ 5.3
MCU-208ENST00000604372 SOGA1O94964 1423 aa48.16■■■■■ 5.3
MCU-208ENST00000604372 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP48.09■■■■■ 5.29
MCU-208ENST00000604372 WDR97A6NE52 1622 aa48.07■■■■■ 5.29
MCU-208ENST00000604372 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP47.91■■■■■ 5.26
MCU-208ENST00000604372 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa47.9■■■■■ 5.26
MCU-208ENST00000604372 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP47.85■■■■■ 5.25
MCU-208ENST00000604372 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa47.75■■■■■ 5.23
MCU-208ENST00000604372 PBRM1Q86U86 1689 aa47.67■■■■■ 5.22
MCU-208ENST00000604372 GAPVD1Q14C86 1478 aa47.65■■■■■ 5.22
MCU-208ENST00000604372 GRIN2BQ13224 1484 aa47.6■■■■■ 5.21
MCU-208ENST00000604372 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa47.52■■■■■ 5.2
MCU-208ENST00000604372 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa47.51■■■■■ 5.2
MCU-208ENST00000604372 CHD1O14646 1710 aa47.49■■■■■ 5.19
MCU-208ENST00000604372 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP47.48■■■■■ 5.19
MCU-208ENST00000604372 ERICH3Q5RHP9 1530 aa47.35■■■■■ 5.17
MCU-208ENST00000604372 OSCARQ8IYS5 282 aa47.3■■■■■ 5.16
MCU-208ENST00000604372 SYNJ2O15056 1496 aa47.28■■■■■ 5.16
MCU-208ENST00000604372 ADAMTS12P58397 1594 aa47.26■■■■■ 5.16
MCU-208ENST00000604372 KIF27Q86VH2 1401 aa47.24■■■■■ 5.15
MCU-208ENST00000604372 TRIM41Q8WV44 630 aa47.22■■■■■ 5.15
MCU-208ENST00000604372 FBLN2P98095 1184 aa47.17■■■■■ 5.14
MCU-208ENST00000604372 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP47.12■■■■■ 5.13
MCU-208ENST00000604372 FHAD1B1AJZ9 1412 aa47.1■■■■■ 5.13
MCU-208ENST00000604372 IGF1RP08069 1367 aa47.02■■■■■ 5.12
MCU-208ENST00000604372 GRIN2AQ12879 1464 aa47.02■■■■■ 5.12
MCU-208ENST00000604372 CUL7Q14999 1698 aa47■■■■■ 5.12
MCU-208ENST00000604372 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa46.95■■■■■ 5.11
MCU-208ENST00000604372 CLASP1Q7Z460 1538 aa46.93■■■■■ 5.1
MCU-208ENST00000604372 CHIC1Q5VXU3 224 aa46.87■■■■■ 5.09
MCU-208ENST00000604372 CEP170Q5SW79 1584 aa46.81■■■■■ 5.08
MCU-208ENST00000604372 NUP160Q12769 1436 aa46.81■■■■■ 5.08
MCU-208ENST00000604372 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa46.73■■■■■ 5.07
MCU-208ENST00000604372 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa46.68■■■■■ 5.06
MCU-208ENST00000604372 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa46.68■■■■■ 5.06
MCU-208ENST00000604372 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa46.68■■■■■ 5.06
MCU-208ENST00000604372 ARHGEF11O15085 1522 aa46.65■■■■■ 5.06
MCU-208ENST00000604372 EEA1Q15075 1411 aa46.53■■■■■ 5.04
MCU-208ENST00000604372 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa46.52■■■■■ 5.04
MCU-208ENST00000604372 SHROOM2Q13796 1616 aa46.51■■■■■ 5.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.3 ms