RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592373.1

MED16-208, Transcript of mediator complex subunit 16, humanhuman

TSL 3

Gene MED16, Length 927 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED16-208ENST00000592373 NISCHQ9Y2I1 1504 aa43.83■■■■■ 4.61
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MED16-208ENST00000592373 NACADO15069 1562 aa36.6■■■■□ 3.45
MED16-208ENST00000592373 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa36.57■■■■□ 3.45
MED16-208ENST00000592373 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP36.53■■■■□ 3.44
MED16-208ENST00000592373 MYO15BQ96JP2 1530 aa36.49■■■■□ 3.43
MED16-208ENST00000592373 DCAF8L2P0C7V8 631 aa36.49■■■■□ 3.43
MED16-208ENST00000592373 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa36.36■■■■□ 3.41
MED16-208ENST00000592373 UNC13AQ9UPW8 1703 aa35.69■■■■□ 3.3
MED16-208ENST00000592373 SCRIBQ14160 1630 aa35.41■■■■□ 3.26
MED16-208ENST00000592373 BICRAQ9NZM4 1560 aa35.41■■■■□ 3.26
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MED16-208ENST00000592373 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa35.18■■■■□ 3.22
MED16-208ENST00000592373 DNAJC5BQ9UF47 199 aa34.6■■■■□ 3.13
MED16-208ENST00000592373 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP34.47■■■■□ 3.11
MED16-208ENST00000592373 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa34.28■■■■□ 3.08
MED16-208ENST00000592373 CECR2Q9BXF3 1484 aa34.07■■■■□ 3.04
MED16-208ENST00000592373 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP33.98■■■■□ 3.03
MED16-208ENST00000592373 SMARCA4P51532 1647 aa33.97■■■■□ 3.03
MED16-208ENST00000592373 SMARCA2P51531 1590 aa33.77■■■■□ 3
MED16-208ENST00000592373 NCAPD3P42695 1498 aa33.76■■■■□ 3
MED16-208ENST00000592373 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa33.76■■■□□ 2.99
MED16-208ENST00000592373 MROH2BQ7Z745 1585 aa33.74■■■□□ 2.99
MED16-208ENST00000592373 PEG3Q9GZU2 1588 aa33.69■■■□□ 2.98
MED16-208ENST00000592373 HMGXB3Q12766 1538 aa33.59■■■□□ 2.97
MED16-208ENST00000592373 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP33.48■■■□□ 2.95
MED16-208ENST00000592373 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP33.45■■■□□ 2.94
MED16-208ENST00000592373 WIZO95785 1651 aa33.37■■■□□ 2.93
MED16-208ENST00000592373 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP33.07■■■□□ 2.88
MED16-208ENST00000592373 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa32.84■■■□□ 2.85
MED16-208ENST00000592373 NESP48681 1621 aa32.77■■■□□ 2.84
MED16-208ENST00000592373 CADPSQ9ULU8 1353 aa32.77■■■□□ 2.84
MED16-208ENST00000592373 CCDC88BA6NC98 1476 aa32.67■■■□□ 2.82
MED16-208ENST00000592373 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP32.64■■■□□ 2.82
MED16-208ENST00000592373 ERCC6Q03468 1493 aa32.63■■■□□ 2.81
MED16-208ENST00000592373 PDS5BQ9NTI5 1447 aa32.61■■■□□ 2.81
MED16-208ENST00000592373 CFTRP13569 1480 aa32.61■■■□□ 2.81
MED16-208ENST00000592373 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa32.43■■■□□ 2.78
MED16-208ENST00000592373 PRDM2Q13029 1718 aa32.37■■■□□ 2.77
MED16-208ENST00000592373 FANCD2Q9BXW9 1451 aa32.35■■■□□ 2.77
MED16-208ENST00000592373 CUX2O14529 1486 aa32.31■■■□□ 2.76
MED16-208ENST00000592373 CEP164Q9UPV0 1460 aa32.3■■■□□ 2.76
MED16-208ENST00000592373 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP32.29■■■□□ 2.76
MED16-208ENST00000592373 MRC2Q9UBG0 1479 aa32.23■■■□□ 2.75
MED16-208ENST00000592373 WDR62O43379 1518 aa32.12■■■□□ 2.73
MED16-208ENST00000592373 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP32■■■□□ 2.71
MED16-208ENST00000592373 ABCC8Q09428 1581 aa31.97■■■□□ 2.71
MED16-208ENST00000592373 TOPBP1Q92547 1522 aa31.85■■■□□ 2.69
MED16-208ENST00000592373 DNMBPQ6XZF7 1577 aa31.84■■■□□ 2.69
MED16-208ENST00000592373 IFT140Q96RY7 1462 aa31.65■■■□□ 2.66
MED16-208ENST00000592373 CUX1P39880 1505 aa31.65■■■□□ 2.66
MED16-208ENST00000592373 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP31.59■■■□□ 2.65
MED16-208ENST00000592373 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP31.53■■■□□ 2.64
MED16-208ENST00000592373 FGD5Q6ZNL6 1462 aa31.52■■■□□ 2.64
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MED16-208ENST00000592373 SOGA1O94964 1423 aa31.49■■■□□ 2.63
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MED16-208ENST00000592373 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa31.46■■■□□ 2.63
MED16-208ENST00000592373 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa31.4■■■□□ 2.62
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MED16-208ENST00000592373 SYNJ1O43426 1573 aa31.39■■■□□ 2.61
MED16-208ENST00000592373 WDR97A6NE52 1622 aa31.35■■■□□ 2.61
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MED16-208ENST00000592373 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP31.27■■■□□ 2.62e-6■■■■□ 25.8
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MED16-208ENST00000592373 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa31.24■■■□□ 2.59
MED16-208ENST00000592373 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP31.24■■■□□ 2.59
MED16-208ENST00000592373 GAPVD1Q14C86 1478 aa31.12■■■□□ 2.57
MED16-208ENST00000592373 GRIN2BQ13224 1484 aa31.11■■■□□ 2.57
MED16-208ENST00000592373 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa31.1■■■□□ 2.57
MED16-208ENST00000592373 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP31.02■■■□□ 2.56
MED16-208ENST00000592373 OSCARQ8IYS5 282 aa31.02■■■□□ 2.56
MED16-208ENST00000592373 PBRM1Q86U86 1689 aa31.01■■■□□ 2.55
MED16-208ENST00000592373 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa30.98■■■□□ 2.55
MED16-208ENST00000592373 ERICH3Q5RHP9 1530 aa30.92■■■□□ 2.54
MED16-208ENST00000592373 TRIM41Q8WV44 630 aa30.9■■■□□ 2.54
MED16-208ENST00000592373 CHD1O14646 1710 aa30.89■■■□□ 2.54
MED16-208ENST00000592373 KIF27Q86VH2 1401 aa30.89■■■□□ 2.53
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MED16-208ENST00000592373 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP30.86■■■□□ 2.53
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MED16-208ENST00000592373 CHIC1Q5VXU3 224 aa30.6■■■□□ 2.49
MED16-208ENST00000592373 CLASP1Q7Z460 1538 aa30.58■■■□□ 2.49
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MED16-208ENST00000592373 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa30.55■■■□□ 2.48
MED16-208ENST00000592373 CEP170Q5SW79 1584 aa30.49■■■□□ 2.47
MED16-208ENST00000592373 EEA1Q15075 1411 aa30.44■■■□□ 2.46
MED16-208ENST00000592373 ARHGEF11O15085 1522 aa30.43■■■□□ 2.46
MED16-208ENST00000592373 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa30.41■■■□□ 2.46
MED16-208ENST00000592373 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa30.41■■■□□ 2.46
MED16-208ENST00000592373 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa30.41■■■□□ 2.46
MED16-208ENST00000592373 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa30.39■■■□□ 2.46
MED16-208ENST00000592373 CSRNP3Q8WYN3 585 aa30.35■■■□□ 2.45
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