RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597793.5

PTOV1-209, Transcript of prostate tumor overexpressed 1, human

TSL 1 (best)

Gene PTOV1, Length 1,716 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTOV1-209	ENST00000597793	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		45.59	■■■■■ 4.89
PTOV1-209	ENST00000597793	CCDC180	Q9P1Z9	1646 aa		40.33	■■■■■ 4.05
PTOV1-209	ENST00000597793	ABCC9	O60706	1549 aa		38.72	■■■■□ 3.79
PTOV1-209	ENST00000597793	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	38.12	■■■■□ 3.69
PTOV1-209	ENST00000597793	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		37.83	■■■■□ 3.65
PTOV1-209	ENST00000597793	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		37.78	■■■■□ 3.64
PTOV1-209	ENST00000597793	NACAD	O15069	1562 aa		37.76	■■■■□ 3.64
PTOV1-209	ENST00000597793	DCAF8L2	P0C7V8	631 aa		37.75	■■■■□ 3.63
PTOV1-209	ENST00000597793	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		37.64	■■■■□ 3.62
PTOV1-209	ENST00000597793	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		36.76	■■■■□ 3.47
PTOV1-209	ENST00000597793	SCRIB	Q14160	1630 aa		36.74	■■■■□ 3.47
PTOV1-209	ENST00000597793	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		36.4	■■■■□ 3.42
PTOV1-209	ENST00000597793	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		36.27	■■■■□ 3.4
PTOV1-209	ENST00000597793	PABPN1	Q86U42	306 aa	Known RBP eCLIP	36.25	■■■■□ 3.39	2e-6	■■■□□ 16.9
PTOV1-209	ENST00000597793	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	35.42	■■■■□ 3.26
PTOV1-209	ENST00000597793	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		35.36	■■■■□ 3.25
PTOV1-209	ENST00000597793	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	35.34	■■■■□ 3.25
PTOV1-209	ENST00000597793	SMARCA4	P51532	1647 aa		35.25	■■■■□ 3.23
PTOV1-209	ENST00000597793	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		35.1	■■■■□ 3.21
PTOV1-209	ENST00000597793	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		35.1	■■■■□ 3.21
PTOV1-209	ENST00000597793	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	34.94	■■■■□ 3.18
PTOV1-209	ENST00000597793	SMARCA2	P51531	1590 aa		34.94	■■■■□ 3.18
PTOV1-209	ENST00000597793	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		34.94	■■■■□ 3.18
PTOV1-209	ENST00000597793	DNAJC5B	Q9UF47	199 aa		34.89	■■■■□ 3.18
PTOV1-209	ENST00000597793	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		34.88	■■■■□ 3.17
PTOV1-209	ENST00000597793	NCAPD3	P42695	1498 aa		34.8	■■■■□ 3.16
PTOV1-209	ENST00000597793	WIZ	O95785	1651 aa		34.77	■■■■□ 3.16
PTOV1-209	ENST00000597793	HMGXB3	Q12766	1538 aa		34.72	■■■■□ 3.15
PTOV1-209	ENST00000597793	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	34.65	■■■■□ 3.14
PTOV1-209	ENST00000597793	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	34.48	■■■■□ 3.11
PTOV1-209	ENST00000597793	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	34.47	■■■■□ 3.11
PTOV1-209	ENST00000597793	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		34.03	■■■■□ 3.04
PTOV1-209	ENST00000597793	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		33.82	■■■■□ 3
PTOV1-209	ENST00000597793	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		33.8	■■■■□ 3
PTOV1-209	ENST00000597793	CFTR	P13569	1480 aa		33.75	■■■□□ 2.99
PTOV1-209	ENST00000597793	NES	P48681	1621 aa		33.67	■■■□□ 2.98
PTOV1-209	ENST00000597793	PRDM2	Q13029	1718 aa		33.61	■■■□□ 2.97
PTOV1-209	ENST00000597793	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		33.56	■■■□□ 2.96
PTOV1-209	ENST00000597793	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		33.41	■■■□□ 2.94
PTOV1-209	ENST00000597793	ERCC6	Q03468	1493 aa		33.39	■■■□□ 2.94
PTOV1-209	ENST00000597793	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		33.36	■■■□□ 2.93
PTOV1-209	ENST00000597793	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		33.33	■■■□□ 2.93
PTOV1-209	ENST00000597793	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		33.14	■■■□□ 2.9
PTOV1-209	ENST00000597793	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	33.1	■■■□□ 2.89
PTOV1-209	ENST00000597793	ABCC8	Q09428	1581 aa		33.07	■■■□□ 2.88
PTOV1-209	ENST00000597793	WDR62	O43379	1518 aa		33.02	■■■□□ 2.88
PTOV1-209	ENST00000597793	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	33	■■■□□ 2.87
PTOV1-209	ENST00000597793	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		32.99	■■■□□ 2.87
PTOV1-209	ENST00000597793	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	32.96	■■■□□ 2.87	4e-6	■■■□□ 17.4
PTOV1-209	ENST00000597793	TOPBP1	Q92547	1522 aa		32.94	■■■□□ 2.86
PTOV1-209	ENST00000597793	CUX1	P39880	1505 aa		32.9	■■■□□ 2.86
PTOV1-209	ENST00000597793	CUX2	O14529	1486 aa		32.85	■■■□□ 2.85
PTOV1-209	ENST00000597793	TOP2B	Q02880	1626 aa		32.85	■■■□□ 2.85
PTOV1-209	ENST00000597793	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		32.84	■■■□□ 2.85
PTOV1-209	ENST00000597793	SYNJ1	O43426	1573 aa		32.81	■■■□□ 2.84
PTOV1-209	ENST00000597793	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		32.71	■■■□□ 2.83
PTOV1-209	ENST00000597793	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	32.7	■■■□□ 2.83
PTOV1-209	ENST00000597793	IFT140	Q96RY7	1462 aa		32.61	■■■□□ 2.81
PTOV1-209	ENST00000597793	TRIM41	Q8WV44	630 aa		32.6	■■■□□ 2.81
PTOV1-209	ENST00000597793	SOGA1	O94964	1423 aa		32.58	■■■□□ 2.81
PTOV1-209	ENST00000597793	CHIC1	Q5VXU3	224 aa		32.56	■■■□□ 2.8
PTOV1-209	ENST00000597793	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	32.54	■■■□□ 2.8
PTOV1-209	ENST00000597793	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		32.49	■■■□□ 2.79
PTOV1-209	ENST00000597793	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		32.46	■■■□□ 2.79
PTOV1-209	ENST00000597793	WDR97	A6NE52	1622 aa		32.44	■■■□□ 2.78
PTOV1-209	ENST00000597793	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	32.32	■■■□□ 2.76
PTOV1-209	ENST00000597793	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	32.29	■■■□□ 2.76
PTOV1-209	ENST00000597793	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	32.27	■■■□□ 2.76
PTOV1-209	ENST00000597793	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		32.27	■■■□□ 2.76
PTOV1-209	ENST00000597793	KIF27	Q86VH2	1401 aa		32.25	■■■□□ 2.75
PTOV1-209	ENST00000597793	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		32.23	■■■□□ 2.75
PTOV1-209	ENST00000597793	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	32.23	■■■□□ 2.75	4e-8	■■■■■ 31.7
PTOV1-209	ENST00000597793	GRIN2B	Q13224	1484 aa		32.15	■■■□□ 2.74
PTOV1-209	ENST00000597793	PBRM1	Q86U86	1689 aa		32.14	■■■□□ 2.74
PTOV1-209	ENST00000597793	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		32.11	■■■□□ 2.73
PTOV1-209	ENST00000597793	EEA1	Q15075	1411 aa		32.11	■■■□□ 2.73
PTOV1-209	ENST00000597793	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	32.03	■■■□□ 2.72
PTOV1-209	ENST00000597793	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		32.02	■■■□□ 2.72
PTOV1-209	ENST00000597793	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		31.98	■■■□□ 2.71
PTOV1-209	ENST00000597793	IGF1R	P08069	1367 aa		31.98	■■■□□ 2.71
PTOV1-209	ENST00000597793	CUL7	Q14999	1698 aa		31.96	■■■□□ 2.71
PTOV1-209	ENST00000597793	ADAMTS12	P58397	1594 aa		31.9	■■■□□ 2.7
PTOV1-209	ENST00000597793	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		31.9	■■■□□ 2.7
PTOV1-209	ENST00000597793	CSRNP3	Q8WYN3	585 aa		31.88	■■■□□ 2.69
PTOV1-209	ENST00000597793	SYNJ2	O15056	1496 aa		31.88	■■■□□ 2.69
PTOV1-209	ENST00000597793	CARMIL1	Q5VZK9	1371 aa		31.83	■■■□□ 2.69
PTOV1-209	ENST00000597793	FAM9A	Q8IZU1	332 aa	Predicted RBP	31.81	■■■□□ 2.68
PTOV1-209	ENST00000597793	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	31.79	■■■□□ 2.68
PTOV1-209	ENST00000597793	CHD1	O14646	1710 aa		31.76	■■■□□ 2.68
PTOV1-209	ENST00000597793	PRX	Q9BXM0	1461 aa		31.76	■■■□□ 2.67
PTOV1-209	ENST00000597793	RAPGEF2	Q9Y4G8	1499 aa		31.73	■■■□□ 2.67
PTOV1-209	ENST00000597793	GRIN2A	Q12879	1464 aa		31.73	■■■□□ 2.67
PTOV1-209	ENST00000597793	FBLN2	P98095	1184 aa		31.72	■■■□□ 2.67
PTOV1-209	ENST00000597793	KIF21B	O75037	1637 aa		31.68	■■■□□ 2.66
PTOV1-209	ENST00000597793	OSCAR	Q8IYS5	282 aa		31.57	■■■□□ 2.64
PTOV1-209	ENST00000597793	NUP160	Q12769	1436 aa		31.56	■■■□□ 2.64
PTOV1-209	ENST00000597793	GOLGA3	Q08378	1498 aa		31.53	■■■□□ 2.64
PTOV1-209	ENST00000597793	CEP170	Q5SW79	1584 aa		31.51	■■■□□ 2.64
PTOV1-209	ENST00000597793	CTTNBP2	Q8WZ74	1663 aa		31.44	■■■□□ 2.62
PTOV1-209	ENST00000597793	KIAA0586	Q9BVV6	1533 aa		31.43	■■■□□ 2.62

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