RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000596788.1

IRF3-214, Transcript of interferon regulatory factor 3, humanhuman

TSL 3

Gene IRF3, Length 447 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF3-214ENST00000596788 NISCHQ9Y2I1 1504 aa49.27■■■■■ 5.48
IRF3-214ENST00000596788 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa43.49■■■■■ 4.55
IRF3-214ENST00000596788 ABCC9O60706 1549 aa41.64■■■■■ 4.26
IRF3-214ENST00000596788 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP41.28■■■■■ 4.2
IRF3-214ENST00000596788 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa40.8■■■■■ 4.12
IRF3-214ENST00000596788 DCAF8L2P0C7V8 631 aa40.65■■■■■ 4.1
IRF3-214ENST00000596788 MYO15BQ96JP2 1530 aa40.62■■■■■ 4.09
IRF3-214ENST00000596788 NACADO15069 1562 aa40.59■■■■■ 4.09
IRF3-214ENST00000596788 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa40.44■■■■■ 4.06
IRF3-214ENST00000596788 SCRIBQ14160 1630 aa39.77■■■■□ 3.96
IRF3-214ENST00000596788 UNC13AQ9UPW8 1703 aa39.69■■■■□ 3.94
IRF3-214ENST00000596788 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa39.47■■■■□ 3.91
IRF3-214ENST00000596788 BICRAQ9NZM4 1560 aa39.25■■■■□ 3.87
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IRF3-214ENST00000596788 CECR2Q9BXF3 1484 aa38.3■■■■□ 3.72
IRF3-214ENST00000596788 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP38.13■■■■□ 3.69
IRF3-214ENST00000596788 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP38.1■■■■□ 3.69
IRF3-214ENST00000596788 SMARCA4P51532 1647 aa38.1■■■■□ 3.69
IRF3-214ENST00000596788 MROH2BQ7Z745 1585 aa38.02■■■■□ 3.68
IRF3-214ENST00000596788 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP37.86■■■■□ 3.65
IRF3-214ENST00000596788 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa37.74■■■■□ 3.63
IRF3-214ENST00000596788 WIZO95785 1651 aa37.7■■■■□ 3.63
IRF3-214ENST00000596788 PEG3Q9GZU2 1588 aa37.68■■■■□ 3.62
IRF3-214ENST00000596788 SMARCA2P51531 1590 aa37.6■■■■□ 3.61
IRF3-214ENST00000596788 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa37.6■■■■□ 3.61
IRF3-214ENST00000596788 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP37.49■■■■□ 3.59
IRF3-214ENST00000596788 NCAPD3P42695 1498 aa37.4■■■■□ 3.58
IRF3-214ENST00000596788 HMGXB3Q12766 1538 aa37.38■■■■□ 3.57
IRF3-214ENST00000596788 DNAJC5BQ9UF47 199 aa37.35■■■■□ 3.57
IRF3-214ENST00000596788 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP37.34■■■■□ 3.57
IRF3-214ENST00000596788 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP37.32■■■■□ 3.57
IRF3-214ENST00000596788 CCDC88BA6NC98 1476 aa36.82■■■■□ 3.49
IRF3-214ENST00000596788 CFTRP13569 1480 aa36.36■■■■□ 3.41
IRF3-214ENST00000596788 CADPSQ9ULU8 1353 aa36.34■■■■□ 3.41
IRF3-214ENST00000596788 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa36.33■■■■□ 3.41
IRF3-214ENST00000596788 PRDM2Q13029 1718 aa36.33■■■■□ 3.41
IRF3-214ENST00000596788 NESP48681 1621 aa36.32■■■■□ 3.4
IRF3-214ENST00000596788 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa36■■■■□ 3.35
IRF3-214ENST00000596788 FANCD2Q9BXW9 1451 aa35.99■■■■□ 3.35
IRF3-214ENST00000596788 PDS5BQ9NTI5 1447 aa35.97■■■■□ 3.35
IRF3-214ENST00000596788 CEP164Q9UPV0 1460 aa35.86■■■■□ 3.33
IRF3-214ENST00000596788 ABCC8Q09428 1581 aa35.83■■■■□ 3.33
IRF3-214ENST00000596788 ERCC6Q03468 1493 aa35.78■■■■□ 3.32
IRF3-214ENST00000596788 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP35.66■■■■□ 3.3
IRF3-214ENST00000596788 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP35.64■■■■□ 3.3
IRF3-214ENST00000596788 SYNJ1O43426 1573 aa35.64■■■■□ 3.3
IRF3-214ENST00000596788 CUX1P39880 1505 aa35.63■■■■□ 3.29
IRF3-214ENST00000596788 MRC2Q9UBG0 1479 aa35.63■■■■□ 3.29
IRF3-214ENST00000596788 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP35.62■■■■□ 3.29
IRF3-214ENST00000596788 DNMBPQ6XZF7 1577 aa35.59■■■■□ 3.29
IRF3-214ENST00000596788 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa35.58■■■■□ 3.29
IRF3-214ENST00000596788 TOP2BQ02880 1626 aa35.55■■■■□ 3.28
IRF3-214ENST00000596788 TOPBP1Q92547 1522 aa35.53■■■■□ 3.28
IRF3-214ENST00000596788 WDR62O43379 1518 aa35.52■■■■□ 3.28
IRF3-214ENST00000596788 CHIC1Q5VXU3 224 aa35.52■■■■□ 3.28
IRF3-214ENST00000596788 FGD5Q6ZNL6 1462 aa35.35■■■■□ 3.25
IRF3-214ENST00000596788 TRIM41Q8WV44 630 aa35.33■■■■□ 3.25
IRF3-214ENST00000596788 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP35.29■■■■□ 3.24
IRF3-214ENST00000596788 CUX2O14529 1486 aa35.17■■■■□ 3.22
IRF3-214ENST00000596788 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa35.13■■■■□ 3.21
IRF3-214ENST00000596788 WDR97A6NE52 1622 aa35.13■■■■□ 3.21
IRF3-214ENST00000596788 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP35.13■■■■□ 3.21
IRF3-214ENST00000596788 SOGA1O94964 1423 aa35.08■■■■□ 3.21
IRF3-214ENST00000596788 IFT140Q96RY7 1462 aa35.05■■■■□ 3.2
IRF3-214ENST00000596788 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa35.02■■■■□ 3.2
IRF3-214ENST00000596788 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa34.89■■■■□ 3.18
IRF3-214ENST00000596788 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP34.86■■■■□ 3.17
IRF3-214ENST00000596788 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa34.86■■■■□ 3.17
IRF3-214ENST00000596788 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP34.83■■■■□ 3.17
IRF3-214ENST00000596788 KIF27Q86VH2 1401 aa34.81■■■■□ 3.16
IRF3-214ENST00000596788 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP34.79■■■■□ 3.16
IRF3-214ENST00000596788 PBRM1Q86U86 1689 aa34.75■■■■□ 3.15
IRF3-214ENST00000596788 GAPVD1Q14C86 1478 aa34.74■■■■□ 3.15
IRF3-214ENST00000596788 EEA1Q15075 1411 aa34.73■■■■□ 3.15
IRF3-214ENST00000596788 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP34.73■■■■□ 3.153e-9■■■■■ 32.4
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IRF3-214ENST00000596788 ERICH3Q5RHP9 1530 aa34.62■■■■□ 3.13
IRF3-214ENST00000596788 GRIN2BQ13224 1484 aa34.6■■■■□ 3.13
IRF3-214ENST00000596788 IGF1RP08069 1367 aa34.54■■■■□ 3.12
IRF3-214ENST00000596788 CUL7Q14999 1698 aa34.53■■■■□ 3.12
IRF3-214ENST00000596788 ADAMTS12P58397 1594 aa34.49■■■■□ 3.11
IRF3-214ENST00000596788 CSRNP3Q8WYN3 585 aa34.49■■■■□ 3.11
IRF3-214ENST00000596788 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa34.49■■■■□ 3.11
IRF3-214ENST00000596788 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP34.44■■■■□ 3.1
IRF3-214ENST00000596788 KIF21BO75037 1637 aa34.42■■■■□ 3.1
IRF3-214ENST00000596788 PRXQ9BXM0 1461 aa34.41■■■■□ 3.1
IRF3-214ENST00000596788 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa34.36■■■■□ 3.09
IRF3-214ENST00000596788 FHAD1B1AJZ9 1412 aa34.35■■■■□ 3.09
IRF3-214ENST00000596788 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa34.29■■■■□ 3.08
IRF3-214ENST00000596788 SYNJ2O15056 1496 aa34.28■■■■□ 3.08
IRF3-214ENST00000596788 CHD1O14646 1710 aa34.26■■■■□ 3.07
IRF3-214ENST00000596788 GOLGA3Q08378 1498 aa34.23■■■■□ 3.07
IRF3-214ENST00000596788 GRIN2AQ12879 1464 aa34.2■■■■□ 3.06
IRF3-214ENST00000596788 EHMT2Q96KQ7 1210 aa34.14■■■■□ 3.06
IRF3-214ENST00000596788 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP34.09■■■■□ 3.05
IRF3-214ENST00000596788 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa34.07■■■■□ 3.04
IRF3-214ENST00000596788 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa34.06■■■■□ 3.04
IRF3-214ENST00000596788 FBLN2P98095 1184 aa34.06■■■■□ 3.04
IRF3-214ENST00000596788 CEP170Q5SW79 1584 aa34.05■■■■□ 3.04
IRF3-214ENST00000596788 NUP160Q12769 1436 aa34■■■■□ 3.03
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