RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590110.2

DUS3L-208, Transcript of dihydrouridine synthase 3 like, humanhuman

TSL 2

Gene DUS3L, Length 977 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUS3L-208ENST00000590110 NISCHQ9Y2I1 1504 aa41.34■■■■■ 4.21
DUS3L-208ENST00000590110 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa36.35■■■■□ 3.41
DUS3L-208ENST00000590110 ABCC9O60706 1549 aa35.02■■■■□ 3.2
DUS3L-208ENST00000590110 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP34.55■■■■□ 3.12
DUS3L-208ENST00000590110 DCAF8L2P0C7V8 631 aa34.45■■■■□ 3.11
DUS3L-208ENST00000590110 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa34.2■■■■□ 3.06
DUS3L-208ENST00000590110 NACADO15069 1562 aa34.08■■■■□ 3.05
DUS3L-208ENST00000590110 MYO15BQ96JP2 1530 aa34.07■■■■□ 3.04
DUS3L-208ENST00000590110 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa33.95■■■■□ 3.03
DUS3L-208ENST00000590110 SCRIBQ14160 1630 aa33.3■■■□□ 2.92
DUS3L-208ENST00000590110 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa33.2■■■□□ 2.91
DUS3L-208ENST00000590110 UNC13AQ9UPW8 1703 aa33.08■■■□□ 2.89
DUS3L-208ENST00000590110 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP32.92■■■□□ 2.86
DUS3L-208ENST00000590110 BICRAQ9NZM4 1560 aa32.86■■■□□ 2.85
DUS3L-208ENST00000590110 CECR2Q9BXF3 1484 aa32.14■■■□□ 2.74
DUS3L-208ENST00000590110 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP31.98■■■□□ 2.71
DUS3L-208ENST00000590110 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP31.95■■■□□ 2.71
DUS3L-208ENST00000590110 SMARCA4P51532 1647 aa31.89■■■□□ 2.7
DUS3L-208ENST00000590110 MROH2BQ7Z745 1585 aa31.87■■■□□ 2.69
DUS3L-208ENST00000590110 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP31.8■■■□□ 2.68
DUS3L-208ENST00000590110 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP31.66■■■□□ 2.66
DUS3L-208ENST00000590110 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa31.65■■■□□ 2.66
DUS3L-208ENST00000590110 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa31.59■■■□□ 2.65
DUS3L-208ENST00000590110 SMARCA2P51531 1590 aa31.57■■■□□ 2.64
DUS3L-208ENST00000590110 WIZO95785 1651 aa31.54■■■□□ 2.64
DUS3L-208ENST00000590110 PEG3Q9GZU2 1588 aa31.54■■■□□ 2.64
DUS3L-208ENST00000590110 DNAJC5BQ9UF47 199 aa31.53■■■□□ 2.64
DUS3L-208ENST00000590110 NCAPD3P42695 1498 aa31.46■■■□□ 2.63
DUS3L-208ENST00000590110 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP31.38■■■□□ 2.61
DUS3L-208ENST00000590110 HMGXB3Q12766 1538 aa31.32■■■□□ 2.6
DUS3L-208ENST00000590110 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP31.26■■■□□ 2.59
DUS3L-208ENST00000590110 CCDC88BA6NC98 1476 aa30.94■■■□□ 2.54
DUS3L-208ENST00000590110 CADPSQ9ULU8 1353 aa30.62■■■□□ 2.49
DUS3L-208ENST00000590110 CFTRP13569 1480 aa30.54■■■□□ 2.48
DUS3L-208ENST00000590110 NESP48681 1621 aa30.49■■■□□ 2.47
DUS3L-208ENST00000590110 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa30.48■■■□□ 2.47
DUS3L-208ENST00000590110 PDS5BQ9NTI5 1447 aa30.33■■■□□ 2.45
DUS3L-208ENST00000590110 PRDM2Q13029 1718 aa30.26■■■□□ 2.43
DUS3L-208ENST00000590110 FANCD2Q9BXW9 1451 aa30.25■■■□□ 2.43
DUS3L-208ENST00000590110 ERCC6Q03468 1493 aa30.15■■■□□ 2.42
DUS3L-208ENST00000590110 CEP164Q9UPV0 1460 aa30.13■■■□□ 2.41
DUS3L-208ENST00000590110 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa30.08■■■□□ 2.41
DUS3L-208ENST00000590110 ABCC8Q09428 1581 aa29.99■■■□□ 2.39
DUS3L-208ENST00000590110 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP29.96■■■□□ 2.39
DUS3L-208ENST00000590110 MRC2Q9UBG0 1479 aa29.94■■■□□ 2.38
DUS3L-208ENST00000590110 CHIC1Q5VXU3 224 aa29.93■■■□□ 2.38
DUS3L-208ENST00000590110 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP29.88■■■□□ 2.37
DUS3L-208ENST00000590110 TRIM41Q8WV44 630 aa29.86■■■□□ 2.37
DUS3L-208ENST00000590110 CUX1P39880 1505 aa29.86■■■□□ 2.37
DUS3L-208ENST00000590110 DNMBPQ6XZF7 1577 aa29.83■■■□□ 2.37
DUS3L-208ENST00000590110 TOPBP1Q92547 1522 aa29.83■■■□□ 2.37
DUS3L-208ENST00000590110 SYNJ1O43426 1573 aa29.8■■■□□ 2.36
DUS3L-208ENST00000590110 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP29.8■■■□□ 2.36
DUS3L-208ENST00000590110 TOP2BQ02880 1626 aa29.77■■■□□ 2.36
DUS3L-208ENST00000590110 WDR62O43379 1518 aa29.76■■■□□ 2.36
DUS3L-208ENST00000590110 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa29.73■■■□□ 2.35
DUS3L-208ENST00000590110 FGD5Q6ZNL6 1462 aa29.66■■■□□ 2.34
DUS3L-208ENST00000590110 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP29.61■■■□□ 2.33
DUS3L-208ENST00000590110 SOGA1O94964 1423 aa29.57■■■□□ 2.32
DUS3L-208ENST00000590110 CUX2O14529 1486 aa29.52■■■□□ 2.32
DUS3L-208ENST00000590110 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa29.52■■■□□ 2.32
DUS3L-208ENST00000590110 IFT140Q96RY7 1462 aa29.48■■■□□ 2.31
DUS3L-208ENST00000590110 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP29.4■■■□□ 2.3
DUS3L-208ENST00000590110 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa29.4■■■□□ 2.3
DUS3L-208ENST00000590110 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP29.33■■■□□ 2.29
DUS3L-208ENST00000590110 KIF27Q86VH2 1401 aa29.31■■■□□ 2.28
DUS3L-208ENST00000590110 WDR97A6NE52 1622 aa29.27■■■□□ 2.28
DUS3L-208ENST00000590110 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP29.27■■■□□ 2.28
DUS3L-208ENST00000590110 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP29.25■■■□□ 2.27
DUS3L-208ENST00000590110 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP29.24■■■□□ 2.279e-7■■■■□ 21.8
DUS3L-208ENST00000590110 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa29.24■■■□□ 2.27
DUS3L-208ENST00000590110 GAPVD1Q14C86 1478 aa29.22■■■□□ 2.27
DUS3L-208ENST00000590110 EEA1Q15075 1411 aa29.21■■■□□ 2.27
DUS3L-208ENST00000590110 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa29.21■■■□□ 2.27
DUS3L-208ENST00000590110 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa29.16■■■□□ 2.26
DUS3L-208ENST00000590110 CSRNP3Q8WYN3 585 aa29.14■■■□□ 2.26
DUS3L-208ENST00000590110 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP29.13■■■□□ 2.25
DUS3L-208ENST00000590110 GRIN2BQ13224 1484 aa29.11■■■□□ 2.25
DUS3L-208ENST00000590110 IGF1RP08069 1367 aa29.11■■■□□ 2.25
DUS3L-208ENST00000590110 ERICH3Q5RHP9 1530 aa29.04■■■□□ 2.24
DUS3L-208ENST00000590110 PBRM1Q86U86 1689 aa29.01■■■□□ 2.23
DUS3L-208ENST00000590110 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa28.97■■■□□ 2.23
DUS3L-208ENST00000590110 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa28.96■■■□□ 2.23
DUS3L-208ENST00000590110 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP28.93■■■□□ 2.22
DUS3L-208ENST00000590110 FHAD1B1AJZ9 1412 aa28.9■■■□□ 2.22
DUS3L-208ENST00000590110 CUL7Q14999 1698 aa28.89■■■□□ 2.22
DUS3L-208ENST00000590110 PRXQ9BXM0 1461 aa28.88■■■□□ 2.21
DUS3L-208ENST00000590110 FBLN2P98095 1184 aa28.85■■■□□ 2.21
DUS3L-208ENST00000590110 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP28.85■■■□□ 2.21
DUS3L-208ENST00000590110 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa28.85■■■□□ 2.21
DUS3L-208ENST00000590110 ADAMTS12P58397 1594 aa28.84■■■□□ 2.21
DUS3L-208ENST00000590110 EHMT2Q96KQ7 1210 aa28.83■■■□□ 2.21
DUS3L-208ENST00000590110 SYNJ2O15056 1496 aa28.82■■■□□ 2.2
DUS3L-208ENST00000590110 KIF21BO75037 1637 aa28.79■■■□□ 2.2
DUS3L-208ENST00000590110 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa28.74■■■□□ 2.19
DUS3L-208ENST00000590110 GOLGA3Q08378 1498 aa28.73■■■□□ 2.19
DUS3L-208ENST00000590110 GRIN2AQ12879 1464 aa28.72■■■□□ 2.19
DUS3L-208ENST00000590110 UBTFP17480 764 aaKnown RBP28.71■■■□□ 2.19
DUS3L-208ENST00000590110 CHD1O14646 1710 aa28.62■■■□□ 2.17
DUS3L-208ENST00000590110 NUP160Q12769 1436 aa28.54■■■□□ 2.16
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