RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000585913.5

CIRBP-205, Transcript of cold inducible RNA binding protein, humanhuman

TSL 3

Gene CIRBP, Length 833 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIRBP-205ENST00000585913 NISCHQ9Y2I1 1504 aa53.41■■■■■ 6.14
CIRBP-205ENST00000585913 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa47.75■■■■■ 5.23
CIRBP-205ENST00000585913 ABCC9O60706 1549 aa47.19■■■■■ 5.14
CIRBP-205ENST00000585913 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa45.19■■■■■ 4.82
CIRBP-205ENST00000585913 NACADO15069 1562 aa44.99■■■■■ 4.79
CIRBP-205ENST00000585913 DCAF8L2P0C7V8 631 aa44.86■■■■■ 4.77
CIRBP-205ENST00000585913 MYO15BQ96JP2 1530 aa44.54■■■■■ 4.72
CIRBP-205ENST00000585913 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP44.4■■■■■ 4.7
CIRBP-205ENST00000585913 DNAJC5BQ9UF47 199 aa44.35■■■■■ 4.69
CIRBP-205ENST00000585913 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa44.16■■■■■ 4.66
CIRBP-205ENST00000585913 UNC13AQ9UPW8 1703 aa44.16■■■■■ 4.66
CIRBP-205ENST00000585913 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP43.98■■■■■ 4.631e-14■■□□□ 14.3
CIRBP-205ENST00000585913 BICRAQ9NZM4 1560 aa43.8■■■■■ 4.6
CIRBP-205ENST00000585913 SCRIBQ14160 1630 aa43.53■■■■■ 4.56
CIRBP-205ENST00000585913 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa43.32■■■■■ 4.52
CIRBP-205ENST00000585913 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP42.71■■■■■ 4.43
CIRBP-205ENST00000585913 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa42.67■■■■■ 4.42
CIRBP-205ENST00000585913 CECR2Q9BXF3 1484 aa42.45■■■■■ 4.39
CIRBP-205ENST00000585913 SMARCA4P51532 1647 aa41.58■■■■■ 4.25
CIRBP-205ENST00000585913 NCAPD3P42695 1498 aa41.49■■■■■ 4.23
CIRBP-205ENST00000585913 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP41.46■■■■■ 4.23
CIRBP-205ENST00000585913 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa41.45■■■■■ 4.23
CIRBP-205ENST00000585913 SMARCA2P51531 1590 aa41.41■■■■■ 4.22
CIRBP-205ENST00000585913 HMGXB3Q12766 1538 aa41.28■■■■■ 4.2
CIRBP-205ENST00000585913 MROH2BQ7Z745 1585 aa41.16■■■■■ 4.18
CIRBP-205ENST00000585913 PEG3Q9GZU2 1588 aa41.16■■■■■ 4.18
CIRBP-205ENST00000585913 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP41.12■■■■■ 4.17
CIRBP-205ENST00000585913 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa40.86■■■■■ 4.13
CIRBP-205ENST00000585913 ERCC6Q03468 1493 aa40.75■■■■■ 4.11
CIRBP-205ENST00000585913 WIZO95785 1651 aa40.71■■■■■ 4.11
CIRBP-205ENST00000585913 NESP48681 1621 aa40.67■■■■■ 4.1
CIRBP-205ENST00000585913 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa40.52■■■■■ 4.08
CIRBP-205ENST00000585913 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP40.49■■■■■ 4.07
CIRBP-205ENST00000585913 CUX2O14529 1486 aa40.47■■■■■ 4.07
CIRBP-205ENST00000585913 CADPSQ9ULU8 1353 aa40.26■■■■■ 4.04
CIRBP-205ENST00000585913 PDS5BQ9NTI5 1447 aa40.25■■■■■ 4.03
CIRBP-205ENST00000585913 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP40.25■■■■■ 4.03
CIRBP-205ENST00000585913 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa40.21■■■■■ 4.03
CIRBP-205ENST00000585913 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP40.19■■■■■ 4.02
CIRBP-205ENST00000585913 CFTRP13569 1480 aa39.92■■■■□ 3.98
CIRBP-205ENST00000585913 MRC2Q9UBG0 1479 aa39.88■■■■□ 3.97
CIRBP-205ENST00000585913 CEP164Q9UPV0 1460 aa39.85■■■■□ 3.97
CIRBP-205ENST00000585913 FANCD2Q9BXW9 1451 aa39.83■■■■□ 3.97
CIRBP-205ENST00000585913 WDR62O43379 1518 aa39.76■■■■□ 3.96
CIRBP-205ENST00000585913 CCDC88BA6NC98 1476 aa39.75■■■■□ 3.95
CIRBP-205ENST00000585913 PRDM2Q13029 1718 aa39.65■■■■□ 3.94
CIRBP-205ENST00000585913 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP39.45■■■■□ 3.91
CIRBP-205ENST00000585913 TOPBP1Q92547 1522 aa39.14■■■■□ 3.86
CIRBP-205ENST00000585913 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP39.11■■■■□ 3.85
CIRBP-205ENST00000585913 ABCC8Q09428 1581 aa39.11■■■■□ 3.85
CIRBP-205ENST00000585913 DNMBPQ6XZF7 1577 aa39.06■■■■□ 3.84
CIRBP-205ENST00000585913 IFT140Q96RY7 1462 aa39.01■■■■□ 3.84
CIRBP-205ENST00000585913 TRIM41Q8WV44 630 aa38.97■■■■□ 3.83
CIRBP-205ENST00000585913 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP38.87■■■■□ 3.81
CIRBP-205ENST00000585913 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP38.76■■■■□ 3.8
CIRBP-205ENST00000585913 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP38.74■■■■□ 3.79
CIRBP-205ENST00000585913 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP38.74■■■■□ 3.79
CIRBP-205ENST00000585913 OSCARQ8IYS5 282 aa38.68■■■■□ 3.78
CIRBP-205ENST00000585913 CUX1P39880 1505 aa38.64■■■■□ 3.78
CIRBP-205ENST00000585913 FGD5Q6ZNL6 1462 aa38.6■■■■□ 3.77
CIRBP-205ENST00000585913 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa38.6■■■■□ 3.77
CIRBP-205ENST00000585913 SOGA1O94964 1423 aa38.59■■■■□ 3.77
CIRBP-205ENST00000585913 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP38.58■■■■□ 3.772e-10■■■■■ 31.7
CIRBP-205ENST00000585913 WDR97A6NE52 1622 aa38.43■■■■□ 3.74
CIRBP-205ENST00000585913 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP38.43■■■■□ 3.74
CIRBP-205ENST00000585913 CHD1O14646 1710 aa38.35■■■■□ 3.73
CIRBP-205ENST00000585913 FBLN2P98095 1184 aa38.25■■■■□ 3.71
CIRBP-205ENST00000585913 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa38.24■■■■□ 3.71
CIRBP-205ENST00000585913 GRIN2BQ13224 1484 aa38.22■■■■□ 3.71
CIRBP-205ENST00000585913 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP38.21■■■■□ 3.711e-6■■■■■ 58.5
CIRBP-205ENST00000585913 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa38.2■■■■□ 3.71
CIRBP-205ENST00000585913 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa38.19■■■■□ 3.7
CIRBP-205ENST00000585913 TOP2BQ02880 1626 aa38.19■■■■□ 3.7
CIRBP-205ENST00000585913 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP38.17■■■■□ 3.7
CIRBP-205ENST00000585913 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa38.16■■■■□ 3.7
CIRBP-205ENST00000585913 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa38.16■■■■□ 3.7
CIRBP-205ENST00000585913 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa38.16■■■■□ 3.7
CIRBP-205ENST00000585913 GAPVD1Q14C86 1478 aa38.15■■■■□ 3.7
CIRBP-205ENST00000585913 SYNJ1O43426 1573 aa38.14■■■■□ 3.7
CIRBP-205ENST00000585913 PBRM1Q86U86 1689 aa38.14■■■■□ 3.7
CIRBP-205ENST00000585913 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa38.1■■■■□ 3.69
CIRBP-205ENST00000585913 ARHGEF11O15085 1522 aa38.08■■■■□ 3.69
CIRBP-205ENST00000585913 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP38.06■■■■□ 3.68
CIRBP-205ENST00000585913 SYNJ2O15056 1496 aa38.03■■■■□ 3.68
CIRBP-205ENST00000585913 CLASP1Q7Z460 1538 aa37.89■■■■□ 3.66
CIRBP-205ENST00000585913 ADAMTS12P58397 1594 aa37.79■■■■□ 3.64
CIRBP-205ENST00000585913 CYB5RLQ6IPT4 315 aa37.76■■■■□ 3.64
CIRBP-205ENST00000585913 ERICH3Q5RHP9 1530 aa37.74■■■■□ 3.63
CIRBP-205ENST00000585913 ARAP1Q96P48 1450 aa37.73■■■■□ 3.63
CIRBP-205ENST00000585913 GRIN2AQ12879 1464 aa37.72■■■■□ 3.63
CIRBP-205ENST00000585913 FHAD1B1AJZ9 1412 aa37.69■■■■□ 3.62
CIRBP-205ENST00000585913 CEP170Q5SW79 1584 aa37.56■■■■□ 3.6
CIRBP-205ENST00000585913 NUP160Q12769 1436 aa37.56■■■■□ 3.6
CIRBP-205ENST00000585913 KIF27Q86VH2 1401 aa37.46■■■■□ 3.59
CIRBP-205ENST00000585913 TRHP20396 242 aaPredicted RBP37.41■■■■□ 3.58
CIRBP-205ENST00000585913 SHROOM2Q13796 1616 aa37.35■■■■□ 3.57
CIRBP-205ENST00000585913 CUL7Q14999 1698 aa37.33■■■■□ 3.57
CIRBP-205ENST00000585913 IGF1RP08069 1367 aa37.32■■■■□ 3.57
CIRBP-205ENST00000585913 ERCC6L2Q5T890 1561 aa37.32■■■■□ 3.56
CIRBP-205ENST00000585913 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa37.25■■■■□ 3.55
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