RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580445.5

OGFOD3-208, Transcript of 2-oxoglutarate and iron dependent oxygenase domain containing 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene OGFOD3, Length 1,274 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OGFOD3-208ENST00000580445 NISCHQ9Y2I1 1504 aa53.04■■■■■ 6.08
OGFOD3-208ENST00000580445 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa47.48■■■■■ 5.19
OGFOD3-208ENST00000580445 ABCC9O60706 1549 aa47.04■■■■■ 5.12
OGFOD3-208ENST00000580445 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa44.95■■■■■ 4.79
OGFOD3-208ENST00000580445 NACADO15069 1562 aa44.72■■■■■ 4.75
OGFOD3-208ENST00000580445 DCAF8L2P0C7V8 631 aa44.59■■■■■ 4.73
OGFOD3-208ENST00000580445 MYO15BQ96JP2 1530 aa44.19■■■■■ 4.66
OGFOD3-208ENST00000580445 UNC13AQ9UPW8 1703 aa44.1■■■■■ 4.65
OGFOD3-208ENST00000580445 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP44.06■■■■■ 4.64
OGFOD3-208ENST00000580445 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP43.81■■■■■ 4.6
OGFOD3-208ENST00000580445 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa43.8■■■■■ 4.6
OGFOD3-208ENST00000580445 DNAJC5BQ9UF47 199 aa43.65■■■■■ 4.58
OGFOD3-208ENST00000580445 BICRAQ9NZM4 1560 aa43.63■■■■■ 4.58
OGFOD3-208ENST00000580445 SCRIBQ14160 1630 aa43.33■■■■■ 4.53
OGFOD3-208ENST00000580445 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa43.01■■■■■ 4.48
OGFOD3-208ENST00000580445 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa42.53■■■■■ 4.4
OGFOD3-208ENST00000580445 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP42.53■■■■■ 4.4
OGFOD3-208ENST00000580445 CECR2Q9BXF3 1484 aa42.29■■■■■ 4.36
OGFOD3-208ENST00000580445 SMARCA4P51532 1647 aa41.34■■■■■ 4.21
OGFOD3-208ENST00000580445 NCAPD3P42695 1498 aa41.22■■■■■ 4.19
OGFOD3-208ENST00000580445 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa41.2■■■■■ 4.19
OGFOD3-208ENST00000580445 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP41.16■■■■■ 4.18
OGFOD3-208ENST00000580445 SMARCA2P51531 1590 aa41.13■■■■■ 4.18
OGFOD3-208ENST00000580445 HMGXB3Q12766 1538 aa41.03■■■■■ 4.16
OGFOD3-208ENST00000580445 MROH2BQ7Z745 1585 aa40.9■■■■■ 4.14
OGFOD3-208ENST00000580445 PEG3Q9GZU2 1588 aa40.88■■■■■ 4.13
OGFOD3-208ENST00000580445 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP40.86■■■■■ 4.13
OGFOD3-208ENST00000580445 ERCC6Q03468 1493 aa40.58■■■■■ 4.09
OGFOD3-208ENST00000580445 NESP48681 1621 aa40.53■■■■■ 4.08
OGFOD3-208ENST00000580445 WIZO95785 1651 aa40.5■■■■■ 4.07
OGFOD3-208ENST00000580445 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa40.31■■■■■ 4.04
OGFOD3-208ENST00000580445 CUX2O14529 1486 aa40.31■■■■■ 4.04
OGFOD3-208ENST00000580445 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP40.16■■■■■ 4.02
OGFOD3-208ENST00000580445 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa40.13■■■■■ 4.01
OGFOD3-208ENST00000580445 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP40.07■■■■■ 4.01
OGFOD3-208ENST00000580445 PDS5BQ9NTI5 1447 aa40■■■■□ 3.99
OGFOD3-208ENST00000580445 CADPSQ9ULU8 1353 aa40■■■■□ 3.99
OGFOD3-208ENST00000580445 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP39.96■■■■□ 3.99
OGFOD3-208ENST00000580445 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa39.74■■■■□ 3.95
OGFOD3-208ENST00000580445 MRC2Q9UBG0 1479 aa39.67■■■■□ 3.94
OGFOD3-208ENST00000580445 CFTRP13569 1480 aa39.65■■■■□ 3.94
OGFOD3-208ENST00000580445 CEP164Q9UPV0 1460 aa39.62■■■■□ 3.93
OGFOD3-208ENST00000580445 FANCD2Q9BXW9 1451 aa39.6■■■■□ 3.93
OGFOD3-208ENST00000580445 WDR62O43379 1518 aa39.57■■■■□ 3.93
OGFOD3-208ENST00000580445 PRDM2Q13029 1718 aa39.5■■■■□ 3.91
OGFOD3-208ENST00000580445 CCDC88BA6NC98 1476 aa39.48■■■■□ 3.91
OGFOD3-208ENST00000580445 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP39.26■■■■□ 3.88
OGFOD3-208ENST00000580445 TOPBP1Q92547 1522 aa38.91■■■■□ 3.82
OGFOD3-208ENST00000580445 DNMBPQ6XZF7 1577 aa38.82■■■■□ 3.81
OGFOD3-208ENST00000580445 ABCC8Q09428 1581 aa38.8■■■■□ 3.8
OGFOD3-208ENST00000580445 IFT140Q96RY7 1462 aa38.77■■■■□ 3.8
OGFOD3-208ENST00000580445 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP38.75■■■■□ 3.79
OGFOD3-208ENST00000580445 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP38.71■■■■□ 3.79
OGFOD3-208ENST00000580445 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP38.58■■■■□ 3.77
OGFOD3-208ENST00000580445 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP38.56■■■■□ 3.76
OGFOD3-208ENST00000580445 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP38.54■■■■□ 3.76
OGFOD3-208ENST00000580445 OSCARQ8IYS5 282 aa38.5■■■■□ 3.75
OGFOD3-208ENST00000580445 CUX1P39880 1505 aa38.41■■■■□ 3.74
OGFOD3-208ENST00000580445 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa38.4■■■■□ 3.74
OGFOD3-208ENST00000580445 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP38.39■■■■□ 3.74
OGFOD3-208ENST00000580445 FGD5Q6ZNL6 1462 aa38.37■■■■□ 3.73
OGFOD3-208ENST00000580445 SOGA1O94964 1423 aa38.34■■■■□ 3.73
OGFOD3-208ENST00000580445 CHD1O14646 1710 aa38.27■■■■□ 3.72
OGFOD3-208ENST00000580445 TRIM41Q8WV44 630 aa38.27■■■■□ 3.72
OGFOD3-208ENST00000580445 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP38.21■■■■□ 3.71
OGFOD3-208ENST00000580445 WDR97A6NE52 1622 aa38.16■■■■□ 3.7
OGFOD3-208ENST00000580445 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa38.09■■■■□ 3.69
OGFOD3-208ENST00000580445 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa38.09■■■■□ 3.69
OGFOD3-208ENST00000580445 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa38.09■■■■□ 3.69
OGFOD3-208ENST00000580445 FBLN2P98095 1184 aa38.06■■■■□ 3.68
OGFOD3-208ENST00000580445 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa38.04■■■■□ 3.68
OGFOD3-208ENST00000580445 PBRM1Q86U86 1689 aa38■■■■□ 3.67
OGFOD3-208ENST00000580445 ARHGEF11O15085 1522 aa37.97■■■■□ 3.67
OGFOD3-208ENST00000580445 GRIN2BQ13224 1484 aa37.96■■■■□ 3.67
OGFOD3-208ENST00000580445 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa37.96■■■■□ 3.67
OGFOD3-208ENST00000580445 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP37.93■■■■□ 3.66
OGFOD3-208ENST00000580445 TOP2BQ02880 1626 aa37.93■■■■□ 3.66
OGFOD3-208ENST00000580445 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa37.92■■■■□ 3.66
OGFOD3-208ENST00000580445 SYNJ1O43426 1573 aa37.92■■■■□ 3.66
OGFOD3-208ENST00000580445 GAPVD1Q14C86 1478 aa37.9■■■■□ 3.66
OGFOD3-208ENST00000580445 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP37.9■■■■□ 3.66
OGFOD3-208ENST00000580445 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa37.9■■■■□ 3.66
OGFOD3-208ENST00000580445 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP37.81■■■■□ 3.64
OGFOD3-208ENST00000580445 SYNJ2O15056 1496 aa37.79■■■■□ 3.64
OGFOD3-208ENST00000580445 CLASP1Q7Z460 1538 aa37.73■■■■□ 3.63
OGFOD3-208ENST00000580445 ARAP1Q96P48 1450 aa37.62■■■■□ 3.61
OGFOD3-208ENST00000580445 CYB5RLQ6IPT4 315 aa37.61■■■■□ 3.61
OGFOD3-208ENST00000580445 ADAMTS12P58397 1594 aa37.59■■■■□ 3.61
OGFOD3-208ENST00000580445 GRIN2AQ12879 1464 aa37.5■■■■□ 3.59
OGFOD3-208ENST00000580445 ERICH3Q5RHP9 1530 aa37.47■■■■□ 3.59
OGFOD3-208ENST00000580445 FHAD1B1AJZ9 1412 aa37.41■■■■□ 3.58
OGFOD3-208ENST00000580445 CEP170Q5SW79 1584 aa37.38■■■■□ 3.58
OGFOD3-208ENST00000580445 NUP160Q12769 1436 aa37.32■■■■□ 3.56
OGFOD3-208ENST00000580445 ERCC6L2Q5T890 1561 aa37.21■■■■□ 3.55
OGFOD3-208ENST00000580445 SHROOM2Q13796 1616 aa37.18■■■■□ 3.54
OGFOD3-208ENST00000580445 KIF27Q86VH2 1401 aa37.13■■■■□ 3.53
OGFOD3-208ENST00000580445 TRHP20396 242 aaPredicted RBP37.08■■■■□ 3.53
OGFOD3-208ENST00000580445 CUL7Q14999 1698 aa37.08■■■■□ 3.53
OGFOD3-208ENST00000580445 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa37.05■■■■□ 3.52
OGFOD3-208ENST00000580445 IGF1RP08069 1367 aa37.04■■■■□ 3.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.7 ms