RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590689.1

ANKS3-216, Transcript of ankyrin repeat and sterile alpha motif domain containing 3, humanhuman

TSL 2

Gene ANKS3, Length 834 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKS3-216ENST00000590689 NISCHQ9Y2I1 1504 aa36.66■■■■□ 3.46
ANKS3-216ENST00000590689 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa32.78■■■□□ 2.84
ANKS3-216ENST00000590689 ABCC9O60706 1549 aa32.55■■■□□ 2.8
ANKS3-216ENST00000590689 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa31.06■■■□□ 2.56
ANKS3-216ENST00000590689 NACADO15069 1562 aa30.91■■■□□ 2.54
ANKS3-216ENST00000590689 DCAF8L2P0C7V8 631 aa30.75■■■□□ 2.51
ANKS3-216ENST00000590689 MYO15BQ96JP2 1530 aa30.57■■■□□ 2.48
ANKS3-216ENST00000590689 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP30.48■■■□□ 2.47
ANKS3-216ENST00000590689 UNC13AQ9UPW8 1703 aa30.36■■■□□ 2.45
ANKS3-216ENST00000590689 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP30.31■■■□□ 2.44
ANKS3-216ENST00000590689 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa30.29■■■□□ 2.44
ANKS3-216ENST00000590689 DNAJC5BQ9UF47 199 aa30.27■■■□□ 2.44
ANKS3-216ENST00000590689 BICRAQ9NZM4 1560 aa30.2■■■□□ 2.42
ANKS3-216ENST00000590689 SCRIBQ14160 1630 aa29.93■■■□□ 2.38
ANKS3-216ENST00000590689 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa29.78■■■□□ 2.36
ANKS3-216ENST00000590689 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP29.42■■■□□ 2.3
ANKS3-216ENST00000590689 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa29.4■■■□□ 2.3
ANKS3-216ENST00000590689 CECR2Q9BXF3 1484 aa29.28■■■□□ 2.28
ANKS3-216ENST00000590689 SMARCA4P51532 1647 aa28.56■■■□□ 2.16
ANKS3-216ENST00000590689 NCAPD3P42695 1498 aa28.53■■■□□ 2.16
ANKS3-216ENST00000590689 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa28.51■■■□□ 2.15
ANKS3-216ENST00000590689 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP28.43■■■□□ 2.14
ANKS3-216ENST00000590689 SMARCA2P51531 1590 aa28.42■■■□□ 2.14
ANKS3-216ENST00000590689 HMGXB3Q12766 1538 aa28.38■■■□□ 2.13
ANKS3-216ENST00000590689 MROH2BQ7Z745 1585 aa28.28■■■□□ 2.12
ANKS3-216ENST00000590689 PEG3Q9GZU2 1588 aa28.27■■■□□ 2.12
ANKS3-216ENST00000590689 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP28.25■■■□□ 2.11
ANKS3-216ENST00000590689 ERCC6Q03468 1493 aa28.06■■■□□ 2.08
ANKS3-216ENST00000590689 NESP48681 1621 aa28.04■■■□□ 2.08
ANKS3-216ENST00000590689 WIZO95785 1651 aa27.94■■■□□ 2.06
ANKS3-216ENST00000590689 CUX2O14529 1486 aa27.91■■■□□ 2.06
ANKS3-216ENST00000590689 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa27.86■■■□□ 2.05
ANKS3-216ENST00000590689 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP27.77■■■□□ 2.04
ANKS3-216ENST00000590689 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP27.72■■■□□ 2.03
ANKS3-216ENST00000590689 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa27.68■■■□□ 2.02
ANKS3-216ENST00000590689 CADPSQ9ULU8 1353 aa27.67■■■□□ 2.02
ANKS3-216ENST00000590689 PDS5BQ9NTI5 1447 aa27.67■■■□□ 2.02
ANKS3-216ENST00000590689 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP27.62■■■□□ 2.01
ANKS3-216ENST00000590689 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa27.55■■■□□ 2
ANKS3-216ENST00000590689 MRC2Q9UBG0 1479 aa27.45■■□□□ 1.99
ANKS3-216ENST00000590689 CFTRP13569 1480 aa27.44■■□□□ 1.98
ANKS3-216ENST00000590689 CEP164Q9UPV0 1460 aa27.39■■□□□ 1.98
ANKS3-216ENST00000590689 WDR62O43379 1518 aa27.39■■□□□ 1.98
ANKS3-216ENST00000590689 FANCD2Q9BXW9 1451 aa27.38■■□□□ 1.97
ANKS3-216ENST00000590689 CCDC88BA6NC98 1476 aa27.27■■□□□ 1.96
ANKS3-216ENST00000590689 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP27.16■■□□□ 1.94
ANKS3-216ENST00000590689 PRDM2Q13029 1718 aa27.16■■□□□ 1.94
ANKS3-216ENST00000590689 TOPBP1Q92547 1522 aa26.9■■□□□ 1.9
ANKS3-216ENST00000590689 DNMBPQ6XZF7 1577 aa26.83■■□□□ 1.89
ANKS3-216ENST00000590689 IFT140Q96RY7 1462 aa26.82■■□□□ 1.88
ANKS3-216ENST00000590689 ABCC8Q09428 1581 aa26.8■■□□□ 1.88
ANKS3-216ENST00000590689 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP26.79■■□□□ 1.88
ANKS3-216ENST00000590689 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP26.7■■□□□ 1.86
ANKS3-216ENST00000590689 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP26.67■■□□□ 1.86
ANKS3-216ENST00000590689 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP26.66■■□□□ 1.86
ANKS3-216ENST00000590689 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP26.65■■□□□ 1.86
ANKS3-216ENST00000590689 OSCARQ8IYS5 282 aa26.61■■□□□ 1.85
ANKS3-216ENST00000590689 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP26.55■■□□□ 1.84
ANKS3-216ENST00000590689 CUX1P39880 1505 aa26.55■■□□□ 1.84
ANKS3-216ENST00000590689 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa26.55■■□□□ 1.84
ANKS3-216ENST00000590689 FGD5Q6ZNL6 1462 aa26.53■■□□□ 1.84
ANKS3-216ENST00000590689 SOGA1O94964 1423 aa26.49■■□□□ 1.83
ANKS3-216ENST00000590689 TRIM41Q8WV44 630 aa26.48■■□□□ 1.83
ANKS3-216ENST00000590689 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP26.43■■□□□ 1.82
ANKS3-216ENST00000590689 CHD1O14646 1710 aa26.38■■□□□ 1.81
ANKS3-216ENST00000590689 WDR97A6NE52 1622 aa26.36■■□□□ 1.81
ANKS3-216ENST00000590689 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa26.32■■□□□ 1.8
ANKS3-216ENST00000590689 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa26.32■■□□□ 1.8
ANKS3-216ENST00000590689 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa26.32■■□□□ 1.8
ANKS3-216ENST00000590689 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa26.31■■□□□ 1.8
ANKS3-216ENST00000590689 ARHGEF11O15085 1522 aa26.29■■□□□ 1.8
ANKS3-216ENST00000590689 FBLN2P98095 1184 aa26.28■■□□□ 1.8
ANKS3-216ENST00000590689 GRIN2BQ13224 1484 aa26.25■■□□□ 1.79
ANKS3-216ENST00000590689 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP26.23■■□□□ 1.79
ANKS3-216ENST00000590689 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa26.22■■□□□ 1.79
ANKS3-216ENST00000590689 GAPVD1Q14C86 1478 aa26.19■■□□□ 1.78
ANKS3-216ENST00000590689 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa26.19■■□□□ 1.78
ANKS3-216ENST00000590689 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP26.19■■□□□ 1.78
ANKS3-216ENST00000590689 SYNJ1O43426 1573 aa26.19■■□□□ 1.78
ANKS3-216ENST00000590689 TOP2BQ02880 1626 aa26.18■■□□□ 1.78
ANKS3-216ENST00000590689 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa26.18■■□□□ 1.78
ANKS3-216ENST00000590689 PBRM1Q86U86 1689 aa26.18■■□□□ 1.78
ANKS3-216ENST00000590689 SYNJ2O15056 1496 aa26.14■■□□□ 1.78
ANKS3-216ENST00000590689 CLASP1Q7Z460 1538 aa26.12■■□□□ 1.77
ANKS3-216ENST00000590689 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP26.11■■□□□ 1.77
ANKS3-216ENST00000590689 ARAP1Q96P48 1450 aa26.05■■□□□ 1.76
ANKS3-216ENST00000590689 CYB5RLQ6IPT4 315 aa26■■□□□ 1.75
ANKS3-216ENST00000590689 ADAMTS12P58397 1594 aa25.99■■□□□ 1.75
ANKS3-216ENST00000590689 GRIN2AQ12879 1464 aa25.94■■□□□ 1.74
ANKS3-216ENST00000590689 ERICH3Q5RHP9 1530 aa25.89■■□□□ 1.74
ANKS3-216ENST00000590689 FHAD1B1AJZ9 1412 aa25.87■■□□□ 1.73
ANKS3-216ENST00000590689 CEP170Q5SW79 1584 aa25.85■■□□□ 1.73
ANKS3-216ENST00000590689 NUP160Q12769 1436 aa25.84■■□□□ 1.73
ANKS3-216ENST00000590689 ERCC6L2Q5T890 1561 aa25.74■■□□□ 1.71
ANKS3-216ENST00000590689 SHROOM2Q13796 1616 aa25.7■■□□□ 1.7
ANKS3-216ENST00000590689 KIF27Q86VH2 1401 aa25.65■■□□□ 1.7
ANKS3-216ENST00000590689 TRHP20396 242 aaPredicted RBP25.62■■□□□ 1.69
ANKS3-216ENST00000590689 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa25.62■■□□□ 1.69
ANKS3-216ENST00000590689 IGF1RP08069 1367 aa25.61■■□□□ 1.69
ANKS3-216ENST00000590689 CUL7Q14999 1698 aa25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 130.8 ms