RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000600277.5

SLC27A1-208, Transcript of solute carrier family 27 member 1, humanhuman

TSL 2

Gene SLC27A1, Length 1,423 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A1-208ENST00000600277 NISCHQ9Y2I1 1504 aa52.31■■■■■ 5.96
SLC27A1-208ENST00000600277 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa46.2■■■■■ 4.99
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SLC27A1-208ENST00000600277 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP43.75■■■■■ 4.59
SLC27A1-208ENST00000600277 DCAF8L2P0C7V8 631 aa43.66■■■■■ 4.58
SLC27A1-208ENST00000600277 NACADO15069 1562 aa43.37■■■■■ 4.53
SLC27A1-208ENST00000600277 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa43.35■■■■■ 4.53
SLC27A1-208ENST00000600277 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa43.33■■■■■ 4.53
SLC27A1-208ENST00000600277 MYO15BQ96JP2 1530 aa43.28■■■■■ 4.52
SLC27A1-208ENST00000600277 UNC13AQ9UPW8 1703 aa42.25■■■■■ 4.35
SLC27A1-208ENST00000600277 SCRIBQ14160 1630 aa42.23■■■■■ 4.35
SLC27A1-208ENST00000600277 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP42.19■■■■■ 4.34
SLC27A1-208ENST00000600277 DNAJC5BQ9UF47 199 aa42.14■■■■■ 4.34
SLC27A1-208ENST00000600277 BICRAQ9NZM4 1560 aa41.92■■■■■ 4.3
SLC27A1-208ENST00000600277 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa41.71■■■■■ 4.27
SLC27A1-208ENST00000600277 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP40.82■■■■■ 4.13
SLC27A1-208ENST00000600277 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa40.76■■■■■ 4.12
SLC27A1-208ENST00000600277 CECR2Q9BXF3 1484 aa40.68■■■■■ 4.1
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SLC27A1-208ENST00000600277 MROH2BQ7Z745 1585 aa40.32■■■■■ 4.05
SLC27A1-208ENST00000600277 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP40.17■■■■■ 4.02
SLC27A1-208ENST00000600277 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa40.1■■■■■ 4.01
SLC27A1-208ENST00000600277 SMARCA2P51531 1590 aa40.1■■■■■ 4.01
SLC27A1-208ENST00000600277 PEG3Q9GZU2 1588 aa40.04■■■■■ 4
SLC27A1-208ENST00000600277 NCAPD3P42695 1498 aa40.02■■■■■ 4
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SLC27A1-208ENST00000600277 NESP48681 1621 aa38.91■■■■□ 3.82
SLC27A1-208ENST00000600277 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa38.89■■■■□ 3.82
SLC27A1-208ENST00000600277 CFTRP13569 1480 aa38.74■■■■□ 3.79
SLC27A1-208ENST00000600277 CUX2O14529 1486 aa38.72■■■■□ 3.79
SLC27A1-208ENST00000600277 PDS5BQ9NTI5 1447 aa38.67■■■■□ 3.78
SLC27A1-208ENST00000600277 FANCD2Q9BXW9 1451 aa38.45■■■■□ 3.75
SLC27A1-208ENST00000600277 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa38.43■■■■□ 3.74
SLC27A1-208ENST00000600277 PRDM2Q13029 1718 aa38.43■■■■□ 3.74
SLC27A1-208ENST00000600277 CEP164Q9UPV0 1460 aa38.37■■■■□ 3.73
SLC27A1-208ENST00000600277 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa38.37■■■■□ 3.73
SLC27A1-208ENST00000600277 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP38.36■■■■□ 3.73
SLC27A1-208ENST00000600277 MRC2Q9UBG0 1479 aa38.2■■■■□ 3.71
SLC27A1-208ENST00000600277 WDR62O43379 1518 aa38.02■■■■□ 3.68
SLC27A1-208ENST00000600277 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP38■■■■□ 3.67
SLC27A1-208ENST00000600277 ABCC8Q09428 1581 aa37.95■■■■□ 3.67
SLC27A1-208ENST00000600277 TOPBP1Q92547 1522 aa37.87■■■■□ 3.65
SLC27A1-208ENST00000600277 DNMBPQ6XZF7 1577 aa37.86■■■■□ 3.65
SLC27A1-208ENST00000600277 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP37.82■■■■□ 3.64
SLC27A1-208ENST00000600277 CUX1P39880 1505 aa37.77■■■■□ 3.64
SLC27A1-208ENST00000600277 SYNJ1O43426 1573 aa37.64■■■■□ 3.62
SLC27A1-208ENST00000600277 TOP2BQ02880 1626 aa37.61■■■■□ 3.61
SLC27A1-208ENST00000600277 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP37.57■■■■□ 3.61
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SLC27A1-208ENST00000600277 IFT140Q96RY7 1462 aa37.54■■■■□ 3.6
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SLC27A1-208ENST00000600277 CHIC1Q5VXU3 224 aa37.49■■■■□ 3.59
SLC27A1-208ENST00000600277 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa37.43■■■■□ 3.58
SLC27A1-208ENST00000600277 TRIM41Q8WV44 630 aa37.41■■■■□ 3.58
SLC27A1-208ENST00000600277 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP37.38■■■■□ 3.57
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SLC27A1-208ENST00000600277 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP37.19■■■■□ 3.54
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SLC27A1-208ENST00000600277 WDR97A6NE52 1622 aa37.14■■■■□ 3.54
SLC27A1-208ENST00000600277 OSCARQ8IYS5 282 aa37.1■■■■□ 3.53
SLC27A1-208ENST00000600277 GAPVD1Q14C86 1478 aa37.05■■■■□ 3.52
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SLC27A1-208ENST00000600277 PBRM1Q86U86 1689 aa36.87■■■■□ 3.49
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SLC27A1-208ENST00000600277 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP36.81■■■■□ 3.48
SLC27A1-208ENST00000600277 IGF1RP08069 1367 aa36.79■■■■□ 3.48
SLC27A1-208ENST00000600277 ERICH3Q5RHP9 1530 aa36.78■■■■□ 3.48
SLC27A1-208ENST00000600277 FBLN2P98095 1184 aa36.77■■■■□ 3.48
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SLC27A1-208ENST00000600277 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP36.72■■■■□ 3.47
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SLC27A1-208ENST00000600277 PRXQ9BXM0 1461 aa36.5■■■■□ 3.43
SLC27A1-208ENST00000600277 GRIN2AQ12879 1464 aa36.48■■■■□ 3.43
SLC27A1-208ENST00000600277 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa36.48■■■■□ 3.43
SLC27A1-208ENST00000600277 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa36.48■■■■□ 3.43
SLC27A1-208ENST00000600277 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa36.48■■■■□ 3.43
SLC27A1-208ENST00000600277 ARHGEF11O15085 1522 aa36.44■■■■□ 3.42
SLC27A1-208ENST00000600277 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa36.38■■■■□ 3.41
SLC27A1-208ENST00000600277 NUP160Q12769 1436 aa36.27■■■■□ 3.4
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