RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589548.5

CXXC1-211, Transcript of CXXC finger protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene CXXC1, Length 849 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXXC1-211ENST00000589548 NISCHQ9Y2I1 1504 aa45.85■■■■■ 4.93
CXXC1-211ENST00000589548 ABCC9O60706 1549 aa41.71■■■■■ 4.27
CXXC1-211ENST00000589548 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa41.38■■■■■ 4.21
CXXC1-211ENST00000589548 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa39.51■■■■□ 3.92
CXXC1-211ENST00000589548 DNAJC5BQ9UF47 199 aa39.49■■■■□ 3.91
CXXC1-211ENST00000589548 NACADO15069 1562 aa39.14■■■■□ 3.86
CXXC1-211ENST00000589548 UNC13AQ9UPW8 1703 aa38.8■■■■□ 3.8
CXXC1-211ENST00000589548 DCAF8L2P0C7V8 631 aa38.72■■■■□ 3.79
CXXC1-211ENST00000589548 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP38.71■■■■□ 3.79
CXXC1-211ENST00000589548 BICRAQ9NZM4 1560 aa38.48■■■■□ 3.75
CXXC1-211ENST00000589548 MYO15BQ96JP2 1530 aa38.47■■■■□ 3.75
CXXC1-211ENST00000589548 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP37.94■■■■□ 3.66
CXXC1-211ENST00000589548 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa37.84■■■■□ 3.65
CXXC1-211ENST00000589548 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa37.8■■■■□ 3.64
CXXC1-211ENST00000589548 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa37.71■■■■□ 3.63
CXXC1-211ENST00000589548 SCRIBQ14160 1630 aa37.67■■■■□ 3.62
CXXC1-211ENST00000589548 CECR2Q9BXF3 1484 aa37.59■■■■□ 3.61
CXXC1-211ENST00000589548 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP37.51■■■■□ 3.6
CXXC1-211ENST00000589548 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa36.63■■■■□ 3.45
CXXC1-211ENST00000589548 NCAPD3P42695 1498 aa36.12■■■■□ 3.37
CXXC1-211ENST00000589548 CUX2O14529 1486 aa36.09■■■■□ 3.37
CXXC1-211ENST00000589548 ERCC6Q03468 1493 aa35.99■■■■□ 3.35
CXXC1-211ENST00000589548 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa35.99■■■■□ 3.35
CXXC1-211ENST00000589548 SMARCA4P51532 1647 aa35.9■■■■□ 3.34
CXXC1-211ENST00000589548 HMGXB3Q12766 1538 aa35.87■■■■□ 3.33
CXXC1-211ENST00000589548 SMARCA2P51531 1590 aa35.85■■■■□ 3.33
CXXC1-211ENST00000589548 NESP48681 1621 aa35.75■■■■□ 3.31
CXXC1-211ENST00000589548 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP35.59■■■■□ 3.29
CXXC1-211ENST00000589548 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP35.59■■■■□ 3.29
CXXC1-211ENST00000589548 PEG3Q9GZU2 1588 aa35.54■■■■□ 3.28
CXXC1-211ENST00000589548 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP35.53■■■■□ 3.28
CXXC1-211ENST00000589548 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa35.4■■■■□ 3.26
CXXC1-211ENST00000589548 MROH2BQ7Z745 1585 aa35.35■■■■□ 3.25
CXXC1-211ENST00000589548 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa35.35■■■■□ 3.25
CXXC1-211ENST00000589548 PDS5BQ9NTI5 1447 aa35.13■■■■□ 3.21
CXXC1-211ENST00000589548 CADPSQ9ULU8 1353 aa34.98■■■■□ 3.19
CXXC1-211ENST00000589548 WIZO95785 1651 aa34.95■■■■□ 3.18
CXXC1-211ENST00000589548 MRC2Q9UBG0 1479 aa34.92■■■■□ 3.18
CXXC1-211ENST00000589548 WDR62O43379 1518 aa34.89■■■■□ 3.18
CXXC1-211ENST00000589548 TRIM41Q8WV44 630 aa34.73■■■■□ 3.15
CXXC1-211ENST00000589548 CEP164Q9UPV0 1460 aa34.69■■■■□ 3.14
CXXC1-211ENST00000589548 FANCD2Q9BXW9 1451 aa34.62■■■■□ 3.13
CXXC1-211ENST00000589548 CFTRP13569 1480 aa34.53■■■■□ 3.12
CXXC1-211ENST00000589548 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP34.43■■■■□ 3.1
CXXC1-211ENST00000589548 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP34.42■■■■□ 3.1
CXXC1-211ENST00000589548 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP34.41■■■■□ 3.1
CXXC1-211ENST00000589548 PRDM2Q13029 1718 aa34.3■■■■□ 3.08
CXXC1-211ENST00000589548 OSCARQ8IYS5 282 aa34.28■■■■□ 3.08
CXXC1-211ENST00000589548 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP34.05■■■■□ 3.04
CXXC1-211ENST00000589548 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa34.05■■■■□ 3.04
CXXC1-211ENST00000589548 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa34.05■■■■□ 3.04
CXXC1-211ENST00000589548 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa34.05■■■■□ 3.04
CXXC1-211ENST00000589548 CCDC88BA6NC98 1476 aa34.02■■■■□ 3.04
CXXC1-211ENST00000589548 IFT140Q96RY7 1462 aa34■■■■□ 3.03
CXXC1-211ENST00000589548 TOPBP1Q92547 1522 aa33.95■■■■□ 3.03
CXXC1-211ENST00000589548 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP33.88■■■■□ 3.01
CXXC1-211ENST00000589548 ARHGEF11O15085 1522 aa33.87■■■■□ 3.01
CXXC1-211ENST00000589548 DNMBPQ6XZF7 1577 aa33.8■■■■□ 3
CXXC1-211ENST00000589548 ABCC8Q09428 1581 aa33.76■■■□□ 2.99
CXXC1-211ENST00000589548 CHD1O14646 1710 aa33.74■■■□□ 2.99
CXXC1-211ENST00000589548 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP33.73■■■□□ 2.99
CXXC1-211ENST00000589548 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP33.65■■■□□ 2.987e-7■■■■□ 19.8
CXXC1-211ENST00000589548 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP33.57■■■□□ 2.97
CXXC1-211ENST00000589548 CYB5RLQ6IPT4 315 aa33.53■■■□□ 2.96
CXXC1-211ENST00000589548 ARAP1Q96P48 1450 aa33.52■■■□□ 2.96
CXXC1-211ENST00000589548 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa33.46■■■□□ 2.95
CXXC1-211ENST00000589548 FBLN2P98095 1184 aa33.41■■■□□ 2.94
CXXC1-211ENST00000589548 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP33.35■■■□□ 2.93
CXXC1-211ENST00000589548 SOGA1O94964 1423 aa33.35■■■□□ 2.93
CXXC1-211ENST00000589548 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa33.31■■■□□ 2.92
CXXC1-211ENST00000589548 FGD5Q6ZNL6 1462 aa33.31■■■□□ 2.92
CXXC1-211ENST00000589548 CLASP1Q7Z460 1538 aa33.3■■■□□ 2.92
CXXC1-211ENST00000589548 WDR97A6NE52 1622 aa33.29■■■□□ 2.92
CXXC1-211ENST00000589548 TRHP20396 242 aaPredicted RBP33.25■■■□□ 2.91
CXXC1-211ENST00000589548 CUX1P39880 1505 aa33.24■■■□□ 2.91
CXXC1-211ENST00000589548 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP33.18■■■□□ 2.9
CXXC1-211ENST00000589548 SYNJ1O43426 1573 aa33.17■■■□□ 2.9
CXXC1-211ENST00000589548 GRIN2BQ13224 1484 aa33.12■■■□□ 2.89
CXXC1-211ENST00000589548 PBRM1Q86U86 1689 aa33.1■■■□□ 2.89
CXXC1-211ENST00000589548 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP33.08■■■□□ 2.89
CXXC1-211ENST00000589548 SYNJ2O15056 1496 aa33.07■■■□□ 2.88
CXXC1-211ENST00000589548 GAPVD1Q14C86 1478 aa32.96■■■□□ 2.87
CXXC1-211ENST00000589548 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa32.95■■■□□ 2.87
CXXC1-211ENST00000589548 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa32.9■■■□□ 2.86
CXXC1-211ENST00000589548 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP32.79■■■□□ 2.84
CXXC1-211ENST00000589548 ERCC6L2Q5T890 1561 aa32.79■■■□□ 2.84
CXXC1-211ENST00000589548 GRIN2AQ12879 1464 aa32.74■■■□□ 2.83
CXXC1-211ENST00000589548 ADAMTS12P58397 1594 aa32.72■■■□□ 2.83
CXXC1-211ENST00000589548 CEP170Q5SW79 1584 aa32.7■■■□□ 2.82
CXXC1-211ENST00000589548 NUP160Q12769 1436 aa32.64■■■□□ 2.82
CXXC1-211ENST00000589548 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa32.63■■■□□ 2.81
CXXC1-211ENST00000589548 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP32.61■■■□□ 2.81
CXXC1-211ENST00000589548 SHROOM2Q13796 1616 aa32.61■■■□□ 2.81
CXXC1-211ENST00000589548 TOP2BQ02880 1626 aa32.59■■■□□ 2.81
CXXC1-211ENST00000589548 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP32.51■■■□□ 2.79
CXXC1-211ENST00000589548 FHAD1B1AJZ9 1412 aa32.51■■■□□ 2.79
CXXC1-211ENST00000589548 ERICH3Q5RHP9 1530 aa32.46■■■□□ 2.79
CXXC1-211ENST00000589548 KIF13AQ9H1H9 1805 aa32.44■■■□□ 2.78
CXXC1-211ENST00000589548 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP32.32■■■□□ 2.76
CXXC1-211ENST00000589548 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa32.28■■■□□ 2.76
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