RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000595565.5

TIMM44-202, Transcript of translocase of inner mitochondrial membrane 44, humanhuman

TSL 3

Gene TIMM44, Length 868 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM44-202ENST00000595565 NISCHQ9Y2I1 1504 aa34.11■■■■□ 3.05
TIMM44-202ENST00000595565 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa30.51■■■□□ 2.48
TIMM44-202ENST00000595565 ABCC9O60706 1549 aa29.76■■■□□ 2.36
TIMM44-202ENST00000595565 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa28.68■■■□□ 2.18
TIMM44-202ENST00000595565 NACADO15069 1562 aa28.64■■■□□ 2.18
TIMM44-202ENST00000595565 MYO15BQ96JP2 1530 aa28.53■■■□□ 2.16
TIMM44-202ENST00000595565 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP28.46■■■□□ 2.15
TIMM44-202ENST00000595565 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa28.33■■■□□ 2.13
TIMM44-202ENST00000595565 DCAF8L2P0C7V8 631 aa28.12■■■□□ 2.09
TIMM44-202ENST00000595565 UNC13AQ9UPW8 1703 aa28.09■■■□□ 2.09
TIMM44-202ENST00000595565 BICRAQ9NZM4 1560 aa27.9■■■□□ 2.06
TIMM44-202ENST00000595565 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa27.67■■■□□ 2.02
TIMM44-202ENST00000595565 SCRIBQ14160 1630 aa27.67■■■□□ 2.02
TIMM44-202ENST00000595565 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP27.65■■■□□ 2.02
TIMM44-202ENST00000595565 DNAJC5BQ9UF47 199 aa27.41■■□□□ 1.98
TIMM44-202ENST00000595565 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP27.12■■□□□ 1.93
TIMM44-202ENST00000595565 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa27.01■■□□□ 1.92
TIMM44-202ENST00000595565 CECR2Q9BXF3 1484 aa26.8■■□□□ 1.88
TIMM44-202ENST00000595565 SMARCA4P51532 1647 aa26.53■■□□□ 1.84
TIMM44-202ENST00000595565 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP26.46■■□□□ 1.83
TIMM44-202ENST00000595565 NCAPD3P42695 1498 aa26.41■■□□□ 1.82
TIMM44-202ENST00000595565 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa26.38■■□□□ 1.81
TIMM44-202ENST00000595565 SMARCA2P51531 1590 aa26.37■■□□□ 1.81
TIMM44-202ENST00000595565 PEG3Q9GZU2 1588 aa26.37■■□□□ 1.81
TIMM44-202ENST00000595565 HMGXB3Q12766 1538 aa26.34■■□□□ 1.81
TIMM44-202ENST00000595565 MROH2BQ7Z745 1585 aa26.26■■□□□ 1.79
TIMM44-202ENST00000595565 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP26.11■■□□□ 1.77
TIMM44-202ENST00000595565 WIZO95785 1651 aa25.96■■□□□ 1.75
TIMM44-202ENST00000595565 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP25.88■■□□□ 1.73
TIMM44-202ENST00000595565 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa25.76■■□□□ 1.71
TIMM44-202ENST00000595565 NESP48681 1621 aa25.75■■□□□ 1.71
TIMM44-202ENST00000595565 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP25.73■■□□□ 1.71
TIMM44-202ENST00000595565 ERCC6Q03468 1493 aa25.64■■□□□ 1.69
TIMM44-202ENST00000595565 CUX2O14529 1486 aa25.57■■□□□ 1.68
TIMM44-202ENST00000595565 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP25.55■■□□□ 1.68
TIMM44-202ENST00000595565 CADPSQ9ULU8 1353 aa25.55■■□□□ 1.68
TIMM44-202ENST00000595565 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa25.52■■□□□ 1.68
TIMM44-202ENST00000595565 PDS5BQ9NTI5 1447 aa25.48■■□□□ 1.67
TIMM44-202ENST00000595565 CFTRP13569 1480 aa25.46■■□□□ 1.67
TIMM44-202ENST00000595565 CCDC88BA6NC98 1476 aa25.34■■□□□ 1.65
TIMM44-202ENST00000595565 PRDM2Q13029 1718 aa25.33■■□□□ 1.65
TIMM44-202ENST00000595565 WDR62O43379 1518 aa25.3■■□□□ 1.64
TIMM44-202ENST00000595565 MRC2Q9UBG0 1479 aa25.29■■□□□ 1.64
TIMM44-202ENST00000595565 FANCD2Q9BXW9 1451 aa25.28■■□□□ 1.64
TIMM44-202ENST00000595565 CEP164Q9UPV0 1460 aa25.28■■□□□ 1.64
TIMM44-202ENST00000595565 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.61
TIMM44-202ENST00000595565 TOPBP1Q92547 1522 aa24.89■■□□□ 1.57
TIMM44-202ENST00000595565 DNMBPQ6XZF7 1577 aa24.88■■□□□ 1.57
TIMM44-202ENST00000595565 ABCC8Q09428 1581 aa24.86■■□□□ 1.57
TIMM44-202ENST00000595565 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP24.81■■□□□ 1.56
TIMM44-202ENST00000595565 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa24.81■■□□□ 1.56
TIMM44-202ENST00000595565 IFT140Q96RY7 1462 aa24.76■■□□□ 1.55
TIMM44-202ENST00000595565 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP24.7■■□□□ 1.54
TIMM44-202ENST00000595565 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP24.68■■□□□ 1.54
TIMM44-202ENST00000595565 CUX1P39880 1505 aa24.66■■□□□ 1.54
TIMM44-202ENST00000595565 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP24.65■■□□□ 1.54
TIMM44-202ENST00000595565 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP24.63■■□□□ 1.53
TIMM44-202ENST00000595565 FGD5Q6ZNL6 1462 aa24.57■■□□□ 1.52
TIMM44-202ENST00000595565 WDR97A6NE52 1622 aa24.55■■□□□ 1.52
TIMM44-202ENST00000595565 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa24.49■■□□□ 1.51
TIMM44-202ENST00000595565 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa24.47■■□□□ 1.51
TIMM44-202ENST00000595565 SOGA1O94964 1423 aa24.45■■□□□ 1.51
TIMM44-202ENST00000595565 TOP2BQ02880 1626 aa24.44■■□□□ 1.5
TIMM44-202ENST00000595565 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP24.42■■□□□ 1.53e-8■■■■□ 19.4
TIMM44-202ENST00000595565 SYNJ1O43426 1573 aa24.41■■□□□ 1.5
TIMM44-202ENST00000595565 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP24.38■■□□□ 1.49
TIMM44-202ENST00000595565 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa24.37■■□□□ 1.49
TIMM44-202ENST00000595565 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa24.35■■□□□ 1.49
TIMM44-202ENST00000595565 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP24.31■■□□□ 1.48
TIMM44-202ENST00000595565 CHD1O14646 1710 aa24.3■■□□□ 1.48
TIMM44-202ENST00000595565 PBRM1Q86U86 1689 aa24.28■■□□□ 1.48
TIMM44-202ENST00000595565 GRIN2BQ13224 1484 aa24.27■■□□□ 1.48
TIMM44-202ENST00000595565 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP24.27■■□□□ 1.48
TIMM44-202ENST00000595565 OSCARQ8IYS5 282 aa24.26■■□□□ 1.47
TIMM44-202ENST00000595565 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa24.26■■□□□ 1.47
TIMM44-202ENST00000595565 GAPVD1Q14C86 1478 aa24.23■■□□□ 1.47
TIMM44-202ENST00000595565 SYNJ2O15056 1496 aa24.16■■□□□ 1.46
TIMM44-202ENST00000595565 ADAMTS12P58397 1594 aa24.11■■□□□ 1.45
TIMM44-202ENST00000595565 CLASP1Q7Z460 1538 aa24.1■■□□□ 1.45
TIMM44-202ENST00000595565 ERICH3Q5RHP9 1530 aa24.09■■□□□ 1.45
TIMM44-202ENST00000595565 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa24.08■■□□□ 1.45
TIMM44-202ENST00000595565 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa24.08■■□□□ 1.45
TIMM44-202ENST00000595565 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa24.08■■□□□ 1.45
TIMM44-202ENST00000595565 ARHGEF11O15085 1522 aa24.06■■□□□ 1.44
TIMM44-202ENST00000595565 GRIN2AQ12879 1464 aa23.99■■□□□ 1.43
TIMM44-202ENST00000595565 FHAD1B1AJZ9 1412 aa23.95■■□□□ 1.42
TIMM44-202ENST00000595565 FBLN2P98095 1184 aa23.95■■□□□ 1.42
TIMM44-202ENST00000595565 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP23.94■■□□□ 1.42
TIMM44-202ENST00000595565 NUP160Q12769 1436 aa23.93■■□□□ 1.42
TIMM44-202ENST00000595565 CEP170Q5SW79 1584 aa23.91■■□□□ 1.42
TIMM44-202ENST00000595565 ARAP1Q96P48 1450 aa23.87■■□□□ 1.41
TIMM44-202ENST00000595565 KIF27Q86VH2 1401 aa23.85■■□□□ 1.41
TIMM44-202ENST00000595565 CUL7Q14999 1698 aa23.85■■□□□ 1.41
TIMM44-202ENST00000595565 SHROOM2Q13796 1616 aa23.83■■□□□ 1.41
TIMM44-202ENST00000595565 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa23.79■■□□□ 1.4
TIMM44-202ENST00000595565 IGF1RP08069 1367 aa23.78■■□□□ 1.4
TIMM44-202ENST00000595565 TRIM41Q8WV44 630 aa23.76■■□□□ 1.39
TIMM44-202ENST00000595565 ERCC6L2Q5T890 1561 aa23.68■■□□□ 1.38
TIMM44-202ENST00000595565 CYB5RLQ6IPT4 315 aa23.6■■□□□ 1.37
TIMM44-202ENST00000595565 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19 ms