RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587324.1

UBXN6-204, Transcript of UBX domain protein 6, humanhuman

TSL 3

Gene UBXN6, Length 712 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN6-204ENST00000587324 NISCHQ9Y2I1 1504 aa47.93■■■■■ 5.26
UBXN6-204ENST00000587324 ABCC9O60706 1549 aa43.48■■■■■ 4.55
UBXN6-204ENST00000587324 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa43.21■■■■■ 4.51
UBXN6-204ENST00000587324 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa41.2■■■■■ 4.19
UBXN6-204ENST00000587324 DNAJC5BQ9UF47 199 aa41.11■■■■■ 4.17
UBXN6-204ENST00000587324 NACADO15069 1562 aa40.84■■■■■ 4.13
UBXN6-204ENST00000587324 UNC13AQ9UPW8 1703 aa40.51■■■■■ 4.08
UBXN6-204ENST00000587324 DCAF8L2P0C7V8 631 aa40.39■■■■■ 4.06
UBXN6-204ENST00000587324 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP40.37■■■■■ 4.05
UBXN6-204ENST00000587324 MYO15BQ96JP2 1530 aa40.17■■■■■ 4.02
UBXN6-204ENST00000587324 BICRAQ9NZM4 1560 aa40.17■■■■■ 4.02
UBXN6-204ENST00000587324 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP39.69■■■■□ 3.94
UBXN6-204ENST00000587324 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa39.55■■■■□ 3.92
UBXN6-204ENST00000587324 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa39.43■■■■□ 3.9
UBXN6-204ENST00000587324 SCRIBQ14160 1630 aa39.36■■■■□ 3.89
UBXN6-204ENST00000587324 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa39.31■■■■□ 3.88
UBXN6-204ENST00000587324 CECR2Q9BXF3 1484 aa39.17■■■■□ 3.86
UBXN6-204ENST00000587324 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP39.13■■■■□ 3.85
UBXN6-204ENST00000587324 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa37.87■■■■□ 3.65
UBXN6-204ENST00000587324 NCAPD3P42695 1498 aa37.7■■■■□ 3.63
UBXN6-204ENST00000587324 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa37.58■■■■□ 3.61
UBXN6-204ENST00000587324 CUX2O14529 1486 aa37.57■■■■□ 3.6
UBXN6-204ENST00000587324 SMARCA4P51532 1647 aa37.52■■■■□ 3.6
UBXN6-204ENST00000587324 ERCC6Q03468 1493 aa37.48■■■■□ 3.59
UBXN6-204ENST00000587324 HMGXB3Q12766 1538 aa37.45■■■■□ 3.59
UBXN6-204ENST00000587324 SMARCA2P51531 1590 aa37.42■■■■□ 3.58
UBXN6-204ENST00000587324 NESP48681 1621 aa37.32■■■■□ 3.56
UBXN6-204ENST00000587324 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP37.2■■■■□ 3.55
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UBXN6-204ENST00000587324 PEG3Q9GZU2 1588 aa37.14■■■■□ 3.54
UBXN6-204ENST00000587324 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP37.06■■■■□ 3.52
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UBXN6-204ENST00000587324 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa36.92■■■■□ 3.5
UBXN6-204ENST00000587324 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa36.9■■■■□ 3.5
UBXN6-204ENST00000587324 PDS5BQ9NTI5 1447 aa36.62■■■■□ 3.45
UBXN6-204ENST00000587324 WIZO95785 1651 aa36.54■■■■□ 3.44
UBXN6-204ENST00000587324 CADPSQ9ULU8 1353 aa36.5■■■■□ 3.43
UBXN6-204ENST00000587324 MRC2Q9UBG0 1479 aa36.43■■■■□ 3.42
UBXN6-204ENST00000587324 WDR62O43379 1518 aa36.4■■■■□ 3.42
UBXN6-204ENST00000587324 CEP164Q9UPV0 1460 aa36.19■■■■□ 3.38
UBXN6-204ENST00000587324 FANCD2Q9BXW9 1451 aa36.14■■■■□ 3.38
UBXN6-204ENST00000587324 CFTRP13569 1480 aa36.07■■■■□ 3.37
UBXN6-204ENST00000587324 TRIM41Q8WV44 630 aa36.06■■■■□ 3.36
UBXN6-204ENST00000587324 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP36.03■■■■□ 3.36
UBXN6-204ENST00000587324 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP36■■■■□ 3.35
UBXN6-204ENST00000587324 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP35.94■■■■□ 3.34
UBXN6-204ENST00000587324 PRDM2Q13029 1718 aa35.83■■■■□ 3.33
UBXN6-204ENST00000587324 OSCARQ8IYS5 282 aa35.66■■■■□ 3.3
UBXN6-204ENST00000587324 CCDC88BA6NC98 1476 aa35.58■■■■□ 3.29
UBXN6-204ENST00000587324 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP35.55■■■■□ 3.28
UBXN6-204ENST00000587324 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa35.47■■■■□ 3.27
UBXN6-204ENST00000587324 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa35.47■■■■□ 3.27
UBXN6-204ENST00000587324 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa35.47■■■■□ 3.27
UBXN6-204ENST00000587324 IFT140Q96RY7 1462 aa35.47■■■■□ 3.27
UBXN6-204ENST00000587324 TOPBP1Q92547 1522 aa35.46■■■■□ 3.27
UBXN6-204ENST00000587324 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP35.36■■■■□ 3.25
UBXN6-204ENST00000587324 DNMBPQ6XZF7 1577 aa35.3■■■■□ 3.24
UBXN6-204ENST00000587324 ARHGEF11O15085 1522 aa35.28■■■■□ 3.24
UBXN6-204ENST00000587324 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP35.23■■■■□ 3.23
UBXN6-204ENST00000587324 ABCC8Q09428 1581 aa35.21■■■■□ 3.23
UBXN6-204ENST00000587324 CHD1O14646 1710 aa35.2■■■■□ 3.23
UBXN6-204ENST00000587324 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP35.12■■■■□ 3.212e-6■■■□□ 18.3
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UBXN6-204ENST00000587324 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa34.96■■■■□ 3.19
UBXN6-204ENST00000587324 ARAP1Q96P48 1450 aa34.95■■■■□ 3.19
UBXN6-204ENST00000587324 CYB5RLQ6IPT4 315 aa34.9■■■■□ 3.18
UBXN6-204ENST00000587324 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP34.82■■■■□ 3.16
UBXN6-204ENST00000587324 FBLN2P98095 1184 aa34.81■■■■□ 3.16
UBXN6-204ENST00000587324 SOGA1O94964 1423 aa34.81■■■■□ 3.16
UBXN6-204ENST00000587324 FGD5Q6ZNL6 1462 aa34.8■■■■□ 3.16
UBXN6-204ENST00000587324 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa34.78■■■■□ 3.16
UBXN6-204ENST00000587324 CUX1P39880 1505 aa34.76■■■■□ 3.16
UBXN6-204ENST00000587324 WDR97A6NE52 1622 aa34.75■■■■□ 3.15
UBXN6-204ENST00000587324 CLASP1Q7Z460 1538 aa34.75■■■■□ 3.15
UBXN6-204ENST00000587324 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP34.62■■■■□ 3.13
UBXN6-204ENST00000587324 SYNJ1O43426 1573 aa34.59■■■■□ 3.13
UBXN6-204ENST00000587324 GRIN2BQ13224 1484 aa34.58■■■■□ 3.13
UBXN6-204ENST00000587324 PBRM1Q86U86 1689 aa34.57■■■■□ 3.13
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UBXN6-204ENST00000587324 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP34.49■■■■□ 3.11
UBXN6-204ENST00000587324 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa34.44■■■■□ 3.1
UBXN6-204ENST00000587324 GAPVD1Q14C86 1478 aa34.42■■■■□ 3.1
UBXN6-204ENST00000587324 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa34.37■■■■□ 3.09
UBXN6-204ENST00000587324 ERCC6L2Q5T890 1561 aa34.23■■■■□ 3.07
UBXN6-204ENST00000587324 ADAMTS12P58397 1594 aa34.19■■■■□ 3.06
UBXN6-204ENST00000587324 GRIN2AQ12879 1464 aa34.17■■■■□ 3.06
UBXN6-204ENST00000587324 CEP170Q5SW79 1584 aa34.15■■■■□ 3.06
UBXN6-204ENST00000587324 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa34.14■■■■□ 3.06
UBXN6-204ENST00000587324 TOP2BQ02880 1626 aa34.09■■■■□ 3.05
UBXN6-204ENST00000587324 NUP160Q12769 1436 aa34.09■■■■□ 3.05
UBXN6-204ENST00000587324 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP34.07■■■■□ 3.04
UBXN6-204ENST00000587324 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP34.06■■■■□ 3.04
UBXN6-204ENST00000587324 SHROOM2Q13796 1616 aa34.04■■■■□ 3.04
UBXN6-204ENST00000587324 FHAD1B1AJZ9 1412 aa33.95■■■■□ 3.02
UBXN6-204ENST00000587324 ERICH3Q5RHP9 1530 aa33.92■■■■□ 3.02
UBXN6-204ENST00000587324 KIF13AQ9H1H9 1805 aa33.83■■■■□ 3.01
UBXN6-204ENST00000587324 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP33.74■■■□□ 2.99
UBXN6-204ENST00000587324 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa33.73■■■□□ 2.99
UBXN6-204ENST00000587324 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP33.72■■■□□ 2.99
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