RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000582315.5

HEXDC-211, Transcript of hexosaminidase D, humanhuman

TSL 5

Gene HEXDC, Length 873 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HEXDC-211ENST00000582315 NISCHQ9Y2I1 1504 aa59.91■■■■■ 7.18
HEXDC-211ENST00000582315 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa53.5■■■■■ 6.15
HEXDC-211ENST00000582315 ABCC9O60706 1549 aa52.97■■■■■ 6.07
HEXDC-211ENST00000582315 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa50.65■■■■■ 5.7
HEXDC-211ENST00000582315 DCAF8L2P0C7V8 631 aa50.49■■■■■ 5.67
HEXDC-211ENST00000582315 NACADO15069 1562 aa50.42■■■■■ 5.66
HEXDC-211ENST00000582315 MYO15BQ96JP2 1530 aa49.85■■■■■ 5.57
HEXDC-211ENST00000582315 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP49.79■■■■■ 5.56
HEXDC-211ENST00000582315 UNC13AQ9UPW8 1703 aa49.51■■■■■ 5.52
HEXDC-211ENST00000582315 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa49.46■■■■■ 5.51
HEXDC-211ENST00000582315 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP49.44■■■■■ 5.51
HEXDC-211ENST00000582315 BICRAQ9NZM4 1560 aa49.1■■■■■ 5.45
HEXDC-211ENST00000582315 DNAJC5BQ9UF47 199 aa49.06■■■■■ 5.44
HEXDC-211ENST00000582315 SCRIBQ14160 1630 aa48.89■■■■■ 5.42
HEXDC-211ENST00000582315 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa48.47■■■■■ 5.35
HEXDC-211ENST00000582315 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP47.89■■■■■ 5.26
HEXDC-211ENST00000582315 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa47.85■■■■■ 5.25
HEXDC-211ENST00000582315 CECR2Q9BXF3 1484 aa47.63■■■■■ 5.22
HEXDC-211ENST00000582315 SMARCA4P51532 1647 aa46.64■■■■■ 5.06
HEXDC-211ENST00000582315 NCAPD3P42695 1498 aa46.51■■■■■ 5.04
HEXDC-211ENST00000582315 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa46.5■■■■■ 5.03
HEXDC-211ENST00000582315 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP46.49■■■■■ 5.03
HEXDC-211ENST00000582315 SMARCA2P51531 1590 aa46.42■■■■■ 5.02
HEXDC-211ENST00000582315 HMGXB3Q12766 1538 aa46.25■■■■■ 4.99
HEXDC-211ENST00000582315 MROH2BQ7Z745 1585 aa46.2■■■■■ 4.99
HEXDC-211ENST00000582315 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP46.14■■■■■ 4.98
HEXDC-211ENST00000582315 PEG3Q9GZU2 1588 aa46.1■■■■■ 4.97
HEXDC-211ENST00000582315 ERCC6Q03468 1493 aa45.73■■■■■ 4.91
HEXDC-211ENST00000582315 WIZO95785 1651 aa45.71■■■■■ 4.91
HEXDC-211ENST00000582315 NESP48681 1621 aa45.66■■■■■ 4.9
HEXDC-211ENST00000582315 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP45.45■■■■■ 4.87
HEXDC-211ENST00000582315 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa45.41■■■■■ 4.86
HEXDC-211ENST00000582315 CUX2O14529 1486 aa45.33■■■■■ 4.85
HEXDC-211ENST00000582315 CADPSQ9ULU8 1353 aa45.18■■■■■ 4.82
HEXDC-211ENST00000582315 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP45.16■■■■■ 4.82
HEXDC-211ENST00000582315 PDS5BQ9NTI5 1447 aa45.15■■■■■ 4.82
HEXDC-211ENST00000582315 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa45.11■■■■■ 4.81
HEXDC-211ENST00000582315 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP45.04■■■■■ 4.8
HEXDC-211ENST00000582315 CFTRP13569 1480 aa44.77■■■■■ 4.76
HEXDC-211ENST00000582315 MRC2Q9UBG0 1479 aa44.72■■■■■ 4.75
HEXDC-211ENST00000582315 FANCD2Q9BXW9 1451 aa44.69■■■■■ 4.74
HEXDC-211ENST00000582315 CEP164Q9UPV0 1460 aa44.69■■■■■ 4.74
HEXDC-211ENST00000582315 CCDC88BA6NC98 1476 aa44.64■■■■■ 4.74
HEXDC-211ENST00000582315 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa44.58■■■■■ 4.73
HEXDC-211ENST00000582315 WDR62O43379 1518 aa44.57■■■■■ 4.73
HEXDC-211ENST00000582315 PRDM2Q13029 1718 aa44.42■■■■■ 4.7
HEXDC-211ENST00000582315 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP44.26■■■■■ 4.68
HEXDC-211ENST00000582315 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP44.07■■■■■ 4.65
HEXDC-211ENST00000582315 TOPBP1Q92547 1522 aa43.9■■■■■ 4.62
HEXDC-211ENST00000582315 ABCC8Q09428 1581 aa43.82■■■■■ 4.61
HEXDC-211ENST00000582315 DNMBPQ6XZF7 1577 aa43.8■■■■■ 4.6
HEXDC-211ENST00000582315 IFT140Q96RY7 1462 aa43.76■■■■■ 4.6
HEXDC-211ENST00000582315 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP43.63■■■■■ 4.58
HEXDC-211ENST00000582315 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP43.5■■■■■ 4.55
HEXDC-211ENST00000582315 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP43.44■■■■■ 4.54
HEXDC-211ENST00000582315 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP43.44■■■■■ 4.54
HEXDC-211ENST00000582315 OSCARQ8IYS5 282 aa43.41■■■■■ 4.54
HEXDC-211ENST00000582315 CUX1P39880 1505 aa43.38■■■■■ 4.53
HEXDC-211ENST00000582315 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa43.36■■■■■ 4.53
HEXDC-211ENST00000582315 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP43.34■■■■■ 4.533e-13■■■■■ 36.3
HEXDC-211ENST00000582315 FGD5Q6ZNL6 1462 aa43.34■■■■■ 4.53
HEXDC-211ENST00000582315 SOGA1O94964 1423 aa43.32■■■■■ 4.53
HEXDC-211ENST00000582315 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP43.17■■■■■ 4.5
HEXDC-211ENST00000582315 TRIM41Q8WV44 630 aa43.05■■■■■ 4.48
HEXDC-211ENST00000582315 WDR97A6NE52 1622 aa43.02■■■■■ 4.48
HEXDC-211ENST00000582315 FBLN2P98095 1184 aa43.02■■■■■ 4.48
HEXDC-211ENST00000582315 CHD1O14646 1710 aa43.02■■■■■ 4.48
HEXDC-211ENST00000582315 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa42.93■■■■■ 4.46
HEXDC-211ENST00000582315 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP42.91■■■■■ 4.46
HEXDC-211ENST00000582315 GRIN2BQ13224 1484 aa42.87■■■■■ 4.45
HEXDC-211ENST00000582315 SYNJ1O43426 1573 aa42.84■■■■■ 4.45
HEXDC-211ENST00000582315 TOP2BQ02880 1626 aa42.84■■■■■ 4.45
HEXDC-211ENST00000582315 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa42.84■■■■■ 4.45
HEXDC-211ENST00000582315 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa42.84■■■■■ 4.45
HEXDC-211ENST00000582315 GAPVD1Q14C86 1478 aa42.81■■■■■ 4.44
HEXDC-211ENST00000582315 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP42.8■■■■■ 4.44
HEXDC-211ENST00000582315 PBRM1Q86U86 1689 aa42.78■■■■■ 4.44
HEXDC-211ENST00000582315 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa42.78■■■■■ 4.44
HEXDC-211ENST00000582315 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa42.78■■■■■ 4.44
HEXDC-211ENST00000582315 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa42.78■■■■■ 4.44
HEXDC-211ENST00000582315 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP42.76■■■■■ 4.44
HEXDC-211ENST00000582315 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa42.73■■■■■ 4.43
HEXDC-211ENST00000582315 ARHGEF11O15085 1522 aa42.7■■■■■ 4.43
HEXDC-211ENST00000582315 SYNJ2O15056 1496 aa42.65■■■■■ 4.42
HEXDC-211ENST00000582315 CLASP1Q7Z460 1538 aa42.47■■■■■ 4.39
HEXDC-211ENST00000582315 CYB5RLQ6IPT4 315 aa42.39■■■■■ 4.38
HEXDC-211ENST00000582315 ADAMTS12P58397 1594 aa42.39■■■■■ 4.38
HEXDC-211ENST00000582315 ERICH3Q5RHP9 1530 aa42.32■■■■■ 4.37
HEXDC-211ENST00000582315 GRIN2AQ12879 1464 aa42.32■■■■■ 4.37
HEXDC-211ENST00000582315 ARAP1Q96P48 1450 aa42.31■■■■■ 4.36
HEXDC-211ENST00000582315 FHAD1B1AJZ9 1412 aa42.28■■■■■ 4.36
HEXDC-211ENST00000582315 CEP170Q5SW79 1584 aa42.14■■■■■ 4.34
HEXDC-211ENST00000582315 NUP160Q12769 1436 aa42.12■■■■■ 4.33
HEXDC-211ENST00000582315 KIF27Q86VH2 1401 aa42.05■■■■■ 4.32
HEXDC-211ENST00000582315 IGF1RP08069 1367 aa41.91■■■■■ 4.3
HEXDC-211ENST00000582315 ERCC6L2Q5T890 1561 aa41.9■■■■■ 4.3
HEXDC-211ENST00000582315 CUL7Q14999 1698 aa41.86■■■■■ 4.29
HEXDC-211ENST00000582315 SHROOM2Q13796 1616 aa41.85■■■■■ 4.29
HEXDC-211ENST00000582315 TRHP20396 242 aaPredicted RBP41.78■■■■■ 4.28
HEXDC-211ENST00000582315 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa41.77■■■■■ 4.28
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