RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589536.5

GRN-215, Transcript of granulin precursor, humanhuman

TSL 3

Gene GRN, Length 546 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRN-215ENST00000589536 NISCHQ9Y2I1 1504 aa61.05■■■■■ 7.36
GRN-215ENST00000589536 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa54.65■■■■■ 6.34
GRN-215ENST00000589536 ABCC9O60706 1549 aa54.28■■■■■ 6.28
GRN-215ENST00000589536 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa51.83■■■■■ 5.89
GRN-215ENST00000589536 NACADO15069 1562 aa51.57■■■■■ 5.85
GRN-215ENST00000589536 DCAF8L2P0C7V8 631 aa51.22■■■■■ 5.79
GRN-215ENST00000589536 MYO15BQ96JP2 1530 aa51.02■■■■■ 5.76
GRN-215ENST00000589536 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP50.7■■■■■ 5.71
GRN-215ENST00000589536 UNC13AQ9UPW8 1703 aa50.67■■■■■ 5.7
GRN-215ENST00000589536 DNAJC5BQ9UF47 199 aa50.62■■■■■ 5.69
GRN-215ENST00000589536 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP50.55■■■■■ 5.68
GRN-215ENST00000589536 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa50.48■■■■■ 5.67
GRN-215ENST00000589536 BICRAQ9NZM4 1560 aa50.35■■■■■ 5.65
GRN-215ENST00000589536 SCRIBQ14160 1630 aa49.78■■■■■ 5.56
GRN-215ENST00000589536 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa49.73■■■■■ 5.55
GRN-215ENST00000589536 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa49.08■■■■■ 5.45
GRN-215ENST00000589536 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP49.07■■■■■ 5.45
GRN-215ENST00000589536 CECR2Q9BXF3 1484 aa48.87■■■■■ 5.41
GRN-215ENST00000589536 NCAPD3P42695 1498 aa47.62■■■■■ 5.21
GRN-215ENST00000589536 SMARCA4P51532 1647 aa47.56■■■■■ 5.2
GRN-215ENST00000589536 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa47.52■■■■■ 5.2
GRN-215ENST00000589536 SMARCA2P51531 1590 aa47.39■■■■■ 5.18
GRN-215ENST00000589536 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP47.36■■■■■ 5.17
GRN-215ENST00000589536 HMGXB3Q12766 1538 aa47.31■■■■■ 5.16
GRN-215ENST00000589536 PEG3Q9GZU2 1588 aa47.13■■■■■ 5.14
GRN-215ENST00000589536 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP47.05■■■■■ 5.12
GRN-215ENST00000589536 MROH2BQ7Z745 1585 aa47.04■■■■■ 5.12
GRN-215ENST00000589536 ERCC6Q03468 1493 aa46.82■■■■■ 5.09
GRN-215ENST00000589536 NESP48681 1621 aa46.74■■■■■ 5.07
GRN-215ENST00000589536 CUX2O14529 1486 aa46.68■■■■■ 5.06
GRN-215ENST00000589536 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa46.48■■■■■ 5.03
GRN-215ENST00000589536 WIZO95785 1651 aa46.47■■■■■ 5.03
GRN-215ENST00000589536 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP46.24■■■■■ 4.99
GRN-215ENST00000589536 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa46.23■■■■■ 4.99
GRN-215ENST00000589536 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP46.19■■■■■ 4.98
GRN-215ENST00000589536 PDS5BQ9NTI5 1447 aa46.17■■■■■ 4.98
GRN-215ENST00000589536 CADPSQ9ULU8 1353 aa46.16■■■■■ 4.98
GRN-215ENST00000589536 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa46.14■■■■■ 4.98
GRN-215ENST00000589536 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP45.94■■■■■ 4.95
GRN-215ENST00000589536 MRC2Q9UBG0 1479 aa45.78■■■■■ 4.92
GRN-215ENST00000589536 CFTRP13569 1480 aa45.74■■■■■ 4.91
GRN-215ENST00000589536 WDR62O43379 1518 aa45.69■■■■■ 4.9
GRN-215ENST00000589536 CEP164Q9UPV0 1460 aa45.66■■■■■ 4.9
GRN-215ENST00000589536 FANCD2Q9BXW9 1451 aa45.64■■■■■ 4.9
GRN-215ENST00000589536 CCDC88BA6NC98 1476 aa45.39■■■■■ 4.86
GRN-215ENST00000589536 PRDM2Q13029 1718 aa45.29■■■■■ 4.84
GRN-215ENST00000589536 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP45.26■■■■■ 4.84
GRN-215ENST00000589536 TOPBP1Q92547 1522 aa44.83■■■■■ 4.77
GRN-215ENST00000589536 ABCC8Q09428 1581 aa44.73■■■■■ 4.75
GRN-215ENST00000589536 IFT140Q96RY7 1462 aa44.73■■■■■ 4.75
GRN-215ENST00000589536 DNMBPQ6XZF7 1577 aa44.69■■■■■ 4.75
GRN-215ENST00000589536 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP44.64■■■■■ 4.74
GRN-215ENST00000589536 OSCARQ8IYS5 282 aa44.53■■■■■ 4.72
GRN-215ENST00000589536 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP44.42■■■■■ 4.7
GRN-215ENST00000589536 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP44.42■■■■■ 4.7
GRN-215ENST00000589536 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP44.4■■■■■ 4.7
GRN-215ENST00000589536 TRIM41Q8WV44 630 aa44.28■■■■■ 4.68
GRN-215ENST00000589536 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP44.27■■■■■ 4.68
GRN-215ENST00000589536 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP44.25■■■■■ 4.672e-7■■■■■ 29
GRN-215ENST00000589536 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa44.2■■■■■ 4.67
GRN-215ENST00000589536 CUX1P39880 1505 aa44.19■■■■■ 4.66
GRN-215ENST00000589536 SOGA1O94964 1423 aa44.16■■■■■ 4.66
GRN-215ENST00000589536 FGD5Q6ZNL6 1462 aa44.15■■■■■ 4.66
GRN-215ENST00000589536 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP44.02■■■■■ 4.64
GRN-215ENST00000589536 WDR97A6NE52 1622 aa44■■■■■ 4.63
GRN-215ENST00000589536 CHD1O14646 1710 aa44■■■■■ 4.63
GRN-215ENST00000589536 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa43.97■■■■■ 4.63
GRN-215ENST00000589536 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa43.97■■■■■ 4.63
GRN-215ENST00000589536 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa43.97■■■■■ 4.63
GRN-215ENST00000589536 ARHGEF11O15085 1522 aa43.88■■■■■ 4.61
GRN-215ENST00000589536 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa43.83■■■■■ 4.61
GRN-215ENST00000589536 FBLN2P98095 1184 aa43.81■■■■■ 4.6
GRN-215ENST00000589536 GRIN2BQ13224 1484 aa43.76■■■■■ 4.6
GRN-215ENST00000589536 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP43.75■■■■■ 4.59
GRN-215ENST00000589536 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa43.69■■■■■ 4.59
GRN-215ENST00000589536 GAPVD1Q14C86 1478 aa43.64■■■■■ 4.58
GRN-215ENST00000589536 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa43.61■■■■■ 4.57
GRN-215ENST00000589536 PBRM1Q86U86 1689 aa43.61■■■■■ 4.57
GRN-215ENST00000589536 SYNJ2O15056 1496 aa43.58■■■■■ 4.57
GRN-215ENST00000589536 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP43.57■■■■■ 4.57
GRN-215ENST00000589536 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa43.57■■■■■ 4.57
GRN-215ENST00000589536 TOP2BQ02880 1626 aa43.56■■■■■ 4.56
GRN-215ENST00000589536 CLASP1Q7Z460 1538 aa43.56■■■■■ 4.56
GRN-215ENST00000589536 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP43.55■■■■■ 4.56
GRN-215ENST00000589536 SYNJ1O43426 1573 aa43.52■■■■■ 4.56
GRN-215ENST00000589536 ARAP1Q96P48 1450 aa43.49■■■■■ 4.55
GRN-215ENST00000589536 CYB5RLQ6IPT4 315 aa43.46■■■■■ 4.55
GRN-215ENST00000589536 ADAMTS12P58397 1594 aa43.25■■■■■ 4.51
GRN-215ENST00000589536 GRIN2AQ12879 1464 aa43.21■■■■■ 4.51
GRN-215ENST00000589536 ERICH3Q5RHP9 1530 aa43.14■■■■■ 4.5
GRN-215ENST00000589536 FHAD1B1AJZ9 1412 aa43.11■■■■■ 4.49
GRN-215ENST00000589536 NUP160Q12769 1436 aa43.08■■■■■ 4.49
GRN-215ENST00000589536 CEP170Q5SW79 1584 aa43.05■■■■■ 4.48
GRN-215ENST00000589536 ERCC6L2Q5T890 1561 aa42.88■■■■■ 4.45
GRN-215ENST00000589536 SHROOM2Q13796 1616 aa42.85■■■■■ 4.45
GRN-215ENST00000589536 TRHP20396 242 aaPredicted RBP42.82■■■■■ 4.45
GRN-215ENST00000589536 KIF27Q86VH2 1401 aa42.69■■■■■ 4.42
GRN-215ENST00000589536 IGF1RP08069 1367 aa42.65■■■■■ 4.42
GRN-215ENST00000589536 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa42.64■■■■■ 4.42
GRN-215ENST00000589536 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP42.58■■■■■ 4.41
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